More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4190 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4190  pyruvate kinase  100 
 
 		 476 aa  978    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.85429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3378  pyruvate kinase  53.04 
 
 		 479 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4063  pyruvate kinase  51.66 
 
 		 488 aa  499  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03130  pyruvate kinase  51.16 
 
 		 476 aa  494  9.999999999999999e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0435027  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1063  pyruvate kinase  51.38 
 
 		 488 aa  488  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.175798  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1400  pyruvate kinase  49.15 
 
 		 470 aa  485  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1420  hypothetical protein  49.89 
 
 		 461 aa  484  1e-135  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1209  hypothetical protein  49.04 
 
 		 481 aa  484  1e-135  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000430892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2321  pyruvate kinase  47.97 
 
 		 496 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1141  pyruvate kinase  47.68 
 
 		 477 aa  462  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  48.12 
 
 		 479 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  43.62 
 
 		 485 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  43.62 
 
 		 485 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  43.4 
 
 		 583 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  43.72 
 
 		 594 aa  410  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  46.2 
 
 		 480 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  42.92 
 
 		 585 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  47.15 
 
 		 480 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  43.16 
 
 		 483 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  43.99 
 
 		 481 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  44.98 
 
 		 476 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  41.95 
 
 		 582 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  43.99 
 
 		 481 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  42.49 
 
 		 584 aa  396  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  43.62 
 
 		 581 aa  397  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  41.83 
 
 		 578 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  45.45 
 
 		 480 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  42.58 
 
 		 583 aa  392  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  43.25 
 
 		 476 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  46.68 
 
 		 480 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  42.49 
 
 		 597 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  41.4 
 
 		 582 aa  392  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  41.53 
 
 		 482 aa  389  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  42.41 
 
 		 580 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  42.49 
 
 		 596 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  41.89 
 
 		 494 aa  388  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  43.68 
 
 		 477 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  43.91 
 
 		 487 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  42.28 
 
 		 596 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  42.71 
 
 		 596 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  43.04 
 
 		 474 aa  386  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  41.28 
 
 		 586 aa  382  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  43.07 
 
 		 478 aa  385  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  43.8 
 
 		 474 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  43.24 
 
 		 601 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 587 aa  383  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  40.93 
 
 		 588 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  43.62 
 
 		 471 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  42.18 
 
 		 585 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  42.11 
 
 		 592 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  42.49 
 
 		 482 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  41.28 
 
 		 589 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  42.27 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  42.11 
 
 		 592 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  43.8 
 
 		 478 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  40.98 
 
 		 474 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  42.89 
 
 		 605 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  42.32 
 
 		 472 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  42.49 
 
 		 482 aa  376  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  42.53 
 
 		 472 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  41.42 
 
 		 471 aa  378  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  41.01 
 
 		 590 aa  375  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  41.74 
 
 		 478 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2490  pyruvate kinase  42.49 
 
 		 476 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  40.51 
 
 		 477 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  41.36 
 
 		 476 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  41.19 
 
 		 577 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  40.98 
 
 		 587 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  42 
 
 		 474 aa  373  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  40.3 
 
 		 585 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  41.36 
 
 		 583 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  41.58 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  41.56 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  42.41 
 
 		 483 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  41.85 
 
 		 474 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1080  pyruvate kinase  40.99 
 
 		 481 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  42 
 
 		 472 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2959  pyruvate kinase  43.56 
 
 		 505 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  44.23 
 
 		 491 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  40.3 
 
 		 585 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  43.43 
 
 		 479 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  40.98 
 
 		 471 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2535  pyruvate kinase  40.38 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0129939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  40.08 
 
 		 585 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  40.08 
 
 		 585 aa  368  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  40.08 
 
 		 585 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5699  pyruvate kinase  43.4 
 
 		 493 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  40.76 
 
 		 474 aa  365  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  40.08 
 
 		 585 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  40.08 
 
 		 585 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  42.58 
 
 		 477 aa  368  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  40.09 
 
 		 477 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  40.94 
 
 		 475 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  40.09 
 
 		 477 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  40.98 
 
 		 471 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11633  pyruvate kinase  40.99 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.104788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  40.64 
 
 		 600 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  40.08 
 
 		 585 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  40.98 
 
 		 471 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  40.38 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>