More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2967 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2967  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 95 aa  191  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.142788 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0875  transposase IS3/IS911 family protein  80 
 
 		 88 aa  140  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.572302 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1914  putative insertion element / transposase  80 
 
 		 88 aa  140  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.863357  hitchhiker  0.0000000229131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0463  transposase IS3/IS911 family protein  80 
 
 		 88 aa  140  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2507  transposase  80 
 
 		 88 aa  140  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0154773 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2103  putative transposase  80 
 
 		 88 aa  140  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0726746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  71.6 
 
 		 372 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  71.6 
 
 		 372 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  71.6 
 
 		 372 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  71.6 
 
 		 372 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  71.6 
 
 		 372 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  71.6 
 
 		 372 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  71.6 
 
 		 372 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  71.6 
 
 		 372 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  71.6 
 
 		 372 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  71.6 
 
 		 372 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  63.86 
 
 		 88 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  63.86 
 
 		 88 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  63.86 
 
 		 88 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  65.43 
 
 		 88 aa  114  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  63.86 
 
 		 88 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  60 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1610  transposase IS3/IS911 family protein  63.53 
 
 		 97 aa  113  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0220  transposase IS3/IS911 family protein  61.18 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3471  transposase IS3/IS911 family protein  61.18 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959135  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1065  transposase IS3/IS911 family protein  61.18 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1609  transposase IS3/IS911 family protein  61.18 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0629133  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0829  ISRSO14-transposase ORFA protein  68.35 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1493  ISRSO14-transposase ORFA protein  68.35 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504029  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2406  ISRSO14-transposase ORFA protein  68.35 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1216  ISRSO14-transposase ORFA protein  68.35 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  60 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  64.2 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1093  transposase IS3/IS911 family protein  63.86 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  61.45 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  61.45 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  61.45 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  58.82 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  58.82 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  60 
 
 		 88 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  60 
 
 		 88 aa  110  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0641  transposase subfamily protein  67.09 
 
 		 87 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0004  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.30755  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0111  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000238346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0285  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0322  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.796566  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0484  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0496  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0501  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108194  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0574  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.654142  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0758  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0805  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0858  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1040  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0305091  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1078  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1082  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1118  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201818  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1204  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1217  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167434  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1231  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336215  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1256  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2250  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2269  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2596  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2688  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2760  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2792  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.859463  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2835  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3007  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3025  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3092  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3393  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.452656  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0106  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0275  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11388  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0414  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051862  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0437  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470648  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0498  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0551  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0588539  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0556  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0856086  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0583  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140612  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0648  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293699  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0725  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0812  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0846  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1788  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1946  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2074  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2623  transposase IS3/IS911  79.69 
 
 		 64 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.866642  normal  0.218597 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0007  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0197592  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0042  transposase subfamily protein  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0124  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00485388  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0194  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.455443  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0290  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0146217  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0365  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0615521  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0378  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302531  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0530  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.694816  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0628  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662979  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0683  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.514908  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0752  transposase subfamily protein  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0781  IS407A, transposase OrfA  65.82 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>