More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1063 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  77.66 
 
 
485 aa  771    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  100 
 
 
483 aa  981    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  90.3 
 
 
494 aa  880    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  76.37 
 
 
597 aa  748    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  68.86 
 
 
594 aa  648    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  75.37 
 
 
580 aa  736    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  75.95 
 
 
596 aa  741    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  74.89 
 
 
596 aa  731    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  77.87 
 
 
485 aa  775    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  81.72 
 
 
605 aa  781    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  75.53 
 
 
596 aa  741    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  68 
 
 
589 aa  628  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  67.3 
 
 
590 aa  626  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  67.16 
 
 
601 aa  621  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  66.24 
 
 
587 aa  622  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  66.03 
 
 
592 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  66.03 
 
 
592 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  64.97 
 
 
600 aa  605  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  50.54 
 
 
578 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  48.72 
 
 
581 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  50.21 
 
 
588 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  49.15 
 
 
585 aa  444  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  47.46 
 
 
584 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  47.78 
 
 
583 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  48.73 
 
 
585 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  46.79 
 
 
580 aa  430  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  49.36 
 
 
474 aa  431  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  48.52 
 
 
585 aa  428  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  49.05 
 
 
587 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  48.95 
 
 
585 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  47.67 
 
 
583 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  48.1 
 
 
585 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  48.31 
 
 
585 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  48.31 
 
 
585 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  48.31 
 
 
585 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  48.52 
 
 
585 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  48.31 
 
 
585 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  48.31 
 
 
585 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  48.1 
 
 
585 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  47.12 
 
 
577 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  46.84 
 
 
583 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  48.41 
 
 
582 aa  421  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  47.08 
 
 
476 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  46.07 
 
 
585 aa  418  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  48.09 
 
 
474 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  47.8 
 
 
471 aa  415  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  46.07 
 
 
585 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  46.07 
 
 
585 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  48.25 
 
 
480 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  49.58 
 
 
478 aa  413  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  49.88 
 
 
472 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  45.55 
 
 
580 aa  413  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  48.2 
 
 
474 aa  409  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  46.85 
 
 
472 aa  411  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  49.88 
 
 
472 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  49.04 
 
 
478 aa  411  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1080  pyruvate kinase  46.99 
 
 
481 aa  409  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  45.55 
 
 
590 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  49.06 
 
 
479 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  49.58 
 
 
480 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  48.07 
 
 
482 aa  405  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  45.59 
 
 
476 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  46.84 
 
 
482 aa  404  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  46.35 
 
 
472 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  45.45 
 
 
582 aa  403  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  43.86 
 
 
580 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  46.35 
 
 
472 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  46.47 
 
 
472 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  46.35 
 
 
472 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  47.12 
 
 
481 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  45.63 
 
 
476 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  46.37 
 
 
476 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  46.47 
 
 
472 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  47.42 
 
 
482 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  45.85 
 
 
477 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  46.81 
 
 
476 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  47.57 
 
 
483 aa  396  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  44.64 
 
 
471 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  45.91 
 
 
479 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  47.9 
 
 
585 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  45.61 
 
 
474 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  46.15 
 
 
474 aa  398  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  46.93 
 
 
586 aa  395  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  44.75 
 
 
477 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1294  pyruvate kinase  47.76 
 
 
472 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  46.27 
 
 
471 aa  392  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0351  pyruvate kinase  45.78 
 
 
467 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0288145  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0342  pyruvate kinase  45.36 
 
 
467 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  46.27 
 
 
481 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  45.24 
 
 
496 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2490  pyruvate kinase  46.25 
 
 
476 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  45.55 
 
 
477 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  47.77 
 
 
472 aa  391  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  46.3 
 
 
472 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1688  pyruvate kinase  45.38 
 
 
496 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000849836 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  43.49 
 
 
474 aa  391  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4190  pyruvate kinase  43.16 
 
 
476 aa  389  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.85429 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  45.55 
 
 
477 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  45.7 
 
 
487 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  47.44 
 
 
480 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>