More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4428 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  100 
 
 
471 aa  951    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  51.17 
 
 
482 aa  466  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  49.89 
 
 
584 aa  457  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  50.43 
 
 
583 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  49.58 
 
 
585 aa  444  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  50.21 
 
 
588 aa  445  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  53.29 
 
 
474 aa  442  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  52.01 
 
 
480 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  50.53 
 
 
587 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  51.38 
 
 
477 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  51.17 
 
 
476 aa  436  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  47.9 
 
 
580 aa  438  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  48.09 
 
 
585 aa  436  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  49.79 
 
 
480 aa  435  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  48.73 
 
 
585 aa  435  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  48.52 
 
 
585 aa  433  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  48.73 
 
 
585 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  49.15 
 
 
585 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  48.52 
 
 
585 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  48.52 
 
 
585 aa  432  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  48.52 
 
 
585 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  50.21 
 
 
478 aa  433  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  49.15 
 
 
585 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  48.52 
 
 
585 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  50.63 
 
 
478 aa  434  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  48.52 
 
 
585 aa  434  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  47.01 
 
 
476 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  48.73 
 
 
585 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  48.52 
 
 
585 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  47.32 
 
 
472 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  51.36 
 
 
479 aa  433  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2959  pyruvate kinase  51.7 
 
 
505 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  47.86 
 
 
578 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  47.98 
 
 
585 aa  429  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4234  pyruvate kinase  51.37 
 
 
489 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  51.6 
 
 
471 aa  431  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  45.78 
 
 
474 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  45.57 
 
 
474 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  50.53 
 
 
476 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  47.32 
 
 
472 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  50 
 
 
487 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2215  pyruvate kinase  50.85 
 
 
474 aa  422  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4367  pyruvate kinase  50.53 
 
 
489 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  47.12 
 
 
583 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  50.63 
 
 
491 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4390  pyruvate kinase  50.32 
 
 
489 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  48.4 
 
 
582 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  49.04 
 
 
471 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  49.47 
 
 
480 aa  425  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  49.57 
 
 
583 aa  422  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  49.89 
 
 
476 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  50.11 
 
 
474 aa  420  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1080  pyruvate kinase  48.62 
 
 
481 aa  418  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  48.82 
 
 
471 aa  421  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14930  pyruvate kinase  51.05 
 
 
489 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  47.55 
 
 
482 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  50.11 
 
 
496 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  48.94 
 
 
474 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  49.79 
 
 
480 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  46.58 
 
 
577 aa  415  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  45.11 
 
 
580 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1221  pyruvate kinase  47.98 
 
 
472 aa  410  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.724591  normal  0.678636 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  49.68 
 
 
474 aa  410  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  44.44 
 
 
581 aa  408  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0351  pyruvate kinase  46.17 
 
 
467 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0288145  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0342  pyruvate kinase  45.96 
 
 
467 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5699  pyruvate kinase  47.84 
 
 
493 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  47.22 
 
 
596 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  47.61 
 
 
472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  47.12 
 
 
494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  47.22 
 
 
597 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001645  pyruvate kinase  46.61 
 
 
470 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000413201  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  48.22 
 
 
481 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  48.01 
 
 
481 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  45.32 
 
 
590 aa  407  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1505  pyruvate kinase  47.15 
 
 
478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.33251  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  46.27 
 
 
482 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  47.22 
 
 
596 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0037  pyruvate kinase  46.4 
 
 
470 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  46.97 
 
 
479 aa  402  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3804  pyruvate kinase  46.7 
 
 
476 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1688  pyruvate kinase  49.68 
 
 
496 aa  403  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000849836 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  47.13 
 
 
474 aa  403  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  47.44 
 
 
596 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  47.01 
 
 
605 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  44.8 
 
 
590 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  47.19 
 
 
472 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1917  pyruvate kinase  45.05 
 
 
478 aa  400  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  46.01 
 
 
600 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  45.09 
 
 
485 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  45.11 
 
 
589 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  49.16 
 
 
483 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  46.7 
 
 
594 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  46.62 
 
 
472 aa  399  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  46.37 
 
 
580 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  46.58 
 
 
509 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  45.44 
 
 
580 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1850  pyruvate kinase  46.25 
 
 
474 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.117078  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00829  pyruvate kinase  45.97 
 
 
470 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  45.51 
 
 
485 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>