126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1712 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1306  transposase IS3/IS911  100 
 
 
100 aa  201  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.273765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1654  transposase IS3/IS911  100 
 
 
100 aa  201  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1712  transposase IS3/IS911  100 
 
 
100 aa  201  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2284  transposase IS3/IS911  100 
 
 
100 aa  201  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4376  transposase IS3/IS911  60.4 
 
 
103 aa  123  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4500  transposase IS3/IS911 family protein  60.4 
 
 
103 aa  123  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4204  transposase IS3/IS911 family protein  64 
 
 
102 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5937  transposase IS3/IS911  62 
 
 
102 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.653759  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1736  transposase  61 
 
 
102 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0202  putative transposase  58.16 
 
 
121 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00346911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1692  transposase  58.16 
 
 
121 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08182  transposase  51.61 
 
 
93 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000279853  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01093  hypothetical protein  51.61 
 
 
93 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01502  hypothetical protein  51.61 
 
 
93 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01667  hypothetical protein  51.61 
 
 
93 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01863  hypothetical protein  51.61 
 
 
93 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01947  hypothetical protein  51.61 
 
 
93 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02147  hypothetical protein  51.61 
 
 
93 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02413  hypothetical protein  51.61 
 
 
93 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02814  hypothetical protein  51.61 
 
 
93 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02887  hypothetical protein  51.61 
 
 
93 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05620  hypothetical protein  51.61 
 
 
93 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05649  hypothetical protein  51.61 
 
 
93 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05659  hypothetical protein  51.61 
 
 
93 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05741  hypothetical protein  51.61 
 
 
93 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05751  hypothetical protein  51.61 
 
 
93 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06015  hypothetical protein  51.61 
 
 
93 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06081  hypothetical protein  51.61 
 
 
93 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06182  hypothetical protein  51.61 
 
 
93 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02439  hypothetical protein  51.65 
 
 
96 aa  98.6  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08186  transposase  50.54 
 
 
93 aa  98.6  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.0000609698  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0082  transposase IS3/IS911 family protein  47.92 
 
 
94 aa  92.8  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0293  transposase IS3/IS911 family protein  47.92 
 
 
94 aa  92.8  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0976  transposase IS3/IS911 family protein  47.92 
 
 
94 aa  92.8  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.163321  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1326  transposase IS3/IS911 family protein  47.92 
 
 
94 aa  92.8  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0172705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1457  hypothetical protein  56.47 
 
 
85 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178192  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02326  hypothetical protein  44.55 
 
 
110 aa  92  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0540  putative transposase  47.25 
 
 
97 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3362  transposase (class V)  46.32 
 
 
95 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1611  IS3 family transposase orfA  57.5 
 
 
119 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0237  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 
94 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5642  transposase IS3/IS911 family protein  43.62 
 
 
94 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5449  transposase IS3/IS911 family protein  43.62 
 
 
94 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49737  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5484  transposase IS3/IS911 family protein  43.62 
 
 
94 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2107  transposase IS3/IS911 family protein  43.62 
 
 
96 aa  77.4  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000446311  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1539  transposase  47.87 
 
 
96 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0203174  normal  0.231759 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6609  transposase and inactivated derivatives  61.4 
 
 
63 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.580446  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3075  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0878  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.921471 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2414  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0773  transposase IS3/IS911 family protein  41.49 
 
 
96 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2321  transposase IS3/IS911 family protein  43.62 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.588962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0019  transposase IS3/IS911 family protein  44.94 
 
 
101 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3396  transposase IS3/IS911 family protein  44.94 
 
 
101 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2431  putative transposase  45.88 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.4252  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0416  transposase IS3/IS911  42.7 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  0.297297 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2729  transposase IS3/IS911 family protein  37.93 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0939  transposase IS3/IS911 family protein  38.1 
 
 
97 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1305  transposase IS3/IS911 family protein  38.1 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1894  transposase IS3/IS911 family protein  38.1 
 
 
97 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1955  transposase IS3/IS911 family protein  38.1 
 
 
97 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2113  transposase IS3/IS911 family protein  38.1 
 
 
97 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1759  transposase IS3/IS911 family protein  38.1 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1903  transposase IS3/IS911 family protein  38.1 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.416601  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0136  transposase IS3/IS911 family protein  37.93 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0185  transposase IS3/IS911 family protein  37.93 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.204073  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1881  transposase IS3/IS911 family protein  37.93 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3664  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0078  transposase IS3/IS911 family protein  34.78 
 
 
97 aa  67.4  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803962  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1300  transposase IS3/IS911 family protein  34.41 
 
 
382 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.161562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1666  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 
382 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1144  transposase IS3/IS911 family protein  38.82 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0843  transposase IS3/IS911 family protein  34.41 
 
 
382 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180588  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1295  transposase IS3/IS911 family protein  36.9 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2361  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
382 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00134936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2620  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
382 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0405  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
382 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0824  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
382 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2702  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
382 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2178  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
382 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.322706  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3029  hypothetical protein  35.63 
 
 
97 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0839  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
382 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0117818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0590  transposase IS3/IS911  32.61 
 
 
97 aa  61.6  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139932  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0430  transposase IS3/IS911 family protein  38.1 
 
 
99 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6985  transposase IS3/IS911 family protein  37.63 
 
 
98 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.345794  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2699  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
390 aa  61.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0586  transposase IS3/IS911  32.61 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0920  transposase IS3/IS911  32.61 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1657  transposase IS3/IS911  32.61 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.803884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1662  transposase IS3/IS911  32.61 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1673  transposase IS3/IS911  32.61 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1675  transposase IS3/IS911  32.61 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1686  transposase IS3/IS911  32.61 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1887  transposase IS3/IS911  32.61 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1975  transposase IS3/IS911  32.61 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1992  transposase IS3/IS911  32.61 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2001  transposase IS3/IS911  32.61 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2013  transposase IS3/IS911  32.61 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00189647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2136  transposase IS3/IS911  32.61 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2772  transposase IS3/IS911  32.61 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.120538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>