More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1117 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1943  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
86 aa  174  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1493  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
86 aa  174  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.363102 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1117  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
86 aa  174  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1505  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
86 aa  174  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1473  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
86 aa  174  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.679984  normal  0.0616512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  68.29 
 
 
96 aa  123  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  68.29 
 
 
96 aa  123  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  68.29 
 
 
96 aa  123  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  68.29 
 
 
96 aa  123  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  62.2 
 
 
370 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  62.2 
 
 
370 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  62.2 
 
 
370 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  62.2 
 
 
370 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  62.2 
 
 
370 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  62.2 
 
 
370 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  62.2 
 
 
370 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0199  hypothetical protein  65.85 
 
 
88 aa  117  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1078  hypothetical protein  65.85 
 
 
88 aa  117  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0431  transposase IS3/IS911 family protein  60.98 
 
 
88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0275  transposase IS3/IS911 family protein  60.98 
 
 
88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2355  transposase IS3/IS911 family protein  60.98 
 
 
88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2228  transposase IS3/IS911 family protein  60.98 
 
 
88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2896  transposase  54.12 
 
 
87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000661086  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1263  transposase IS3/IS911 family protein  60.98 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0943  transposase IS3/IS911 family protein  60.98 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1803  transposase IS3/IS911 family protein  56.1 
 
 
87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2982  transposase IS3/IS911 family protein  54.12 
 
 
87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.439575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0317  transposase  54.12 
 
 
87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00457951  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  56.1 
 
 
492 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02903  transposase ORF-A, IS-type  59.76 
 
 
87 aa  110  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0857  hypothetical protein  62.2 
 
 
88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2975  transposase family protein  57.14 
 
 
88 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385595  normal  0.0860166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1972  hypothetical protein  57.32 
 
 
88 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.806101 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4892  transposase family protein  54.88 
 
 
92 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0142849 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3081  transposase IS3/IS911 family protein  53.66 
 
 
88 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3069  transposase family protein  53.66 
 
 
88 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4024  transposase IS3/IS911 family protein  56.1 
 
 
88 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4807  transposase subfamily  53.66 
 
 
88 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.650973  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2193  transposase IS3/IS911 family protein  53.66 
 
 
88 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1235  transposase IS3/IS911 family protein  53.66 
 
 
88 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0657  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
362 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2735  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
362 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2711  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
362 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155615  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1288  transposase IS3/IS911 family protein  53.66 
 
 
88 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0065  transposase  56.1 
 
 
88 aa  104  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1779  IS3 family transposase  57.32 
 
 
88 aa  104  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2300  transposase IS3/IS911 family protein  52.44 
 
 
94 aa  104  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.356728  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2942  transposase subfamily protein  53.66 
 
 
88 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342551  hitchhiker  1.76227e-24 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0240  transposase IS3/IS911 family protein  58.54 
 
 
88 aa  104  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0945399 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3365  ISSod2, transposase OrfA  56.1 
 
 
88 aa  104  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3395  hypothetical protein  54.88 
 
 
93 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.521621  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3341  hypothetical protein  56.1 
 
 
88 aa  103  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4321  transposase IS3/IS911 family protein  52.44 
 
 
88 aa  103  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.583527  normal  0.389304 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2856  transposase IS3/IS911 family protein  54.76 
 
 
88 aa  103  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3450  transposase IS3/IS911 family protein  54.76 
 
 
88 aa  103  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000413069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3961  transposase IS3/IS911 family protein  54.76 
 
 
88 aa  103  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4079  transposase IS3/IS911 family protein  62.16 
 
 
87 aa  103  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0966  ISSod2, transposase OrfA  54.76 
 
 
88 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2161  ISSod2, transposase OrfA  54.76 
 
 
88 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4268  ISSod2, transposase OrfA  54.76 
 
 
88 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  54.88 
 
 
88 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2311  transposase IS3/IS911 family protein  56.79 
 
 
88 aa  102  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.882739 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2308  transposase IS3/IS911 family protein  56.79 
 
 
88 aa  102  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0026  transposase subfamily  60.81 
 
 
87 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.138106  normal  0.472585 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2601  transposase IS3/IS911 family protein  52.44 
 
 
88 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1413  integrase catalytic subunit  54.32 
 
 
399 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2507  transposase  57.32 
 
 
88 aa  100  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0154773 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1914  putative insertion element / transposase  57.32 
 
 
88 aa  100  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.863357  hitchhiker  0.0000000229131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0875  transposase IS3/IS911 family protein  57.32 
 
 
88 aa  100  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.572302 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2103  putative transposase  57.32 
 
 
88 aa  100  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0726746  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0463  transposase IS3/IS911 family protein  57.32 
 
 
88 aa  100  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1332  putative transposase IS3/IS911  51.19 
 
 
87 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6139  transposase IS3/IS911 family protein  52.38 
 
 
87 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.623502 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1548  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2224  IS407A, transposase OrfA  51.19 
 
 
87 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3352  IS407A, transposase OrfA  51.19 
 
 
87 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2146  transposase subfamily protein  51.19 
 
 
87 aa  98.6  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0375  transposase IS3/IS911 family protein  59.46 
 
 
87 aa  99.4  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000436145  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1425  IS407A, transposase OrfA  51.19 
 
 
87 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.565113  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2697  transposase  51.19 
 
 
87 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0850  IS3 family transposase  53.66 
 
 
88 aa  99  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0297  IS407A, transposase OrfA  51.19 
 
 
87 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000529534  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0313  IS407A, transposase OrfA  51.19 
 
 
87 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00217618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0782  IS407A, transposase OrfA  51.19 
 
 
87 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1720  IS407A, transposase OrfA  51.19 
 
 
87 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0359558  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1167  IS407A, transposase OrfA  51.19 
 
 
87 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0637  transposase IS3/IS911  56.1 
 
 
88 aa  99  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1074  IS407A, transposase OrfA  51.19 
 
 
87 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721827  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0182  IS407A, transposase OrfA  51.19 
 
 
87 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.237707  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0122  hypothetical protein  51.19 
 
 
87 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0089  transposase subfamily protein  51.19 
 
 
87 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0511092  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1552  transposase subfamily protein  51.19 
 
 
87 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1450  transposase subfamily protein  51.19 
 
 
87 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.23699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0922  transposase subfamily protein  51.19 
 
 
87 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0437514  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1913  transposase subfamily protein  51.19 
 
 
87 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000126039  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1567  IS407A, transposase OrfA  51.19 
 
 
87 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.996412  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1596  IS407A, transposase OrfA  51.19 
 
 
87 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2798  transposase subfamily protein  51.19 
 
 
87 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1648  IS407A, transposase OrfA  51.19 
 
 
87 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.699645  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4720  transposase IS3/IS911 family protein  51.19 
 
 
87 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>