More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1972 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1972  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  174  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.806101 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0199  hypothetical protein  80.68 
 
 		 88 aa  154  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1078  hypothetical protein  80.68 
 
 		 88 aa  154  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0857  hypothetical protein  75 
 
 		 88 aa  143  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0431  transposase IS3/IS911 family protein  70.45 
 
 		 88 aa  139  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0275  transposase IS3/IS911 family protein  70.45 
 
 		 88 aa  139  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2228  transposase IS3/IS911 family protein  70.45 
 
 		 88 aa  139  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2355  transposase IS3/IS911 family protein  70.45 
 
 		 88 aa  139  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3081  transposase IS3/IS911 family protein  71.59 
 
 		 88 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0943  transposase IS3/IS911 family protein  69.32 
 
 		 88 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1263  transposase IS3/IS911 family protein  69.32 
 
 		 88 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4807  transposase subfamily  69.32 
 
 		 88 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.650973  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0065  transposase  71.59 
 
 		 88 aa  136  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3069  transposase family protein  69.32 
 
 		 88 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2942  transposase subfamily protein  68.18 
 
 		 88 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342551  hitchhiker  1.76227e-24 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4892  transposase family protein  67.05 
 
 		 92 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0142849 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2300  transposase IS3/IS911 family protein  69.77 
 
 		 94 aa  133  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.356728  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4321  transposase IS3/IS911 family protein  68.18 
 
 		 88 aa  132  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.583527  normal  0.389304 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02903  transposase ORF-A, IS-type  70.11 
 
 		 87 aa  131  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  64.77 
 
 		 88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1235  transposase IS3/IS911 family protein  64.77 
 
 		 88 aa  128  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1288  transposase IS3/IS911 family protein  64.77 
 
 		 88 aa  128  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2193  transposase IS3/IS911 family protein  64.77 
 
 		 88 aa  128  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2601  transposase IS3/IS911 family protein  65.91 
 
 		 88 aa  128  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1624  transposase IS3/IS911 family protein  64.77 
 
 		 88 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  64.37 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  64.37 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  64.37 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  64.37 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  62.07 
 
 		 370 aa  124  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  62.07 
 
 		 370 aa  124  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  62.07 
 
 		 370 aa  124  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  62.07 
 
 		 370 aa  124  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  62.07 
 
 		 370 aa  124  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  62.07 
 
 		 370 aa  124  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  62.07 
 
 		 370 aa  124  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0379  transposase IS3/IS911 family protein  71.05 
 
 		 77 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.563054  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0317  transposase  62.79 
 
 		 87 aa  120  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00457951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2982  transposase IS3/IS911 family protein  62.79 
 
 		 87 aa  120  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.439575  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2896  transposase  62.79 
 
 		 87 aa  120  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000661086  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3341  hypothetical protein  61.36 
 
 		 88 aa  117  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0093  transposase  56.82 
 
 		 88 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.426296 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0132  isrso12-transposase orfa protein  56.82 
 
 		 88 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183288  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0036  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3926  transposase IS3/IS911 family protein  56.82 
 
 		 88 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287084  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0637  transposase IS3/IS911  55.68 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1505  transposase IS3/IS911 family protein  57.32 
 
 		 86 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1473  transposase IS3/IS911 family protein  57.32 
 
 		 86 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.679984  normal  0.0616512 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1493  transposase IS3/IS911 family protein  57.32 
 
 		 86 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363102 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1803  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 		 87 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1117  transposase IS3/IS911 family protein  57.32 
 
 		 86 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1943  transposase IS3/IS911 family protein  57.32 
 
 		 86 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4006  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 		 88 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2285  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0445809  normal  0.0110111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3837  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6172  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4024  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2542  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2278  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00023086  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0125  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0066  transposase IS3/IS911 family protein  55.68 
 
 		 88 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0657  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 362 aa  103  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2735  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 362 aa  103  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2711  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 362 aa  103  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155615  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0083  ISDet1, transposase orfA  53.41 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.376944  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3395  hypothetical protein  50.57 
 
 		 93 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.521621  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3395  transposase IS3/IS911 family protein  55.81 
 
 		 100 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2975  transposase family protein  52.87 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385595  normal  0.0860166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  55.17 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0643  putative transposase  51.14 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.6553  normal  0.737994 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2559  transposase IS3/IS911  57.65 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0007  transposase IS3/IS911 family protein  57.65 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  55.17 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  55.17 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3365  ISSod2, transposase OrfA  54.02 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1609  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0629133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1065  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0220  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3471  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959135  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  51.16 
 
 		 492 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 88 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 88 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 88 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 88 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 88 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 88 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 88 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2906  Fis family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000119814  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0557  ISRSO16-transposase OrfA protein  51.14 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.235174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 88 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3356  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  51.72 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1779  IS3 family transposase  52.87 
 
 		 88 aa  99.4  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4090  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.702583  normal  0.16367 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2311  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.882739 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0403  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  51.72 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.868889 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2510  transposase  51.72 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.021123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>