More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5259 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5259  pyruvate kinase  100 
 
 		 484 aa  973    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  57.26 
 
 		 472 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1638  pyruvate kinase  56.48 
 
 		 484 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  56.05 
 
 		 484 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  56.48 
 
 		 484 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  56.26 
 
 		 484 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  53.45 
 
 		 488 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  53.33 
 
 		 478 aa  485  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0341  pyruvate kinase  53.81 
 
 		 484 aa  486  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0955496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  53.23 
 
 		 487 aa  482  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  52.78 
 
 		 478 aa  481  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0432  pyruvate kinase  53.25 
 
 		 484 aa  484  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  54.18 
 
 		 479 aa  482  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  52.04 
 
 		 478 aa  479  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2276  pyruvate kinase  52.92 
 
 		 481 aa  479  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756319  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1294  pyruvate kinase  55.29 
 
 		 472 aa  479  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  53.3 
 
 		 492 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  53.65 
 
 		 479 aa  477  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  51.4 
 
 		 475 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  54.21 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  50.97 
 
 		 477 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  54.41 
 
 		 472 aa  477  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  53.3 
 
 		 492 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  51.17 
 
 		 474 aa  475  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  53.78 
 
 		 471 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  50.86 
 
 		 472 aa  474  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  53.78 
 
 		 471 aa  472  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  53.78 
 
 		 471 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  50.54 
 
 		 477 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4478  pyruvate kinase  52.27 
 
 		 471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  53.78 
 
 		 471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  52.27 
 
 		 477 aa  468  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  50.54 
 
 		 477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  52.35 
 
 		 479 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  50.85 
 
 		 476 aa  466  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  51.18 
 
 		 497 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6869  pyruvate kinase  51.4 
 
 		 478 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  51.84 
 
 		 477 aa  467  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  53.45 
 
 		 477 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3590  pyruvate kinase  53.62 
 
 		 479 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768977  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_004310  BR1748  pyruvate kinase  52.88 
 
 		 478 aa  463  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  52.59 
 
 		 475 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3289  pyruvate kinase  53.4 
 
 		 479 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1688  pyruvate kinase  52.88 
 
 		 478 aa  463  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  53.45 
 
 		 477 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1165  pyruvate kinase  52.88 
 
 		 478 aa  461  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3121  pyruvate kinase  52.22 
 
 		 485 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  50.11 
 
 		 483 aa  460  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  51.19 
 
 		 478 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2773  pyruvate kinase  52.92 
 
 		 471 aa  457  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0467936  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  50.32 
 
 		 478 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0447  pyruvate kinase  51.29 
 
 		 482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  50.65 
 
 		 470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2308  pyruvate kinase  51.62 
 
 		 473 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  49.03 
 
 		 470 aa  448  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5564  pyruvate kinase  49.25 
 
 		 472 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3256  pyruvate kinase  51.39 
 
 		 478 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496485  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2370  pyruvate kinase  48.84 
 
 		 518 aa  450  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0128  pyruvate kinase  50.32 
 
 		 478 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.324584 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3690  pyruvate kinase  50.85 
 
 		 479 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  49.89 
 
 		 475 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0228  pyruvate kinase  52.46 
 
 		 482 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2744  pyruvate kinase  49.68 
 
 		 483 aa  443  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2866  pyruvate kinase  49.89 
 
 		 478 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1766  pyruvate kinase  51.62 
 
 		 481 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2971  pyruvate kinase  50.11 
 
 		 478 aa  444  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2486  pyruvate kinase  50.97 
 
 		 481 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1446  pyruvate kinase  51.29 
 
 		 470 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2516  pyruvate kinase  51.19 
 
 		 481 aa  441  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2104  pyruvate kinase  51.29 
 
 		 470 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576742  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0412  pyruvate kinase  51.4 
 
 		 481 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0655  pyruvate kinase  51.08 
 
 		 470 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  49.46 
 
 		 470 aa  433  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  48.39 
 
 		 470 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0558  pyruvate kinase  49.78 
 
 		 473 aa  428  1e-119  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1443  pyruvate kinase  51.18 
 
 		 476 aa  425  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9118  pyruvate kinase  48.28 
 
 		 477 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  48.07 
 
 		 474 aa  409  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  45.92 
 
 		 482 aa  409  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22404  pyruvate kinase 1  43.13 
 
 		 591 aa  404  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.529919  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  46.35 
 
 		 474 aa  401  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  42.34 
 
 		 584 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  44.56 
 
 		 478 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  40.9 
 
 		 585 aa  381  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  40.81 
 
 		 580 aa  375  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  41.36 
 
 		 588 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  42.49 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  44.68 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  41.4 
 
 		 578 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  44.65 
 
 		 479 aa  366  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  40.04 
 
 		 474 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  40.25 
 
 		 474 aa  368  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  42.53 
 
 		 594 aa  364  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  42.43 
 
 		 483 aa  362  7.0000000000000005e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  41.03 
 
 		 585 aa  362  9e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  43.16 
 
 		 582 aa  362  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  42.58 
 
 		 476 aa  360  2e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  40.81 
 
 		 485 aa  361  2e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  43.99 
 
 		 474 aa  360  3e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  39.4 
 
 		 580 aa  360  3e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>