More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0245 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0245  transposase IS3 family protein  100 
 
 
92 aa  192  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0274  transposase IS3/IS911 family protein  93.48 
 
 
92 aa  180  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  58.14 
 
 
372 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  58.14 
 
 
372 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  58.14 
 
 
372 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  58.14 
 
 
372 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  58.14 
 
 
372 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  58.14 
 
 
372 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  58.14 
 
 
372 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  58.14 
 
 
372 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  58.14 
 
 
372 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  58.14 
 
 
372 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2103  putative transposase  54.02 
 
 
88 aa  99.4  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0726746  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  55.81 
 
 
88 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0875  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 
88 aa  99.4  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.572302 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0463  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 
88 aa  99.4  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1914  putative insertion element / transposase  54.02 
 
 
88 aa  99.4  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.863357  hitchhiker  0.0000000229131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2507  transposase  54.02 
 
 
88 aa  99.4  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0154773 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  55.81 
 
 
88 aa  98.2  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  55.81 
 
 
88 aa  98.2  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  55.81 
 
 
88 aa  98.2  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  55.81 
 
 
88 aa  98.2  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  54.65 
 
 
88 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  52.33 
 
 
88 aa  94.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  52.33 
 
 
88 aa  94.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  52.33 
 
 
88 aa  94.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2559  transposase IS3/IS911  50 
 
 
86 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0007  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
86 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2044  transposase IS3/IS911  47.67 
 
 
106 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2510  transposase  50 
 
 
88 aa  89.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.021123 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0403  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  50 
 
 
88 aa  89.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.868889 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3356  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  50 
 
 
88 aa  89.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4090  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
88 aa  89.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.702583  normal  0.16367 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  45.35 
 
 
88 aa  87.8  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  45.35 
 
 
88 aa  87.8  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  45.35 
 
 
88 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3395  transposase IS3/IS911 family protein  47.13 
 
 
100 aa  87  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  45.35 
 
 
88 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  45.35 
 
 
88 aa  87  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1065  transposase IS3/IS911 family protein  45.35 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1610  transposase IS3/IS911 family protein  49.43 
 
 
97 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0220  transposase IS3/IS911 family protein  45.35 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3471  transposase IS3/IS911 family protein  45.35 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959135  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1609  transposase IS3/IS911 family protein  45.35 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0629133  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  46.51 
 
 
393 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7692  insertion element protein  47.67 
 
 
152 aa  84  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382154  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2579  transposase IS3/IS911 family protein  47.13 
 
 
88 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0712611  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0275  transposase IS3/IS911 family protein  45.35 
 
 
88 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1093  transposase IS3/IS911 family protein  49.4 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2967  transposase IS3/IS911  46.74 
 
 
95 aa  82  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.142788 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0431  transposase IS3/IS911 family protein  45.35 
 
 
88 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2355  transposase IS3/IS911 family protein  45.35 
 
 
88 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2228  transposase IS3/IS911 family protein  45.35 
 
 
88 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2542  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0108  transposase IS3/IS911  47.06 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2022  transposase IS3/IS911  47.06 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2784  transposase IS3/IS911  47.06 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6020  transposase IS3/IS911 family protein  44.19 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1457  transposase IS3/IS911 family protein  47.5 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080676  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0943  transposase IS3/IS911 family protein  45.35 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1263  transposase IS3/IS911 family protein  45.35 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  41.86 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  41.86 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  41.86 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  41.86 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3735  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_002936  DET0083  ISDet1, transposase orfA  40.23 
 
 
88 aa  77.8  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.376944  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0829  ISRSO14-transposase ORFA protein  48.72 
 
 
87 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1493  ISRSO14-transposase ORFA protein  48.72 
 
 
87 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504029  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2406  ISRSO14-transposase ORFA protein  48.72 
 
 
87 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1216  ISRSO14-transposase ORFA protein  48.72 
 
 
87 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0927  transposase IS3/IS911 family protein  52.05 
 
 
75 aa  77.4  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0026  transposase subfamily  44.05 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.138106  normal  0.472585 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02903  transposase ORF-A, IS-type  43.02 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0375  transposase IS3/IS911 family protein  44.05 
 
 
87 aa  77  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000436145  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2011  transposase IS3/IS911  42.22 
 
 
92 aa  77  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6139  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
87 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.623502 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4006  transposase IS3/IS911 family protein  45.35 
 
 
88 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0137  transposase IS3/IS911  44.05 
 
 
87 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1300  transposase IS3/IS911  44.05 
 
 
87 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.66583  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1483  transposase IS3/IS911  44.05 
 
 
87 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2820  transposase IS3/IS911  44.05 
 
 
87 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5527  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.100543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0641  transposase subfamily protein  46.15 
 
 
87 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0556  IS407A, transposase OrfA  46.15 
 
 
87 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0856086  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0583  IS407A, transposase OrfA  46.15 
 
 
87 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140612  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1055  IS407A, transposase OrfA  46.15 
 
 
87 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1226  IS407A, transposase OrfA  46.15 
 
 
87 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.488211  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1307  IS407A, transposase OrfA  46.15 
 
 
87 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.465429  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1411  IS407A, transposase OrfA  46.15 
 
 
87 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1504  IS407A, transposase OrfA  46.15 
 
 
87 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0007  IS407A, transposase OrfA  46.15 
 
 
87 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0197592  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0042  transposase subfamily protein  46.15 
 
 
87 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0124  IS407A, transposase OrfA  46.15 
 
 
87 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00485388  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0194  IS407A, transposase OrfA  46.15 
 
 
87 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.455443  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0290  IS407A, transposase OrfA  46.15 
 
 
87 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0146217  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0365  IS407A, transposase OrfA  46.15 
 
 
87 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0615521  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0378  IS407A, transposase OrfA  46.15 
 
 
87 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>