More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1568 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  100 
 
 		 471 aa  947    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  90.45 
 
 		 471 aa  872    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  98.73 
 
 		 471 aa  936    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2773  pyruvate kinase  83.19 
 
 		 471 aa  781    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0467936  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  99.58 
 
 		 471 aa  944    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  78.94 
 
 		 477 aa  753    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  79.15 
 
 		 477 aa  755    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2308  pyruvate kinase  89.57 
 
 		 473 aa  852    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  100 
 
 		 471 aa  947    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  59.32 
 
 		 472 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  61.8 
 
 		 479 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1294  pyruvate kinase  60.6 
 
 		 472 aa  547  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  60.04 
 
 		 472 aa  543  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  56.53 
 
 		 487 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  56.96 
 
 		 488 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  58.46 
 
 		 478 aa  526  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  57.02 
 
 		 492 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  55.41 
 
 		 472 aa  520  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4478  pyruvate kinase  55.94 
 
 		 471 aa  521  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  56.8 
 
 		 492 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  55.08 
 
 		 477 aa  509  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  54.64 
 
 		 474 aa  510  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  55.29 
 
 		 477 aa  509  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2276  pyruvate kinase  53.53 
 
 		 481 aa  503  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756319  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  55.13 
 
 		 479 aa  494  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1165  pyruvate kinase  55.03 
 
 		 478 aa  496  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0341  pyruvate kinase  53.93 
 
 		 484 aa  495  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0955496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1688  pyruvate kinase  54.82 
 
 		 478 aa  489  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1748  pyruvate kinase  54.82 
 
 		 478 aa  489  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  54.21 
 
 		 476 aa  490  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2370  pyruvate kinase  52.14 
 
 		 518 aa  485  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0447  pyruvate kinase  52.99 
 
 		 482 aa  487  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  52.25 
 
 		 470 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3121  pyruvate kinase  54.86 
 
 		 485 aa  483  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  54.31 
 
 		 484 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  53.35 
 
 		 478 aa  484  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1638  pyruvate kinase  54.31 
 
 		 484 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  54.74 
 
 		 484 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  52.92 
 
 		 478 aa  482  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0228  pyruvate kinase  52.99 
 
 		 482 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  55.36 
 
 		 479 aa  483  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  52.89 
 
 		 470 aa  484  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  54.09 
 
 		 484 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  52.89 
 
 		 470 aa  480  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3590  pyruvate kinase  53.63 
 
 		 479 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768977  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3256  pyruvate kinase  54.18 
 
 		 478 aa  480  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496485  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0412  pyruvate kinase  54.09 
 
 		 481 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1766  pyruvate kinase  54.09 
 
 		 481 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3690  pyruvate kinase  53.63 
 
 		 479 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  51.7 
 
 		 475 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5564  pyruvate kinase  51.06 
 
 		 472 aa  477  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2104  pyruvate kinase  53.53 
 
 		 470 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576742  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  52.27 
 
 		 477 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1446  pyruvate kinase  53.53 
 
 		 470 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  51.82 
 
 		 475 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  52.7 
 
 		 477 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3289  pyruvate kinase  53.21 
 
 		 479 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2486  pyruvate kinase  52.92 
 
 		 481 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  52.03 
 
 		 478 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  51.4 
 
 		 477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  52.27 
 
 		 475 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2516  pyruvate kinase  52.03 
 
 		 481 aa  468  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5259  pyruvate kinase  53.78 
 
 		 484 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  52.04 
 
 		 497 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6869  pyruvate kinase  53.78 
 
 		 478 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0655  pyruvate kinase  52.46 
 
 		 470 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0432  pyruvate kinase  51.93 
 
 		 484 aa  461  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  51.5 
 
 		 483 aa  464  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  50.32 
 
 		 478 aa  455  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2971  pyruvate kinase  51.61 
 
 		 478 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1443  pyruvate kinase  52.05 
 
 		 476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2744  pyruvate kinase  51.84 
 
 		 483 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2866  pyruvate kinase  51.39 
 
 		 478 aa  445  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9118  pyruvate kinase  49.57 
 
 		 477 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0558  pyruvate kinase  49.57 
 
 		 473 aa  436  1e-121  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  49.46 
 
 		 470 aa  432  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0128  pyruvate kinase  48.82 
 
 		 478 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.324584 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22404  pyruvate kinase 1  47.59 
 
 		 591 aa  424  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.529919  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  47.98 
 
 		 474 aa  413  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  48.61 
 
 		 474 aa  409  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  47.15 
 
 		 482 aa  407  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  41.98 
 
 		 580 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  40.72 
 
 		 583 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  43.88 
 
 		 582 aa  390  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  43.28 
 
 		 594 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  43.74 
 
 		 600 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  41.31 
 
 		 588 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  40.55 
 
 		 585 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  40.55 
 
 		 585 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  40.55 
 
 		 585 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  40.55 
 
 		 585 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  40.55 
 
 		 585 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  44.02 
 
 		 597 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  41.79 
 
 		 581 aa  382  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  40.98 
 
 		 585 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  40.55 
 
 		 585 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  40.55 
 
 		 585 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  39.92 
 
 		 585 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  44.26 
 
 		 472 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  43.59 
 
 		 596 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>