More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1495 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1495  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 88 aa  174  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3246  transposase IS3/IS911  77.27 
 
 		 88 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00639582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3127  transposase IS3/IS911  76.14 
 
 		 88 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.800536  normal  0.701441 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3534  transposase IS3/IS911  76.14 
 
 		 88 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.545436  normal  0.522486 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2969  transposase IS3/IS911  76.14 
 
 		 88 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0557  ISRSO16-transposase OrfA protein  76.14 
 
 		 88 aa  138  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.235174 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2756  transposase IS3/IS911 family protein  70.45 
 
 		 88 aa  132  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2285  transposase IS3/IS911 family protein  71.59 
 
 		 88 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0445809  normal  0.0110111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6172  transposase IS3/IS911 family protein  71.59 
 
 		 88 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3837  transposase IS3/IS911 family protein  71.59 
 
 		 88 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0125  transposase IS3/IS911 family protein  71.59 
 
 		 88 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2278  transposase IS3/IS911 family protein  71.59 
 
 		 88 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00023086  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7752  putative insertion element ISR1-like protein  64.77 
 
 		 88 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619622  normal  0.112312 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1438  isrso12-transposase orfa protein  71.59 
 
 		 88 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2707  isrso12-transposase orfa protein  71.59 
 
 		 88 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0503  isrso12-transposase orfa protein  71.59 
 
 		 88 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1299  isrso12-transposase orfa protein  71.59 
 
 		 88 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  68.18 
 
 		 88 aa  124  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2906  Fis family transcriptional regulator  68.18 
 
 		 88 aa  124  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000119814  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0093  transposase  62.5 
 
 		 88 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.426296 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0132  isrso12-transposase orfa protein  62.5 
 
 		 88 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183288  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3926  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 		 88 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287084  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  63.64 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0066  transposase IS3/IS911 family protein  61.36 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5527  transposase IS3/IS911 family protein  63.64 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100543 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04442  isrso16-transposase orfa protein  65.52 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0720  transposase subfamily  59.09 
 
 		 88 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.116485 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0643  putative transposase  56.82 
 
 		 99 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.6553  normal  0.737994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0442  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 		 88 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2927  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 		 88 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6104  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 		 88 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4740  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 		 88 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2634  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 		 88 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1184  transposase IS3/IS911  52.94 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1548  transposase IS3/IS911 family protein  57.95 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0959  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1114  ISRSO16-transposase OrfA protein  63.41 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2730  isrso12-transposase orfa  63.41 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1443  transposase IS3/IS911  54.02 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1571  transposase IS3/IS911  54.02 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1694  transposase IS3/IS911  54.02 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2056  transposase IS3/IS911  54.02 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0286844  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3395  transposase IS3/IS911 family protein  55.81 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0036  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2011  transposase IS3/IS911  52.87 
 
 		 92 aa  100  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 370 aa  99.4  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 370 aa  99.4  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 370 aa  99.4  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 370 aa  99.4  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 370 aa  99.4  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 370 aa  99.4  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 370 aa  99.4  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0199  hypothetical protein  52.27 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1078  hypothetical protein  52.27 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0275  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2228  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0431  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2355  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2601  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 88 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0943  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 		 88 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1263  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 		 88 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2193  transposase IS3/IS911 family protein  48.86 
 
 		 88 aa  96.7  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1288  transposase IS3/IS911 family protein  48.86 
 
 		 88 aa  96.7  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1235  transposase IS3/IS911 family protein  48.86 
 
 		 88 aa  96.7  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1972  hypothetical protein  51.14 
 
 		 88 aa  96.7  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.806101 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4006  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4807  transposase subfamily  46.59 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.650973  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3069  transposase family protein  46.59 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0165  ISDet2, transposase orfA  54.76 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.265769  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 		 88 aa  94.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2542  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 88 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  56.98 
 
 		 393 aa  93.6  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2308  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 		 88 aa  94  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2311  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 		 88 aa  94  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.882739 
 
 
-
 
NC_002936  DET0083  ISDet1, transposase orfA  48.86 
 
 		 88 aa  93.2  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.376944  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0857  hypothetical protein  48.86 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2044  transposase IS3/IS911  52.87 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2579  transposase IS3/IS911 family protein  52.33 
 
 		 88 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0712611  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4650  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204613  normal  0.663628 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1803  transposase IS3/IS911 family protein  49.43 
 
 		 87 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02903  transposase ORF-A, IS-type  48.28 
 
 		 87 aa  93.2  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2942  transposase subfamily protein  45.45 
 
 		 88 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342551  hitchhiker  1.76227e-24 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4237  transposase IS3/IS911 family protein  49.43 
 
 		 92 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219099  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  50.57 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 		 88 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  50.57 
 
 		 88 aa  92  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  50.57 
 
 		 88 aa  92  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2882  hypothetical protein  58.54 
 
 		 99 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.663087  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  50.57 
 
 		 88 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2559  transposase IS3/IS911  53.01 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>