More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3482 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  76.38 
 
 		 487 aa  739    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  76.6 
 
 		 488 aa  733    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  99.19 
 
 		 492 aa  973    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  100 
 
 		 492 aa  983    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  61.36 
 
 		 472 aa  588  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  60.85 
 
 		 477 aa  578  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  60.43 
 
 		 477 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4478  pyruvate kinase  61.7 
 
 		 471 aa  574  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  60.68 
 
 		 478 aa  570  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  61.02 
 
 		 472 aa  566  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  60.04 
 
 		 478 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1294  pyruvate kinase  61.91 
 
 		 472 aa  558  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  60.21 
 
 		 474 aa  558  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6869  pyruvate kinase  60.13 
 
 		 478 aa  558  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  61.32 
 
 		 479 aa  557  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  61.15 
 
 		 472 aa  554  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  60.64 
 
 		 478 aa  553  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  58.9 
 
 		 477 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  57.84 
 
 		 477 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  58.26 
 
 		 475 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  57.84 
 
 		 477 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1165  pyruvate kinase  56.57 
 
 		 478 aa  542  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3256  pyruvate kinase  57.23 
 
 		 478 aa  539  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496485  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1748  pyruvate kinase  57.02 
 
 		 478 aa  536  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1688  pyruvate kinase  57.02 
 
 		 478 aa  536  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  56.9 
 
 		 479 aa  534  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  55.96 
 
 		 478 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3590  pyruvate kinase  56.69 
 
 		 479 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768977  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  57.17 
 
 		 497 aa  521  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  56.38 
 
 		 478 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  58.35 
 
 		 484 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  56.81 
 
 		 470 aa  524  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  57.26 
 
 		 476 aa  524  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  56.8 
 
 		 471 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  59.02 
 
 		 479 aa  521  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1638  pyruvate kinase  57.29 
 
 		 484 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3289  pyruvate kinase  56.48 
 
 		 479 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  56.8 
 
 		 471 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  57.02 
 
 		 471 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  57.29 
 
 		 484 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0228  pyruvate kinase  55.42 
 
 		 482 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  56.37 
 
 		 471 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  56.8 
 
 		 471 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  57.05 
 
 		 477 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2276  pyruvate kinase  55.56 
 
 		 481 aa  517  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756319  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  57.05 
 
 		 477 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3690  pyruvate kinase  55.67 
 
 		 479 aa  515  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  57.08 
 
 		 484 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1766  pyruvate kinase  56.2 
 
 		 481 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0128  pyruvate kinase  56.6 
 
 		 478 aa  512  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.324584 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0412  pyruvate kinase  56.41 
 
 		 481 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2486  pyruvate kinase  55.77 
 
 		 481 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  55.27 
 
 		 483 aa  508  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2773  pyruvate kinase  57.24 
 
 		 471 aa  508  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0467936  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  55.3 
 
 		 470 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2308  pyruvate kinase  54.72 
 
 		 473 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2971  pyruvate kinase  55.56 
 
 		 478 aa  502  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2866  pyruvate kinase  55.56 
 
 		 478 aa  502  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2744  pyruvate kinase  55.34 
 
 		 483 aa  501  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0432  pyruvate kinase  54.84 
 
 		 484 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0447  pyruvate kinase  53.52 
 
 		 482 aa  496  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2516  pyruvate kinase  54.27 
 
 		 481 aa  494  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  55.32 
 
 		 475 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3121  pyruvate kinase  55.18 
 
 		 485 aa  488  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0341  pyruvate kinase  53.85 
 
 		 484 aa  484  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0955496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  54.66 
 
 		 470 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  53.6 
 
 		 470 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2104  pyruvate kinase  54.66 
 
 		 470 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1446  pyruvate kinase  54.66 
 
 		 470 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2370  pyruvate kinase  51.69 
 
 		 518 aa  472  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  52.54 
 
 		 475 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5564  pyruvate kinase  51.48 
 
 		 472 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0655  pyruvate kinase  53.81 
 
 		 470 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5259  pyruvate kinase  53.3 
 
 		 484 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1443  pyruvate kinase  54.06 
 
 		 476 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9118  pyruvate kinase  52.1 
 
 		 477 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0558  pyruvate kinase  49.79 
 
 		 473 aa  440  9.999999999999999e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  49.25 
 
 		 474 aa  434  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  47.81 
 
 		 482 aa  425  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  47.78 
 
 		 474 aa  420  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22404  pyruvate kinase 1  46.91 
 
 		 591 aa  419  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.529919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  45.57 
 
 		 578 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  43.96 
 
 		 584 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  48.71 
 
 		 476 aa  396  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  42.95 
 
 		 585 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  42.95 
 
 		 583 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  45.55 
 
 		 474 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  43.5 
 
 		 587 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  42.13 
 
 		 588 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  42.25 
 
 		 583 aa  385  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  44.49 
 
 		 600 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  43.27 
 
 		 580 aa  383  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  45.42 
 
 		 585 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5699  pyruvate kinase  44.79 
 
 		 493 aa  382  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  47.33 
 
 		 476 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  45.61 
 
 		 582 aa  381  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  45.38 
 
 		 471 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  47.33 
 
 		 471 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  42.18 
 
 		 583 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  45.45 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>