More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0927 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3356  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  100 
 
 		 88 aa  153  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4090  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 88 aa  153  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.702583  normal  0.16367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2510  transposase  100 
 
 		 88 aa  153  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.021123 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0403  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  100 
 
 		 88 aa  153  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.868889 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0927  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 75 aa  153  9e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7692  insertion element protein  77.33 
 
 		 152 aa  126  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382154  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1610  transposase IS3/IS911 family protein  76.71 
 
 		 97 aa  124  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3395  transposase IS3/IS911 family protein  70.67 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1093  transposase IS3/IS911 family protein  77.46 
 
 		 84 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3735  transposase IS3/IS911 family protein  69.33 
 
 		 107 aa  117  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  68 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  68 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3471  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959135  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1609  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0629133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  68 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1065  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0220  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  68 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  65.33 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2044  transposase IS3/IS911  66.67 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6020  transposase IS3/IS911 family protein  67.57 
 
 		 88 aa  110  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  65.33 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  65.33 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  64 
 
 		 88 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  64 
 
 		 88 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  64 
 
 		 88 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  64 
 
 		 88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  64 
 
 		 88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  65.33 
 
 		 88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  64 
 
 		 88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  68.57 
 
 		 393 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  64 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3396  hypothetical protein  61.33 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2559  transposase IS3/IS911  62.16 
 
 		 86 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0007  transposase IS3/IS911 family protein  62.16 
 
 		 86 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  59.46 
 
 		 372 aa  100  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  59.46 
 
 		 372 aa  100  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  59.46 
 
 		 372 aa  100  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  59.46 
 
 		 372 aa  100  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  59.46 
 
 		 372 aa  100  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  59.46 
 
 		 372 aa  100  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  59.46 
 
 		 372 aa  100  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  59.46 
 
 		 372 aa  100  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  59.46 
 
 		 372 aa  100  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  59.46 
 
 		 372 aa  100  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  54.05 
 
 		 96 aa  98.2  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  54.05 
 
 		 96 aa  98.2  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  54.05 
 
 		 96 aa  98.2  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  54.05 
 
 		 96 aa  98.2  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0111  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000238346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0322  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.796566  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0442  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0496  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0585  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.843221  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0659  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0720  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0609624  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0805  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1082  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1118  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201818  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1231  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336215  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1256  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1295  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1410  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0273301  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1842  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.987481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1953  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1974  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.218571  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2086  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.270809  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3092  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3393  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.452656  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0106  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0275  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11388  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0498  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0551  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0588539  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0556  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0856086  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0583  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140612  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0648  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293699  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0725  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0812  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0846  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0870  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00673205  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0886  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.377434  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0891  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0917  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.251594  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0991  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1004  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1024  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721664  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1055  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0365  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0615521  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0378  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302531  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0465  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0490  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0530  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.694816  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0628  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662979  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0683  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.514908  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0752  transposase subfamily protein  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1266  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.479831  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1456  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1525  transposase subfamily protein  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1611  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1630  IS407A, transposase OrfA  63.51 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00252803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>