More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3378 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4063  pyruvate kinase  70.86 
 
 		 488 aa  713    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3378  pyruvate kinase  100 
 
 		 479 aa  980    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1400  pyruvate kinase  53.44 
 
 		 470 aa  512  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1209  hypothetical protein  52.95 
 
 		 481 aa  511  1e-143  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000430892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4190  pyruvate kinase  53.04 
 
 		 476 aa  492  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.85429 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1420  hypothetical protein  51.83 
 
 		 461 aa  486  1e-136  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2321  pyruvate kinase  48.54 
 
 		 496 aa  458  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1063  pyruvate kinase  48.67 
 
 		 488 aa  441  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.175798  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1141  pyruvate kinase  46.38 
 
 		 477 aa  428  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  45.76 
 
 		 479 aa  423  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  46.4 
 
 		 481 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  46.19 
 
 		 481 aa  418  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03130  pyruvate kinase  45.87 
 
 		 476 aa  418  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0435027  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  44.63 
 
 		 578 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  42.32 
 
 		 583 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  44.42 
 
 		 471 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  43.66 
 
 		 588 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  43.24 
 
 		 478 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  42.35 
 
 		 583 aa  393  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  43.51 
 
 		 587 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  43.72 
 
 		 585 aa  393  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  42.65 
 
 		 585 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  43.72 
 
 		 479 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  42.65 
 
 		 585 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  43.19 
 
 		 585 aa  390  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  44.12 
 
 		 474 aa  387  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  45.97 
 
 		 480 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  44.65 
 
 		 480 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  42.29 
 
 		 581 aa  384  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  41.68 
 
 		 583 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  42.83 
 
 		 478 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  41.53 
 
 		 482 aa  379  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  42.56 
 
 		 584 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0913  pyruvate kinase  43.96 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00173367  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  40.42 
 
 		 582 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  43.61 
 
 		 474 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  45.19 
 
 		 480 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  41.84 
 
 		 577 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  39.58 
 
 		 582 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  44.09 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  40.97 
 
 		 580 aa  373  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  44.35 
 
 		 491 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  43.01 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  42.77 
 
 		 476 aa  366  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  40.71 
 
 		 485 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  40.63 
 
 		 476 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  39.92 
 
 		 580 aa  366  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  42.74 
 
 		 483 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  42.98 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  42.35 
 
 		 477 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4234  pyruvate kinase  44.23 
 
 		 489 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  42.53 
 
 		 474 aa  368  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  42.36 
 
 		 596 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  41.13 
 
 		 485 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4367  pyruvate kinase  44.23 
 
 		 489 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2490  pyruvate kinase  42.62 
 
 		 476 aa  364  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  41.94 
 
 		 597 aa  364  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  42.41 
 
 		 482 aa  364  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  44.76 
 
 		 587 aa  363  3e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  41.94 
 
 		 596 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4390  pyruvate kinase  44.03 
 
 		 489 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  42.15 
 
 		 594 aa  362  6e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  43.79 
 
 		 471 aa  362  7.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  42.05 
 
 		 585 aa  362  9e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  41.42 
 
 		 585 aa  362  1e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  41.44 
 
 		 482 aa  361  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  43.94 
 
 		 601 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  42.23 
 
 		 478 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  41.96 
 
 		 585 aa  360  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  41.96 
 
 		 585 aa  360  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  41.96 
 
 		 596 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  40.96 
 
 		 590 aa  360  5e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  41.23 
 
 		 476 aa  359  6e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  43.51 
 
 		 480 aa  359  6e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  41.21 
 
 		 476 aa  359  7e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  41.54 
 
 		 477 aa  359  7e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5699  pyruvate kinase  41.91 
 
 		 493 aa  359  7e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  40.5 
 
 		 509 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  41.34 
 
 		 590 aa  358  1.9999999999999998e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  40.79 
 
 		 492 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1221  pyruvate kinase  41.91 
 
 		 472 aa  356  3.9999999999999996e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.724591  normal  0.678636 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  40.5 
 
 		 580 aa  356  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  42.83 
 
 		 472 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  42.83 
 
 		 472 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  42.83 
 
 		 472 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  40.89 
 
 		 471 aa  356  5e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  42.02 
 
 		 472 aa  356  5e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  40.79 
 
 		 492 aa  356  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  43.84 
 
 		 589 aa  355  6.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  42.02 
 
 		 472 aa  355  7.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  42.02 
 
 		 476 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  41.09 
 
 		 474 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>