More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2271 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2848  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
108 aa  221  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.389181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2395  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
108 aa  221  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2271  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
108 aa  221  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3210  transposase IS3/IS911 family protein  57.73 
 
 
98 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10240  Transposase  52 
 
 
97 aa  94  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2874  transposase IS3/IS911 family protein  51.02 
 
 
95 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000119781  normal  0.0116758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0629  transposase IS3/IS911 family protein  51.02 
 
 
95 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2065  transposase IS3/IS911 family protein  51.02 
 
 
95 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000072844  hitchhiker  0.00973796 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3646  transposase IS3/IS911 family protein  52.13 
 
 
100 aa  91.3  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4507  transposase IS3/IS911 family protein  54.74 
 
 
93 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122845 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4463  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
95 aa  90.5  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3498  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
95 aa  90.5  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000201546  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0130  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
95 aa  90.5  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3486  transposase IS3/IS911 family protein  48.54 
 
 
100 aa  90.5  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1241  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
95 aa  89.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0276209  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06580  Transposase  48.98 
 
 
95 aa  89.4  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0602807  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2596  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
97 aa  87  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2438  transposase IS3/IS911 family protein  49.47 
 
 
94 aa  87  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000416756 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0276  transposase IS3/IS911 family protein  47 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0377  transposase IS3/IS911 family protein  47 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0301  transposase IS3/IS911 family protein  47 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0255  transposase IS3/IS911 family protein  47 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0385  transposase IS3/IS911 family protein  47 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1003  transposase IS3/IS911 family protein  47 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0231  transposase IS3/IS911 family protein  47 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1439  transposase IS3/IS911 family protein  47 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0436436  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2705  transposase IS3/IS911 family protein  47 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217344  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3954  transposase IS3/IS911 family protein  47 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3957  transposase IS3/IS911 family protein  47 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1430  transposase IS3/IS911 family protein  47 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1486  transposase IS3/IS911 family protein  47 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.089931  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21100  Transposase  52.17 
 
 
99 aa  83.6  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20150  Transposase  52.17 
 
 
99 aa  83.6  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101753  normal  0.0248852 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18710  Transposase  52.17 
 
 
99 aa  82  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23460  Transposase  52.17 
 
 
99 aa  82.4  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.519967  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0800  transposase IS3/IS911 family protein  49.47 
 
 
95 aa  80.9  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23530  Transposase  51.09 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17770  Transposase  51.09 
 
 
99 aa  79.7  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.894128  normal  0.461539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3194  transposase IS3/IS911 family protein  47.92 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0960855  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3350  transposase IS3/IS911 family protein  48.98 
 
 
102 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315603  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17910  Transposase  46.32 
 
 
101 aa  76.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.252162 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1933  transposase IS3/IS911 family protein  48.98 
 
 
102 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00315482  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1509  transposase IS3/IS911  45.83 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1532  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1726  transposase IS3/IS911  41.94 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.110151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2154  transposase IS3/IS911 family protein  44.79 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432378 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  34.58 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3179  transposase IS3/IS911  44.55 
 
 
115 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3191  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 
102 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3241  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 
102 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.680092  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  32.61 
 
 
90 aa  61.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5590  transposase IS3/IS911  47.92 
 
 
102 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302178  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5991  transposase IS3/IS911 family protein  47.92 
 
 
102 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160623 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1095  transposase IS3/IS911 family protein  46.88 
 
 
102 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5960  transposase IS3/IS911 family protein  46.88 
 
 
102 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0616  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 
102 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0576  transposase IS3/IS911 family protein  38.68 
 
 
110 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3742  transposase IS3/IS911 family protein  38.68 
 
 
110 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05320  Transposase  47 
 
 
102 aa  60.5  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9415  transposase IS3/IS911 family protein  39.58 
 
 
95 aa  59.3  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4704  transposase IS3/IS911 family protein  39.58 
 
 
95 aa  59.3  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4688  transposase IS3/IS911 family protein  39.58 
 
 
95 aa  59.3  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  0.571862 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  37 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  37 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1241  IS3 family transposase OrfA  34.69 
 
 
91 aa  57  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00141321  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  35.05 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  35.05 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3685  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0532244  normal  0.0505039 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  35.05 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  35.05 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  35.05 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  35.05 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  36.17 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  35.05 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  36.17 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  35.05 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  36.17 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  32.29 
 
 
97 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  32.29 
 
 
97 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  32.29 
 
 
97 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  32.29 
 
 
97 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  32.29 
 
 
97 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1182  transposase IS3/IS911 family protein  34.09 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3669  transposase IS3/IS911 family protein  34.04 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86487  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2229  transposase IS3/IS911 family protein  35.24 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505397  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1999  transposase IS3/IS911 family protein  35.24 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4595  transposase IS3/IS911 family protein  32.65 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.267513  normal  0.816479 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2549  transposase IS3/IS911 family protein  32.65 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.848876  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4661  transposase IS3/IS911 family protein  32.65 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.935121  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4654  transposase IS3/IS911 family protein  32.65 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  35.92 
 
 
103 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  35.92 
 
 
103 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  35.92 
 
 
103 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0609  transposase IS3/IS911 family protein  35.24 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0560  transposase IS3/IS911 family protein  35.24 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504625  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2247  transposase IS3/IS911 family protein  35.24 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249628  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1627  transposase IS3/IS911  35.24 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.683262  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3190  transposase IS3/IS911  35.24 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39399  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0577  transposase IS3/IS911 family protein  35.24 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1641  transposase IS3/IS911 family protein  32.98 
 
 
95 aa  54.3  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0492981  normal  0.0662441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>