More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1461 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  69.98 
 
 		 476 aa  661    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  82.24 
 
 		 476 aa  800    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  100 
 
 		 474 aa  951    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  75.85 
 
 		 476 aa  725    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  70.19 
 
 		 477 aa  669    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1080  pyruvate kinase  65.03 
 
 		 481 aa  590  1e-167  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2959  pyruvate kinase  63.48 
 
 		 505 aa  580  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  61.67 
 
 		 478 aa  579  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  61.09 
 
 		 487 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2215  pyruvate kinase  62.92 
 
 		 474 aa  569  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3804  pyruvate kinase  62.05 
 
 		 476 aa  569  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  60.59 
 
 		 482 aa  566  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  61.44 
 
 		 474 aa  563  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  60.38 
 
 		 482 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  61.23 
 
 		 471 aa  556  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1221  pyruvate kinase  60.47 
 
 		 472 aa  555  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.724591  normal  0.678636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5699  pyruvate kinase  60.66 
 
 		 493 aa  554  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  59.49 
 
 		 472 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  60 
 
 		 474 aa  551  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  58.67 
 
 		 496 aa  548  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20690  pyruvate kinase  60.9 
 
 		 472 aa  545  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0604306  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  59.75 
 
 		 472 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  59.28 
 
 		 472 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  59.28 
 
 		 472 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  58.85 
 
 		 471 aa  546  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  59.28 
 
 		 472 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1678  pyruvate kinase  62.29 
 
 		 471 aa  538  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0855403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11020  pyruvate kinase  59.53 
 
 		 495 aa  537  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.887694  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1688  pyruvate kinase  58.89 
 
 		 496 aa  533  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000849836 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1505  pyruvate kinase  57.57 
 
 		 478 aa  532  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.33251  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  58.05 
 
 		 472 aa  528  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11633  pyruvate kinase  58 
 
 		 472 aa  531  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.104788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  58.44 
 
 		 477 aa  528  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14930  pyruvate kinase  59.31 
 
 		 489 aa  523  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  57.72 
 
 		 472 aa  524  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2490  pyruvate kinase  55.74 
 
 		 476 aa  508  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12930  pyruvate kinase  56.5 
 
 		 470 aa  488  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.18078  normal  0.227064 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0741  pyruvate kinase  50.93 
 
 		 480 aa  468  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.580936  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0607  pyruvate kinase  51.65 
 
 		 479 aa  459  9.999999999999999e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  50 
 
 		 482 aa  437  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  46.85 
 
 		 584 aa  432  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  50.96 
 
 		 474 aa  429  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  48.83 
 
 		 478 aa  423  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  49.89 
 
 		 479 aa  425  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  47.45 
 
 		 480 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  48.94 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  50.63 
 
 		 474 aa  419  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  46.17 
 
 		 480 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  47.49 
 
 		 582 aa  416  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  46.36 
 
 		 583 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  46.51 
 
 		 480 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  45.44 
 
 		 578 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  46.01 
 
 		 583 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  44.7 
 
 		 585 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  50.11 
 
 		 471 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  45.88 
 
 		 480 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  48.23 
 
 		 479 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  45 
 
 		 594 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  42.65 
 
 		 583 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  44.33 
 
 		 580 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  42.8 
 
 		 590 aa  396  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  47.67 
 
 		 474 aa  396  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  45.42 
 
 		 478 aa  396  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4234  pyruvate kinase  48.31 
 
 		 489 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  44.73 
 
 		 587 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  48.62 
 
 		 491 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  46.03 
 
 		 585 aa  396  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  45.55 
 
 		 472 aa  393  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  46.64 
 
 		 488 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  43.87 
 
 		 588 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4390  pyruvate kinase  47.46 
 
 		 489 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  44.47 
 
 		 478 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  45 
 
 		 600 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4367  pyruvate kinase  47.46 
 
 		 489 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  44.44 
 
 		 481 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3590  pyruvate kinase  45.67 
 
 		 479 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768977  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  47.03 
 
 		 487 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  42.47 
 
 		 476 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  45.17 
 
 		 479 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  43.43 
 
 		 580 aa  386  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  44.44 
 
 		 481 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  45.63 
 
 		 582 aa  386  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  46.7 
 
 		 470 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  42.64 
 
 		 580 aa  386  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  43.4 
 
 		 477 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  44.68 
 
 		 478 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  43.49 
 
 		 509 aa  382  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  42.37 
 
 		 582 aa  383  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  42.98 
 
 		 585 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  42.98 
 
 		 585 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  42.77 
 
 		 585 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  42.77 
 
 		 585 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  42.77 
 
 		 585 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  44.84 
 
 		 483 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  42.77 
 
 		 585 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3289  pyruvate kinase  45.03 
 
 		 479 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  42.98 
 
 		 585 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  43.83 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  43.1 
 
 		 585 aa  382  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  43.04 
 
 		 596 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>