More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3341 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3341  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  180  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0637  transposase IS3/IS911  72.73 
 
 
88 aa  138  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  64.37 
 
 
370 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  64.37 
 
 
370 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  64.37 
 
 
370 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  64.37 
 
 
370 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  64.37 
 
 
370 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  64.37 
 
 
370 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  64.37 
 
 
370 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0199  hypothetical protein  65.91 
 
 
88 aa  124  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1078  hypothetical protein  65.91 
 
 
88 aa  124  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1235  transposase IS3/IS911 family protein  63.64 
 
 
88 aa  125  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2193  transposase IS3/IS911 family protein  63.64 
 
 
88 aa  125  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1288  transposase IS3/IS911 family protein  63.64 
 
 
88 aa  125  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  63.22 
 
 
96 aa  125  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  63.22 
 
 
96 aa  125  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  63.22 
 
 
96 aa  125  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  63.22 
 
 
96 aa  125  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2601  transposase IS3/IS911 family protein  63.64 
 
 
88 aa  124  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  64.77 
 
 
88 aa  123  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4807  transposase subfamily  62.5 
 
 
88 aa  123  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.650973  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3069  transposase family protein  62.5 
 
 
88 aa  123  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2942  transposase subfamily protein  62.5 
 
 
88 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342551  hitchhiker  1.76227e-24 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02903  transposase ORF-A, IS-type  62.07 
 
 
87 aa  121  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3081  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 
88 aa  120  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4892  transposase family protein  60.23 
 
 
92 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0142849 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0431  transposase IS3/IS911 family protein  61.36 
 
 
88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0275  transposase IS3/IS911 family protein  61.36 
 
 
88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2355  transposase IS3/IS911 family protein  61.36 
 
 
88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2228  transposase IS3/IS911 family protein  61.36 
 
 
88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1972  hypothetical protein  61.36 
 
 
88 aa  117  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.806101 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0857  hypothetical protein  61.36 
 
 
88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1263  transposase IS3/IS911 family protein  60.23 
 
 
88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0943  transposase IS3/IS911 family protein  60.23 
 
 
88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4321  transposase IS3/IS911 family protein  60.23 
 
 
88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.583527  normal  0.389304 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2300  transposase IS3/IS911 family protein  61.63 
 
 
94 aa  115  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.356728  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2982  transposase IS3/IS911 family protein  56.98 
 
 
87 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.439575  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2896  transposase  56.98 
 
 
87 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000661086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0317  transposase  56.98 
 
 
87 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00457951  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0065  transposase  60.23 
 
 
88 aa  114  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1624  transposase IS3/IS911 family protein  60.23 
 
 
88 aa  114  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0083  ISDet1, transposase orfA  57.95 
 
 
88 aa  113  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.376944  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  59.77 
 
 
88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  58.62 
 
 
88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 
88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  58.62 
 
 
88 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 
88 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 
88 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 
88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 
88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 
88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 
88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  56.32 
 
 
88 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  56.32 
 
 
88 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  56.32 
 
 
88 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0220  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 
88 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1065  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 
88 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 
88 aa  105  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3471  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 
88 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959135  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1609  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 
88 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0629133  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2044  transposase IS3/IS911  56.32 
 
 
106 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0165  ISDet2, transposase orfA  53.41 
 
 
88 aa  105  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.265769  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1505  transposase IS3/IS911 family protein  56.1 
 
 
86 aa  103  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
88 aa  103  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1117  transposase IS3/IS911 family protein  56.1 
 
 
86 aa  103  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1493  transposase IS3/IS911 family protein  56.1 
 
 
86 aa  103  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.363102 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1943  transposase IS3/IS911 family protein  56.1 
 
 
86 aa  103  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1473  transposase IS3/IS911 family protein  56.1 
 
 
86 aa  103  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.679984  normal  0.0616512 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0036  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 
88 aa  103  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  54.65 
 
 
393 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2559  transposase IS3/IS911  55.29 
 
 
86 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0007  transposase IS3/IS911 family protein  55.29 
 
 
86 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 
88 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1803  transposase IS3/IS911 family protein  50.57 
 
 
87 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04016  ISXoo3 transposase ORF A  50.59 
 
 
87 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06245  ISXoo3 transposase ORF A  49.41 
 
 
87 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.311996  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01074  ISXoo3 transposase ORF A  49.41 
 
 
87 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270456  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0557  ISRSO16-transposase OrfA protein  52.27 
 
 
88 aa  100  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.235174 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03931  ISXoo3 transposase ORF A  49.41 
 
 
87 aa  100  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3365  ISSod2, transposase OrfA  51.72 
 
 
88 aa  100  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04312  transposase  49.41 
 
 
94 aa  100  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02942  ISXoo3 transposase ORF A  50.59 
 
 
87 aa  100  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0664687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03197  ISXoo3 transposase ORF A  50.59 
 
 
87 aa  100  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.818728  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05448  IS66 family element, Orf1 protein, putative  50 
 
 
132 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02393  ISXoo3 transposase ORF A  49.41 
 
 
87 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.567997  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02901  ISXoo3 transposase ORF A  49.41 
 
 
87 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04193  ISXoo3 transposase ORF A  49.41 
 
 
87 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03998  ISXoo3 transposase ORF A  49.41 
 
 
87 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05777  IS66 family element, Orf1 protein, putative  50 
 
 
130 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05705  IS66 family element, Orf1 protein, putative  50 
 
 
132 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04490  ISXoo3 transposase ORF A  49.41 
 
 
87 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04438  ISXoo3 transposase ORF A  49.41 
 
 
89 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00713  transposase  49.41 
 
 
87 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0015797  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01538  ISXoo3 transposase ORF A  49.41 
 
 
87 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.297821  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02483  ISXoo3 transposase ORF A  49.41 
 
 
87 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01959  ISXoo3 transposase ORF A  49.41 
 
 
87 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0236899  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02528  ISXoo3 transposase ORF A  49.41 
 
 
87 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0643  putative transposase  47.73 
 
 
99 aa  100  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.6553  normal  0.737994 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2579  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
88 aa  100  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0712611  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  52.27 
 
 
372 aa  100  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>