More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3396 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3396  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534123  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7692  insertion element protein  69.32 
 
 
152 aa  127  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382154  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3395  transposase IS3/IS911 family protein  69.32 
 
 
100 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  72.29 
 
 
393 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2510  transposase  63.64 
 
 
88 aa  122  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.021123 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3356  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  63.64 
 
 
88 aa  122  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4090  transposase IS3/IS911 family protein  63.64 
 
 
88 aa  122  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.702583  normal  0.16367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0403  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  63.64 
 
 
88 aa  122  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.868889 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  63.64 
 
 
88 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6020  transposase IS3/IS911 family protein  67.05 
 
 
88 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  63.64 
 
 
88 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  63.64 
 
 
88 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 
88 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 
88 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 
88 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 
88 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 
88 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 
88 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1610  transposase IS3/IS911 family protein  66.27 
 
 
97 aa  117  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1093  transposase IS3/IS911 family protein  65.06 
 
 
84 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  60.23 
 
 
88 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  60.23 
 
 
88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  59.09 
 
 
88 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  59.09 
 
 
88 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  59.09 
 
 
88 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  59.09 
 
 
88 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1065  transposase IS3/IS911 family protein  57.95 
 
 
88 aa  114  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0220  transposase IS3/IS911 family protein  57.95 
 
 
88 aa  114  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3471  transposase IS3/IS911 family protein  57.95 
 
 
88 aa  114  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959135  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1609  transposase IS3/IS911 family protein  57.95 
 
 
88 aa  114  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0629133  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2044  transposase IS3/IS911  59.09 
 
 
106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2559  transposase IS3/IS911  61.73 
 
 
86 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0007  transposase IS3/IS911 family protein  61.73 
 
 
86 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  55.42 
 
 
372 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  55.42 
 
 
372 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  55.42 
 
 
372 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  55.42 
 
 
372 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  55.42 
 
 
372 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  55.42 
 
 
372 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  55.42 
 
 
372 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  55.42 
 
 
372 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  55.42 
 
 
372 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  55.42 
 
 
372 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3735  transposase IS3/IS911 family protein  56.79 
 
 
107 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  53.01 
 
 
96 aa  103  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  53.01 
 
 
96 aa  103  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  53.01 
 
 
96 aa  103  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  53.01 
 
 
96 aa  103  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 
370 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 
370 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 
370 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 
370 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 
370 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 
370 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 
370 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0927  transposase IS3/IS911 family protein  61.33 
 
 
75 aa  101  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0641  transposase subfamily protein  56.47 
 
 
87 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0285  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0484  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0585  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.843221  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1078  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1082  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1118  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201818  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1204  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2284  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.884453  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2596  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2898  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3007  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3025  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3393  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.452656  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0106  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0275  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11388  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0414  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051862  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0437  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470648  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0891  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0917  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.251594  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0991  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1174  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174757  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1226  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.488211  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1307  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.465429  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1377  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1411  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1504  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1513  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.018385  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1645  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1759  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1788  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1946  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2074  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1745  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205847  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1750  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0455865  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0059  transposase subfamily protein  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.908412  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0153  transposase subfamily protein  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.529754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0544  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0564  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159234  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0710  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0639464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0822  transposase subfamily protein  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0939  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0366914  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0961  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.231631  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0983  IS407A, transposase OrfA  55.29 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.51087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>