More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2900 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  100 
 
 		 474 aa  960    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  53.8 
 
 		 584 aa  509  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1040  pyruvate kinase  55.34 
 
 		 480 aa  498  1e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  53.8 
 
 		 583 aa  487  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  52.97 
 
 		 585 aa  483  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  50.11 
 
 		 582 aa  471  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2535  pyruvate kinase  50.63 
 
 		 471 aa  466  9.999999999999999e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0129939  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  52.55 
 
 		 585 aa  463  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  51.7 
 
 		 585 aa  464  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  50.85 
 
 		 583 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  52.55 
 
 		 585 aa  463  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  51.59 
 
 		 580 aa  464  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  49.47 
 
 		 580 aa  460  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  50.31 
 
 		 588 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  50.11 
 
 		 587 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  51.37 
 
 		 585 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  50.42 
 
 		 585 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  50.42 
 
 		 585 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  50.42 
 
 		 585 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  50.42 
 
 		 585 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  50.42 
 
 		 590 aa  450  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  50.42 
 
 		 585 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  50.42 
 
 		 585 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  50.11 
 
 		 578 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  50.42 
 
 		 585 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  49.47 
 
 		 583 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  50.42 
 
 		 585 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  50 
 
 		 585 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  48 
 
 		 580 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  50.11 
 
 		 577 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  50.21 
 
 		 585 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  49.06 
 
 		 474 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  48.85 
 
 		 474 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1115  pyruvate kinase  47.63 
 
 		 490 aa  440  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000141137  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  46.62 
 
 		 581 aa  433  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  47.35 
 
 		 582 aa  428  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  47.59 
 
 		 474 aa  425  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2441  pyruvate kinase  47.33 
 
 		 470 aa  423  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0413  pyruvate kinase  47.95 
 
 		 479 aa  422  1e-117  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2879  pyruvate kinase  48.4 
 
 		 469 aa  422  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.357906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2744  pyruvate kinase  47.44 
 
 		 491 aa  421  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000110572  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  46.09 
 
 		 478 aa  415  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  47.25 
 
 		 472 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01645  pyruvate kinase  47.35 
 
 		 470 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000322143  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1966  pyruvate kinase  47.35 
 
 		 470 aa  414  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000099684  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1511  pyruvate kinase  47.77 
 
 		 470 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00345195  hitchhiker  0.00000000277605 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1964  pyruvate kinase  47.77 
 
 		 470 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000120282  hitchhiker  0.00000000245997 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1892  pyruvate kinase  47.35 
 
 		 470 aa  414  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024147  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1664  pyruvate kinase  47.61 
 
 		 469 aa  413  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000486614  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1702  pyruvate kinase  47.81 
 
 		 470 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000472586  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1757  pyruvate kinase  47.35 
 
 		 470 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.18747e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1955  pyruvate kinase  47.35 
 
 		 470 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000401811  unclonable  0.000000014136 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1793  pyruvate kinase  47.77 
 
 		 470 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000263395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01635  hypothetical protein  47.35 
 
 		 470 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000427708  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2390  pyruvate kinase  47.35 
 
 		 470 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000743671  hitchhiker  0.0000173681 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1520  pyruvate kinase  47.35 
 
 		 470 aa  414  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000224591  decreased coverage  0.00000000336273 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0882  pyruvate kinase  45.49 
 
 		 589 aa  413  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.441073  hitchhiker  0.000000000000201084 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1877  pyruvate kinase  47.35 
 
 		 470 aa  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180077  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1491  pyruvate kinase  47.77 
 
 		 470 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0197868  hitchhiker  0.00000000000000413859 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1475  pyruvate kinase  47.77 
 
 		 470 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.0298859 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001645  pyruvate kinase  49.12 
 
 		 470 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000413201  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2701  pyruvate kinase  46.7 
 
 		 470 aa  409  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1768  pyruvate kinase  47.68 
 
 		 473 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000514797  unclonable  0.00000209228 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0351  pyruvate kinase  46.99 
 
 		 467 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0288145  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0342  pyruvate kinase  46.57 
 
 		 467 aa  408  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0751  pyruvate kinase  46.01 
 
 		 473 aa  410  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000115769  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00829  pyruvate kinase  48.46 
 
 		 470 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1749  pyruvate kinase  46.72 
 
 		 470 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.39981e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2187  pyruvate kinase  47.15 
 
 		 470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545007  hitchhiker  0.000000575338 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0037  pyruvate kinase  48.68 
 
 		 470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1855  pyruvate kinase  46.72 
 
 		 470 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000869854  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  46.19 
 
 		 586 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2582  pyruvate kinase  46.72 
 
 		 470 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00785837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  45.63 
 
 		 585 aa  405  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  44.73 
 
 		 594 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  45.36 
 
 		 479 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1716  pyruvate kinase  46.85 
 
 		 469 aa  402  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  46.25 
 
 		 471 aa  402  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  43.52 
 
 		 582 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  44.23 
 
 		 592 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  44.23 
 
 		 592 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  46.3 
 
 		 481 aa  396  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  44.23 
 
 		 494 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  44 
 
 		 509 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  44.92 
 
 		 587 aa  393  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  41.95 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  45.36 
 
 		 605 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  45.45 
 
 		 481 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  43.04 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  43.49 
 
 		 483 aa  391  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  45.73 
 
 		 480 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  44.49 
 
 		 597 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  45.13 
 
 		 596 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  42.61 
 
 		 472 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  43.43 
 
 		 589 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  42.61 
 
 		 472 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  43.43 
 
 		 590 aa  385  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  44.12 
 
 		 601 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  42.62 
 
 		 485 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  42.37 
 
 		 600 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>