More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0004 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  83.33 
 
 		 474 aa  793    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  100 
 
 		 474 aa  946    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  66.17 
 
 		 482 aa  616  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  51.39 
 
 		 471 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  51.17 
 
 		 582 aa  449  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  51.8 
 
 		 476 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  50.42 
 
 		 594 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  48.83 
 
 		 585 aa  444  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  48.51 
 
 		 583 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  49.79 
 
 		 479 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  51.37 
 
 		 476 aa  435  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  49.68 
 
 		 474 aa  433  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  48.1 
 
 		 590 aa  430  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  47.57 
 
 		 589 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  48.52 
 
 		 583 aa  431  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  47.56 
 
 		 584 aa  431  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  48.83 
 
 		 488 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  49.89 
 
 		 477 aa  430  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  52.22 
 
 		 476 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  49.38 
 
 		 487 aa  431  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  45.86 
 
 		 580 aa  429  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  48.61 
 
 		 487 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  48.42 
 
 		 601 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  50.95 
 
 		 478 aa  428  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  49.58 
 
 		 478 aa  428  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  45.96 
 
 		 583 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  49.26 
 
 		 494 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  47.99 
 
 		 492 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  47.88 
 
 		 585 aa  419  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  50.64 
 
 		 471 aa  418  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  48.51 
 
 		 578 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  48.09 
 
 		 600 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  48.94 
 
 		 472 aa  421  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  49.36 
 
 		 588 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  47.78 
 
 		 492 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1678  pyruvate kinase  51.39 
 
 		 471 aa  420  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0855403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  50.63 
 
 		 474 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  48.63 
 
 		 587 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  49.15 
 
 		 596 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  48.1 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  49.36 
 
 		 472 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  47.46 
 
 		 585 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  47.46 
 
 		 585 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  47.15 
 
 		 477 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  48.09 
 
 		 483 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  48.93 
 
 		 479 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  48.63 
 
 		 482 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  46.28 
 
 		 580 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  48.63 
 
 		 472 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  49.36 
 
 		 472 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  48.63 
 
 		 482 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  49.36 
 
 		 472 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  49.05 
 
 		 481 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  47.03 
 
 		 585 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  47.25 
 
 		 585 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  47.25 
 
 		 585 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  47.25 
 
 		 585 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  47.45 
 
 		 478 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  47.25 
 
 		 585 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  47.25 
 
 		 585 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  47.45 
 
 		 478 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  47.03 
 
 		 585 aa  413  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  49.26 
 
 		 587 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  47.48 
 
 		 580 aa  412  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  47.25 
 
 		 585 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  48.73 
 
 		 472 aa  414  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  49.05 
 
 		 481 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  47.27 
 
 		 485 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  48.61 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  46.64 
 
 		 485 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  48.2 
 
 		 497 aa  411  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  47.45 
 
 		 597 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  46.72 
 
 		 477 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  46.72 
 
 		 477 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  47.45 
 
 		 596 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  48.61 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2215  pyruvate kinase  50 
 
 		 474 aa  411  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  48.94 
 
 		 471 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  47.02 
 
 		 582 aa  410  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  49.68 
 
 		 483 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  47.99 
 
 		 471 aa  410  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  48.39 
 
 		 471 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  48.72 
 
 		 477 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  47.45 
 
 		 596 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  49.68 
 
 		 479 aa  409  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  48.09 
 
 		 474 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  47.36 
 
 		 592 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  48.39 
 
 		 471 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  43.74 
 
 		 590 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14930  pyruvate kinase  49.26 
 
 		 489 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  48.41 
 
 		 472 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11633  pyruvate kinase  46.84 
 
 		 472 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.104788 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  48.72 
 
 		 477 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  47.36 
 
 		 592 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  45.13 
 
 		 585 aa  405  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  48.09 
 
 		 472 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3595  pyruvate kinase  47.46 
 
 		 477 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103054 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  47.47 
 
 		 586 aa  402  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  47.54 
 
 		 471 aa  405  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  49.68 
 
 		 478 aa  404  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>