More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0005 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  100 
 
 
482 aa  979    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  66.17 
 
 
474 aa  616  1e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  64.33 
 
 
474 aa  596  1e-169  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  51.17 
 
 
471 aa  459  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  51.16 
 
 
476 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  48.07 
 
 
583 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  47.25 
 
 
584 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  49.68 
 
 
582 aa  441  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  50 
 
 
474 aa  437  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  49.36 
 
 
471 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  47.55 
 
 
583 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  50 
 
 
476 aa  435  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  49.15 
 
 
476 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  48.61 
 
 
585 aa  432  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  48.02 
 
 
492 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  49.36 
 
 
477 aa  430  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  48.12 
 
 
481 aa  428  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  48.95 
 
 
478 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  47.46 
 
 
580 aa  429  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  49.58 
 
 
478 aa  429  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  47.48 
 
 
479 aa  428  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  48.3 
 
 
594 aa  427  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  48.22 
 
 
474 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  47.66 
 
 
578 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  50.42 
 
 
479 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  47.11 
 
 
477 aa  423  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  47.54 
 
 
585 aa  423  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  47.81 
 
 
492 aa  425  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  47.35 
 
 
479 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  48.42 
 
 
472 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  47.29 
 
 
481 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  46.58 
 
 
583 aa  425  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  48.21 
 
 
472 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  44.65 
 
 
485 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  48.21 
 
 
480 aa  420  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  47.16 
 
 
472 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  48.3 
 
 
471 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  48.93 
 
 
582 aa  421  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  48.21 
 
 
483 aa  420  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  47.16 
 
 
472 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  45.06 
 
 
485 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  47.16 
 
 
472 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  47.21 
 
 
487 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  46.82 
 
 
478 aa  418  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  47.15 
 
 
472 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  46.23 
 
 
476 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  47.98 
 
 
477 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  46.51 
 
 
472 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  48.3 
 
 
588 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  46.57 
 
 
478 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  48.39 
 
 
471 aa  413  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  49.47 
 
 
483 aa  415  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  46.84 
 
 
488 aa  415  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  43.55 
 
 
474 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  46.45 
 
 
581 aa  415  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  47.07 
 
 
474 aa  415  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  47.98 
 
 
477 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  45.89 
 
 
472 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  47.86 
 
 
482 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  44.99 
 
 
580 aa  412  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  45.61 
 
 
596 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  45.3 
 
 
596 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2959  pyruvate kinase  47.65 
 
 
505 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  47.13 
 
 
480 aa  412  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  47.44 
 
 
479 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  47.37 
 
 
480 aa  412  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  45.68 
 
 
585 aa  409  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  48.73 
 
 
587 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  46.72 
 
 
472 aa  408  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  46.19 
 
 
478 aa  411  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  45.3 
 
 
597 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  43.13 
 
 
474 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1080  pyruvate kinase  48.51 
 
 
481 aa  409  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  45.72 
 
 
596 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  47.55 
 
 
474 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  47.15 
 
 
471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  47.54 
 
 
472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  47.27 
 
 
601 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  46.93 
 
 
471 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2490  pyruvate kinase  45.77 
 
 
476 aa  407  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3590  pyruvate kinase  47.86 
 
 
479 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768977  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  46.71 
 
 
497 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  45.11 
 
 
580 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  46.79 
 
 
482 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  46.57 
 
 
478 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  47.15 
 
 
471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  46.57 
 
 
477 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  46.93 
 
 
471 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  46.61 
 
 
487 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5699  pyruvate kinase  47.49 
 
 
493 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  47.22 
 
 
600 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  47.86 
 
 
484 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1678  pyruvate kinase  48.52 
 
 
471 aa  402  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0855403  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  46.48 
 
 
472 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  47.64 
 
 
470 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5259  pyruvate kinase  45.92 
 
 
484 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  45.84 
 
 
472 aa  403  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  46.41 
 
 
585 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  47.21 
 
 
484 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  47.21 
 
 
484 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>