154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2803 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2803  transposase IS3/IS911  100 
 
 
99 aa  205  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227333  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2991  transposase IS3/IS911 family protein  97.98 
 
 
99 aa  200  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  42.35 
 
 
374 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  42.35 
 
 
374 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  42.35 
 
 
374 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  42.35 
 
 
374 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  42.35 
 
 
374 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  42.35 
 
 
374 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  42.35 
 
 
374 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  29.21 
 
 
100 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1398  transposase-like  33.7 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.276724  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1745  transposase-like  33.7 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1067  transposase IS3/IS911 family protein  37.21 
 
 
96 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.285311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1615  transposase IS3/IS911 family protein  37.21 
 
 
96 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146541  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2242  transposase IS3/IS911 family protein  37.21 
 
 
96 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.021715  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2370  transposase IS3/IS911 family protein  37.21 
 
 
96 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.695527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2864  transposase IS3/IS911 family protein  37.21 
 
 
96 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0966509  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0575  transposase IS3/IS911 family protein  37.21 
 
 
96 aa  52  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725872  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0619  transposase IS3/IS911 family protein  37.21 
 
 
96 aa  52  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3689  transposase IS3/IS911 family protein  37.21 
 
 
96 aa  52  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.547507  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4619  transposase IS3/IS911 family protein  37.21 
 
 
96 aa  52  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4634  transposase IS3/IS911 family protein  37.21 
 
 
96 aa  52  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4643  transposase IS3/IS911 family protein  37.21 
 
 
96 aa  52  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5496  transposase IS3/IS911 family protein  37.21 
 
 
96 aa  52  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189114  normal  0.30251 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0995  transposase IS3/IS911  34.88 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1819  transposase-like  28.57 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000187587  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  31.18 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0082  transposase IS3/IS911 family protein  31.82 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0293  transposase IS3/IS911 family protein  31.82 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0976  transposase IS3/IS911 family protein  31.82 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.163321  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1326  transposase IS3/IS911 family protein  31.82 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0172705  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0065  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1618  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  30.11 
 
 
131 aa  47.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  30.11 
 
 
131 aa  47.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2283  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
134 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  normal  0.0121146 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5937  transposase IS3/IS911  29.07 
 
 
102 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.653759  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0887  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
134 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2230  transposase IS3/IS911  30.23 
 
 
96 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000508714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2280  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
134 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00249906  normal  0.0576324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2663  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
134 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.333405  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3362  transposase (class V)  30.68 
 
 
95 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06182  hypothetical protein  29.07 
 
 
93 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06015  hypothetical protein  29.07 
 
 
93 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06081  hypothetical protein  29.07 
 
 
93 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08182  transposase  29.07 
 
 
93 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000279853  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01093  hypothetical protein  29.07 
 
 
93 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01502  hypothetical protein  29.07 
 
 
93 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01667  hypothetical protein  29.07 
 
 
93 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01863  hypothetical protein  29.07 
 
 
93 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01947  hypothetical protein  29.07 
 
 
93 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02147  hypothetical protein  29.07 
 
 
93 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02413  hypothetical protein  29.07 
 
 
93 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02814  hypothetical protein  29.07 
 
 
93 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02887  hypothetical protein  29.07 
 
 
93 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05620  hypothetical protein  29.07 
 
 
93 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05649  hypothetical protein  29.07 
 
 
93 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05659  hypothetical protein  29.07 
 
 
93 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05741  hypothetical protein  29.07 
 
 
93 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05751  hypothetical protein  29.07 
 
 
93 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  33.33 
 
 
135 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  33.33 
 
 
135 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02439  hypothetical protein  28.74 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  30.61 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  30.61 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  30.61 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1182  transposase IS3/IS911 family protein  34.94 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  33.33 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2178  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
382 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.322706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2699  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
390 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0824  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
382 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2702  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
382 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2620  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
382 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  33.33 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  33.33 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1736  transposase  26.74 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0405  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
382 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2361  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
382 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00134936  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  31.87 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0590  transposase IS3/IS911  34.78 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139932  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5766  transposase IS3/IS911 family protein  30.34 
 
 
158 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08186  transposase  27.91 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.0000609698  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4685  transposase IS3/IS911  32.56 
 
 
120 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.137823  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  31.46 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  31.46 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2124  putative transposase  36.92 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  32.14 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  32.14 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1673  transposase IS3/IS911  34.78 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1682  transposase IS3/IS911  34.78 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1686  transposase IS3/IS911  34.78 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1692  transposase IS3/IS911  34.78 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.325728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1880  transposase IS3/IS911  34.78 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1887  transposase IS3/IS911  34.78 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1975  transposase IS3/IS911  34.78 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1992  transposase IS3/IS911  34.78 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2001  transposase IS3/IS911  34.78 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2013  transposase IS3/IS911  34.78 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00189647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2136  transposase IS3/IS911  34.78 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>