More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1402 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  93.71 
 
 		 477 aa  902    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3690  pyruvate kinase  66.38 
 
 		 479 aa  640    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  85.41 
 
 		 478 aa  822    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6869  pyruvate kinase  84.14 
 
 		 478 aa  797    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  96.02 
 
 		 477 aa  925    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  91.77 
 
 		 475 aa  870    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  67.66 
 
 		 497 aa  646    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  100 
 
 		 477 aa  958    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  85.2 
 
 		 478 aa  820    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3256  pyruvate kinase  66.03 
 
 		 478 aa  636    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496485  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1165  pyruvate kinase  65.47 
 
 		 478 aa  639    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  66.95 
 
 		 479 aa  635    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_004310  BR1748  pyruvate kinase  65.61 
 
 		 478 aa  633  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1688  pyruvate kinase  65.61 
 
 		 478 aa  633  1e-180  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  63.24 
 
 		 476 aa  627  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3590  pyruvate kinase  64.83 
 
 		 479 aa  624  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768977  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3289  pyruvate kinase  64.83 
 
 		 479 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  65.96 
 
 		 470 aa  620  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2971  pyruvate kinase  65.74 
 
 		 478 aa  608  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2744  pyruvate kinase  65.53 
 
 		 483 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2866  pyruvate kinase  65.11 
 
 		 478 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  64.26 
 
 		 478 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  63.83 
 
 		 478 aa  599  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0128  pyruvate kinase  62.77 
 
 		 478 aa  588  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.324584 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  57.84 
 
 		 492 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  57.84 
 
 		 492 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  56.26 
 
 		 488 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  55.63 
 
 		 487 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  56.81 
 
 		 474 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2486  pyruvate kinase  56.84 
 
 		 481 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0412  pyruvate kinase  56.62 
 
 		 481 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  55.86 
 
 		 472 aa  533  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1766  pyruvate kinase  56.41 
 
 		 481 aa  535  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2276  pyruvate kinase  56.2 
 
 		 481 aa  534  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756319  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  55.58 
 
 		 478 aa  527  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  56.57 
 
 		 472 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0228  pyruvate kinase  56.72 
 
 		 482 aa  524  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2516  pyruvate kinase  56.2 
 
 		 481 aa  518  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  55.41 
 
 		 472 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  54.43 
 
 		 479 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0341  pyruvate kinase  54.27 
 
 		 484 aa  510  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0955496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4478  pyruvate kinase  54.78 
 
 		 471 aa  509  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0447  pyruvate kinase  54.16 
 
 		 482 aa  508  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3121  pyruvate kinase  55.91 
 
 		 485 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  52.77 
 
 		 477 aa  494  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  52.77 
 
 		 477 aa  494  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0432  pyruvate kinase  54.41 
 
 		 484 aa  491  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1294  pyruvate kinase  55.11 
 
 		 472 aa  487  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  53.29 
 
 		 479 aa  480  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2370  pyruvate kinase  50.95 
 
 		 518 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  51.28 
 
 		 477 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  52.05 
 
 		 471 aa  477  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  51.16 
 
 		 477 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  52.27 
 
 		 471 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  52.27 
 
 		 471 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  52.05 
 
 		 471 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  52.27 
 
 		 471 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2773  pyruvate kinase  52.05 
 
 		 471 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0467936  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  51.59 
 
 		 475 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1443  pyruvate kinase  53.09 
 
 		 476 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5259  pyruvate kinase  50.97 
 
 		 484 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2308  pyruvate kinase  50.64 
 
 		 473 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  51.05 
 
 		 484 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  50.84 
 
 		 484 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1638  pyruvate kinase  51.05 
 
 		 484 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  50.84 
 
 		 484 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  49.26 
 
 		 483 aa  458  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  49.79 
 
 		 470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5564  pyruvate kinase  49.15 
 
 		 472 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  50.53 
 
 		 470 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  50.11 
 
 		 470 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  50.32 
 
 		 475 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22404  pyruvate kinase 1  47.25 
 
 		 591 aa  436  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.529919  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1446  pyruvate kinase  50.75 
 
 		 470 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2104  pyruvate kinase  50.75 
 
 		 470 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576742  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0558  pyruvate kinase  49.04 
 
 		 473 aa  427  1e-118  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  48.41 
 
 		 474 aa  424  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0655  pyruvate kinase  50.11 
 
 		 470 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9118  pyruvate kinase  45.67 
 
 		 477 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  46.72 
 
 		 474 aa  409  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  46.35 
 
 		 482 aa  398  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  45.53 
 
 		 477 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  44.89 
 
 		 476 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  43.76 
 
 		 594 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  44.89 
 
 		 476 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  42.77 
 
 		 485 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  43.4 
 
 		 474 aa  385  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  44.16 
 
 		 476 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  40.64 
 
 		 581 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  41.95 
 
 		 584 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  42.77 
 
 		 485 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  40.04 
 
 		 585 aa  378  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  42.8 
 
 		 580 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  44.02 
 
 		 471 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  43.61 
 
 		 600 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  41.74 
 
 		 590 aa  371  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  43.79 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  41.95 
 
 		 601 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  43.01 
 
 		 582 aa  367  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  42.71 
 
 		 586 aa  365  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>