More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2486 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0228  pyruvate kinase  74.64 
 
 		 482 aa  699    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1766  pyruvate kinase  96.05 
 
 		 481 aa  931    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0447  pyruvate kinase  72.41 
 
 		 482 aa  694    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2486  pyruvate kinase  100 
 
 		 481 aa  966    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2516  pyruvate kinase  76.3 
 
 		 481 aa  726    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2276  pyruvate kinase  77.13 
 
 		 481 aa  746    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756319  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0412  pyruvate kinase  95.84 
 
 		 481 aa  929    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  57.05 
 
 		 477 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  56.84 
 
 		 477 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  56.84 
 
 		 477 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  57.48 
 
 		 476 aa  532  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  55.56 
 
 		 478 aa  527  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6869  pyruvate kinase  57.53 
 
 		 478 aa  525  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  56.41 
 
 		 475 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  56.62 
 
 		 488 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  55.56 
 
 		 478 aa  525  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  55.98 
 
 		 487 aa  521  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3256  pyruvate kinase  57.23 
 
 		 478 aa  521  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496485  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  54.87 
 
 		 497 aa  511  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  55.01 
 
 		 472 aa  512  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1165  pyruvate kinase  54.91 
 
 		 478 aa  514  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  55.98 
 
 		 492 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1294  pyruvate kinase  59.19 
 
 		 472 aa  514  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  55.98 
 
 		 470 aa  512  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  56.81 
 
 		 479 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  56.29 
 
 		 472 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  55.77 
 
 		 492 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  57.45 
 
 		 472 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4478  pyruvate kinase  55.56 
 
 		 471 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1748  pyruvate kinase  54.7 
 
 		 478 aa  508  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1688  pyruvate kinase  54.7 
 
 		 478 aa  508  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3690  pyruvate kinase  55.22 
 
 		 479 aa  507  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  54.7 
 
 		 477 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0341  pyruvate kinase  55.77 
 
 		 484 aa  502  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0955496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  54.49 
 
 		 477 aa  501  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  55.65 
 
 		 479 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  54.27 
 
 		 478 aa  497  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3590  pyruvate kinase  53.52 
 
 		 479 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768977  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  57.14 
 
 		 479 aa  497  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3121  pyruvate kinase  56.56 
 
 		 485 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  53.42 
 
 		 478 aa  488  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3289  pyruvate kinase  52.88 
 
 		 479 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  54.06 
 
 		 474 aa  483  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2866  pyruvate kinase  53.85 
 
 		 478 aa  480  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  53.42 
 
 		 478 aa  478  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  52.92 
 
 		 471 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2971  pyruvate kinase  53.21 
 
 		 478 aa  472  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  52.92 
 
 		 471 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0128  pyruvate kinase  53.32 
 
 		 478 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.324584 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  52.7 
 
 		 471 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  52.92 
 
 		 471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2744  pyruvate kinase  52.99 
 
 		 483 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  53.56 
 
 		 477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  53.35 
 
 		 477 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  51.84 
 
 		 471 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2370  pyruvate kinase  50.85 
 
 		 518 aa  464  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0432  pyruvate kinase  52.69 
 
 		 484 aa  462  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  52.1 
 
 		 483 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5564  pyruvate kinase  51.61 
 
 		 472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2773  pyruvate kinase  52.27 
 
 		 471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0467936  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  52.25 
 
 		 475 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  50.53 
 
 		 470 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  50.32 
 
 		 470 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2308  pyruvate kinase  49.68 
 
 		 473 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  50.96 
 
 		 470 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  51.18 
 
 		 484 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  50.97 
 
 		 484 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1638  pyruvate kinase  51.18 
 
 		 484 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  50.11 
 
 		 475 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  50.75 
 
 		 484 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5259  pyruvate kinase  50.97 
 
 		 484 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1443  pyruvate kinase  50.85 
 
 		 476 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1446  pyruvate kinase  50.54 
 
 		 470 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2104  pyruvate kinase  50.54 
 
 		 470 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0655  pyruvate kinase  50.32 
 
 		 470 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22404  pyruvate kinase 1  45.42 
 
 		 591 aa  412  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.529919  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9118  pyruvate kinase  48.53 
 
 		 477 aa  408  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0558  pyruvate kinase  47.9 
 
 		 473 aa  401  9.999999999999999e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  48.61 
 
 		 474 aa  392  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  46.81 
 
 		 474 aa  378  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  45.92 
 
 		 482 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  42.53 
 
 		 580 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  44.78 
 
 		 586 aa  365  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  45.61 
 
 		 471 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  44.56 
 
 		 474 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  41.53 
 
 		 476 aa  358  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  40.55 
 
 		 585 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  44 
 
 		 600 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  43.34 
 
 		 589 aa  355  6.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  43.78 
 
 		 480 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  42.92 
 
 		 594 aa  353  2.9999999999999997e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  40.34 
 
 		 585 aa  353  4e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  40.34 
 
 		 585 aa  353  4e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  42.71 
 
 		 590 aa  352  5.9999999999999994e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  40.34 
 
 		 585 aa  352  8e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  40.34 
 
 		 585 aa  352  8e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  40.34 
 
 		 585 aa  352  8e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  40.34 
 
 		 585 aa  352  8e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  40.34 
 
 		 585 aa  352  8e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  40.55 
 
 		 584 aa  350  3e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>