More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0643 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0643  putative transposase  100 
 
 
99 aa  202  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.6553  normal  0.737994 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3926  transposase IS3/IS911 family protein  72.73 
 
 
88 aa  140  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287084  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0132  isrso12-transposase orfa protein  72.73 
 
 
88 aa  140  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183288  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0093  transposase  72.73 
 
 
88 aa  140  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.426296 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2906  Fis family transcriptional regulator  70.45 
 
 
88 aa  138  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000119814  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0066  transposase IS3/IS911 family protein  71.59 
 
 
88 aa  137  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2285  transposase IS3/IS911 family protein  69.32 
 
 
88 aa  134  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0445809  normal  0.0110111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0125  transposase IS3/IS911 family protein  69.32 
 
 
88 aa  134  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6172  transposase IS3/IS911 family protein  69.32 
 
 
88 aa  134  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2278  transposase IS3/IS911 family protein  69.32 
 
 
88 aa  134  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00023086  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3837  transposase IS3/IS911 family protein  69.32 
 
 
88 aa  134  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1438  isrso12-transposase orfa protein  69.32 
 
 
88 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2707  isrso12-transposase orfa protein  69.32 
 
 
88 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0503  isrso12-transposase orfa protein  69.32 
 
 
88 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1299  isrso12-transposase orfa protein  69.32 
 
 
88 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  67.05 
 
 
88 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0557  ISRSO16-transposase OrfA protein  68.18 
 
 
88 aa  130  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.235174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0720  transposase subfamily  67.05 
 
 
88 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.116485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0442  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
88 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2927  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
88 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4740  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
88 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6104  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
88 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2634  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
88 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492474  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0959  transposase IS3/IS911 family protein  64.37 
 
 
88 aa  124  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1184  transposase IS3/IS911  67.86 
 
 
85 aa  122  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5527  transposase IS3/IS911 family protein  64.77 
 
 
88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.100543 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1548  transposase IS3/IS911 family protein  60.23 
 
 
88 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  64.77 
 
 
88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04442  isrso16-transposase orfa protein  60.92 
 
 
88 aa  114  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3127  transposase IS3/IS911  57.95 
 
 
88 aa  114  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.800536  normal  0.701441 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3534  transposase IS3/IS911  57.95 
 
 
88 aa  114  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.545436  normal  0.522486 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2969  transposase IS3/IS911  57.95 
 
 
88 aa  114  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2756  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
96 aa  110  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
96 aa  110  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
96 aa  110  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
96 aa  110  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1495  transposase IS3/IS911 family protein  56.82 
 
 
88 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3246  transposase IS3/IS911  56.82 
 
 
88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00639582  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0199  hypothetical protein  52.27 
 
 
88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1078  hypothetical protein  52.27 
 
 
88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2601  transposase IS3/IS911 family protein  56.82 
 
 
88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2193  transposase IS3/IS911 family protein  55.68 
 
 
88 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1235  transposase IS3/IS911 family protein  55.68 
 
 
88 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1288  transposase IS3/IS911 family protein  55.68 
 
 
88 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 
88 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 
88 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 
88 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 
88 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 
88 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  56.32 
 
 
88 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  56.32 
 
 
88 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  56.32 
 
 
88 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3081  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 
88 aa  103  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2311  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 
88 aa  103  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.882739 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2308  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 
88 aa  103  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 
88 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2542  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 
88 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02903  transposase ORF-A, IS-type  50.57 
 
 
87 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1972  hypothetical protein  51.14 
 
 
88 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.806101 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4006  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 
88 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
88 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  56.98 
 
 
393 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2559  transposase IS3/IS911  55.29 
 
 
86 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0007  transposase IS3/IS911 family protein  55.29 
 
 
86 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3069  transposase family protein  48.86 
 
 
88 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4807  transposase subfamily  48.86 
 
 
88 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.650973  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2579  transposase IS3/IS911 family protein  54.65 
 
 
88 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0712611  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3395  transposase IS3/IS911 family protein  54.65 
 
 
100 aa  100  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 
88 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7752  putative insertion element ISR1-like protein  50 
 
 
88 aa  100  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619622  normal  0.112312 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0637  transposase IS3/IS911  48.86 
 
 
88 aa  100  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1443  transposase IS3/IS911  56.32 
 
 
92 aa  100  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1571  transposase IS3/IS911  56.32 
 
 
92 aa  100  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1694  transposase IS3/IS911  56.32 
 
 
133 aa  100  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2056  transposase IS3/IS911  56.32 
 
 
92 aa  100  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0286844  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3341  hypothetical protein  47.73 
 
 
88 aa  100  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2896  transposase  51.16 
 
 
87 aa  100  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000661086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0317  transposase  51.16 
 
 
87 aa  100  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00457951  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2982  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
87 aa  100  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.439575  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2942  transposase subfamily protein  47.73 
 
 
88 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342551  hitchhiker  1.76227e-24 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6139  transposase IS3/IS911 family protein  56.47 
 
 
87 aa  100  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.623502 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6020  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 
88 aa  100  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7692  insertion element protein  55.17 
 
 
152 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382154  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0275  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
88 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1610  transposase IS3/IS911 family protein  54.65 
 
 
97 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2228  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
88 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0431  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
88 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2355  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
88 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4321  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
88 aa  99  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.583527  normal  0.389304 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2300  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
94 aa  99.4  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.356728  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3356  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  54.02 
 
 
88 aa  98.6  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4090  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 
88 aa  98.6  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.702583  normal  0.16367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>