More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9118 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9118  pyruvate kinase  100 
 
 		 477 aa  959    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  66.67 
 
 		 475 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5564  pyruvate kinase  63.89 
 
 		 472 aa  592  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  63.48 
 
 		 470 aa  588  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  64.12 
 
 		 475 aa  588  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  65.18 
 
 		 470 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1446  pyruvate kinase  63.91 
 
 		 470 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2104  pyruvate kinase  63.91 
 
 		 470 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576742  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  64.33 
 
 		 470 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0655  pyruvate kinase  64.12 
 
 		 470 aa  566  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  52.22 
 
 		 472 aa  474  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  52.1 
 
 		 492 aa  471  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  51.38 
 
 		 487 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  50.74 
 
 		 472 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  52.1 
 
 		 492 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  50.85 
 
 		 478 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  51.69 
 
 		 488 aa  467  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  50.53 
 
 		 474 aa  462  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  50.32 
 
 		 472 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  50.43 
 
 		 479 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  50.96 
 
 		 479 aa  457  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  49.57 
 
 		 471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  49.57 
 
 		 471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  50.74 
 
 		 477 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  50.21 
 
 		 476 aa  452  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  50.74 
 
 		 477 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  49.57 
 
 		 471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  49.57 
 
 		 471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4478  pyruvate kinase  49.89 
 
 		 471 aa  450  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  49.15 
 
 		 471 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1294  pyruvate kinase  51.17 
 
 		 472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2308  pyruvate kinase  49.36 
 
 		 473 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  48.74 
 
 		 483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2370  pyruvate kinase  48.73 
 
 		 518 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2276  pyruvate kinase  48.52 
 
 		 481 aa  441  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756319  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0447  pyruvate kinase  49.05 
 
 		 482 aa  434  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  50 
 
 		 497 aa  434  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3121  pyruvate kinase  50.11 
 
 		 485 aa  435  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  51.07 
 
 		 484 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  51.07 
 
 		 484 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1638  pyruvate kinase  51.07 
 
 		 484 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  51.5 
 
 		 484 aa  431  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  48.51 
 
 		 477 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  48.51 
 
 		 477 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2773  pyruvate kinase  48.72 
 
 		 471 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0467936  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0341  pyruvate kinase  48.19 
 
 		 484 aa  428  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0955496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3256  pyruvate kinase  47.35 
 
 		 478 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496485  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1165  pyruvate kinase  45.45 
 
 		 478 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22404  pyruvate kinase 1  46.22 
 
 		 591 aa  419  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.529919  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  45.45 
 
 		 477 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  45.67 
 
 		 477 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  48.83 
 
 		 470 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  45.88 
 
 		 477 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0228  pyruvate kinase  48.52 
 
 		 482 aa  415  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1748  pyruvate kinase  45.55 
 
 		 478 aa  418  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6869  pyruvate kinase  46.51 
 
 		 478 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  46.3 
 
 		 478 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2516  pyruvate kinase  47.59 
 
 		 481 aa  417  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2486  pyruvate kinase  48.53 
 
 		 481 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1688  pyruvate kinase  45.55 
 
 		 478 aa  418  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  45.88 
 
 		 478 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0558  pyruvate kinase  49.37 
 
 		 473 aa  415  1e-114  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0432  pyruvate kinase  47.96 
 
 		 484 aa  413  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  45.45 
 
 		 475 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  46.71 
 
 		 478 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  45.34 
 
 		 479 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5259  pyruvate kinase  48.28 
 
 		 484 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  46.61 
 
 		 478 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3590  pyruvate kinase  46.51 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768977  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3690  pyruvate kinase  45.57 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2744  pyruvate kinase  48.61 
 
 		 483 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1443  pyruvate kinase  49.89 
 
 		 476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3289  pyruvate kinase  46.3 
 
 		 479 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1766  pyruvate kinase  46.62 
 
 		 481 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0128  pyruvate kinase  47.13 
 
 		 478 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.324584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2866  pyruvate kinase  48.19 
 
 		 478 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0412  pyruvate kinase  46.62 
 
 		 481 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2971  pyruvate kinase  48.61 
 
 		 478 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  45.76 
 
 		 482 aa  390  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  45.57 
 
 		 478 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  44.7 
 
 		 594 aa  382  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  43.1 
 
 		 581 aa  382  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  44.98 
 
 		 471 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  41.95 
 
 		 476 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  45.44 
 
 		 474 aa  375  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  44.4 
 
 		 600 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  46.07 
 
 		 483 aa  376  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  44.37 
 
 		 481 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  46.28 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  43.82 
 
 		 480 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  44.51 
 
 		 590 aa  369  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  44.63 
 
 		 580 aa  372  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  45.01 
 
 		 474 aa  369  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  44.35 
 
 		 589 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  44.16 
 
 		 481 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  45.8 
 
 		 479 aa  371  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  44.14 
 
 		 596 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  44.04 
 
 		 596 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  43.92 
 
 		 597 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  45.49 
 
 		 471 aa  368  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0824427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>