183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1213 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1213  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  174  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0796796  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3414  transposase IS3/IS911 family protein  74.19 
 
 
91 aa  99  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4909  transposase IS3/IS911 family protein  61.02 
 
 
92 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5068  transposase IS3/IS911 family protein  62.71 
 
 
92 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858829  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_64  transposase IS3/IS911-family  58.49 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1332  transposase IS3/IS911-family  58.49 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_89  transposase IS3/IS911-family  58.49 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_777  transposase IS3/IS911-family  58.49 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1291  transposase IS3/IS911 family protein  48.39 
 
 
83 aa  71.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1309  transposase IS3/IS911-family  58.49 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3583  transposase IS3/IS911 family protein  46.77 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7865  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2016  transposase IS3/IS911 family protein  46.77 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2882  transposase IS3/IS911 family protein  57.41 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935915  normal  0.211621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  46.77 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  46.77 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  46.77 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  46.77 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  46.77 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  48.33 
 
 
91 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3515  hypothetical protein  50 
 
 
71 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1826  transposase IS3/IS911 family protein  44.26 
 
 
99 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3556  hypothetical protein  44.26 
 
 
99 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1168  transposase and inactivated derivative  49.15 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0797  transposase IS3/IS911 family protein  44.26 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1010  hypothetical protein  46.55 
 
 
89 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1508  ISDet3, transposase orfA  38.71 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0116  transposase IS3/IS911 family protein  38.71 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0272  transposase IS3/IS911 family protein  38.71 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0288  transposase IS3/IS911 family protein  38.71 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1300  transposase IS3/IS911 family protein  38.71 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  44.26 
 
 
93 aa  62  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 
93 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  44.07 
 
 
93 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5098  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 
72 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.451404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  42.62 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  42.62 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0143  IS3/IS911 family transposase  47.17 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0204  IS3/IS911 family transposase  47.17 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0209  IS3/IS911 family transposase  47.17 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.599747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0440  putative transposase  43.1 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1235  putative transposase  47.17 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0720605  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  42.62 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  40.68 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4474  transposase IS3/IS911 family protein  39.66 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08100  Transposase  38.98 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.721014 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17080  Transposase  38.98 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22010  Transposase  38.98 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.124801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6820  transposase IS3/IS911 family protein  38.33 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5607  transposase IS3/IS911 family protein  39.66 
 
 
95 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337897  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5363  transposase IS3/IS911 family protein  39.66 
 
 
95 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.657542  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1475  transposase IS3/IS911 family protein  39.66 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1720  transposase IS3/IS911 family protein  39.66 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.809119  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1736  transposase IS3/IS911 family protein  39.66 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908107  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1752  transposase IS3/IS911 family protein  39.66 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130264  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1591  transposase IS3/IS911 family protein  39.66 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1665  transposase IS3/IS911 family protein  39.66 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1667  transposase IS3/IS911 family protein  39.66 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248444  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2263  transposase IS3/IS911 family protein  39.66 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4451  transposase IS3/IS911 family protein  39.66 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0845  transposase IS3/IS911  37.93 
 
 
111 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0862  transposase IS3/IS911 family protein  37.93 
 
 
111 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0578  transposase IS3/IS911 family protein  39.66 
 
 
111 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1110  transposase IS3/IS911 family protein  39.66 
 
 
111 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564169  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2015  transposase IS3/IS911 family protein  39.66 
 
 
92 aa  50.4  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2542  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 
88 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0108  transposase IS3/IS911  43.4 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2022  transposase IS3/IS911  43.4 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2784  transposase IS3/IS911  43.4 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2633  IS3/IS911 family transposase A  37.7 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000594495  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4520  IS3/IS911 family transposase A  37.7 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000777217  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4237  transposase IS3/IS911 family protein  33.9 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219099  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4865  transposase IS3/IS911  36.07 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3300  transposase IS3/IS911 family protein  36.07 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  37.74 
 
 
88 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4006  transposase IS3/IS911 family protein  39.62 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  37.74 
 
 
88 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  37.74 
 
 
88 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7692  insertion element protein  39.62 
 
 
152 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382154  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1438  isrso12-transposase orfa protein  35.09 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2707  isrso12-transposase orfa protein  35.09 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0503  isrso12-transposase orfa protein  35.09 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1299  isrso12-transposase orfa protein  35.09 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0453  transposase IS3/IS911  41.67 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4856  transposase IS3/IS911 family protein  30.99 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.164746 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  35.85 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  33.96 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  33.96 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  33.96 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  33.96 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02572  ISXoo3 transposase ORF A  41.51 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0442  transposase IS3/IS911 family protein  32.14 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2634  transposase IS3/IS911 family protein  32.14 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492474  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2927  transposase IS3/IS911 family protein  32.14 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4740  transposase IS3/IS911 family protein  32.14 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6104  transposase IS3/IS911 family protein  32.14 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0959  transposase IS3/IS911 family protein  32.14 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00699  ISXoo3 transposase ORF A  41.51 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722368  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.207112 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>