More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1519 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  100 
 
 		 472 aa  939    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  62.85 
 
 		 472 aa  607  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  64.27 
 
 		 472 aa  586  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  61.44 
 
 		 488 aa  585  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  61.23 
 
 		 487 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4478  pyruvate kinase  61.02 
 
 		 471 aa  573  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  60.89 
 
 		 492 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  61.1 
 
 		 492 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  59.32 
 
 		 471 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  60.85 
 
 		 479 aa  571  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  59.11 
 
 		 471 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  59.32 
 
 		 471 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  59.75 
 
 		 477 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  58.9 
 
 		 471 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  59.53 
 
 		 477 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  58.47 
 
 		 471 aa  561  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  60.59 
 
 		 478 aa  560  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  59.32 
 
 		 477 aa  553  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1294  pyruvate kinase  62.08 
 
 		 472 aa  553  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  59.53 
 
 		 477 aa  554  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  58.26 
 
 		 476 aa  548  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  58.05 
 
 		 478 aa  548  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  57.42 
 
 		 478 aa  543  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6869  pyruvate kinase  58.26 
 
 		 478 aa  539  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  57.63 
 
 		 477 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  57.2 
 
 		 475 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  56.78 
 
 		 477 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2276  pyruvate kinase  58.51 
 
 		 481 aa  538  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756319  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2308  pyruvate kinase  56.36 
 
 		 473 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2773  pyruvate kinase  59.11 
 
 		 471 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0467936  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  56.57 
 
 		 477 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0341  pyruvate kinase  57.23 
 
 		 484 aa  529  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0955496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  57.84 
 
 		 474 aa  527  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3256  pyruvate kinase  55.72 
 
 		 478 aa  522  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496485  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1766  pyruvate kinase  58.3 
 
 		 481 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0228  pyruvate kinase  57.11 
 
 		 482 aa  520  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  56.78 
 
 		 470 aa  520  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0412  pyruvate kinase  58.51 
 
 		 481 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2486  pyruvate kinase  57.45 
 
 		 481 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  56.57 
 
 		 470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  54.12 
 
 		 479 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1165  pyruvate kinase  53.6 
 
 		 478 aa  511  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  54.8 
 
 		 497 aa  512  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  57.78 
 
 		 470 aa  514  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  55.08 
 
 		 478 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  56.36 
 
 		 470 aa  510  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  56.93 
 
 		 475 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3590  pyruvate kinase  54.01 
 
 		 479 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768977  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_004310  BR1748  pyruvate kinase  53.6 
 
 		 478 aa  508  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3121  pyruvate kinase  58.24 
 
 		 485 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3690  pyruvate kinase  53.28 
 
 		 479 aa  505  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1688  pyruvate kinase  53.6 
 
 		 478 aa  508  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3289  pyruvate kinase  53.59 
 
 		 479 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5564  pyruvate kinase  53.39 
 
 		 472 aa  502  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0447  pyruvate kinase  54.56 
 
 		 482 aa  504  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  54.03 
 
 		 478 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2516  pyruvate kinase  55.74 
 
 		 481 aa  502  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2370  pyruvate kinase  53.16 
 
 		 518 aa  498  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2971  pyruvate kinase  54.12 
 
 		 478 aa  500  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2104  pyruvate kinase  57.42 
 
 		 470 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576742  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2866  pyruvate kinase  54.33 
 
 		 478 aa  499  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1446  pyruvate kinase  57.42 
 
 		 470 aa  498  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2744  pyruvate kinase  53.91 
 
 		 483 aa  499  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  55.72 
 
 		 475 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0128  pyruvate kinase  54.87 
 
 		 478 aa  497  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.324584 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  55.81 
 
 		 479 aa  494  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0655  pyruvate kinase  56.93 
 
 		 470 aa  488  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  56.2 
 
 		 484 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  55.56 
 
 		 484 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1638  pyruvate kinase  55.56 
 
 		 484 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  55.56 
 
 		 484 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0432  pyruvate kinase  52.33 
 
 		 484 aa  478  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  52.97 
 
 		 483 aa  476  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1443  pyruvate kinase  55.11 
 
 		 476 aa  472  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5259  pyruvate kinase  54.62 
 
 		 484 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0558  pyruvate kinase  50.85 
 
 		 473 aa  461  9.999999999999999e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9118  pyruvate kinase  50.32 
 
 		 477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22404  pyruvate kinase 1  48.01 
 
 		 591 aa  443  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.529919  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  47.79 
 
 		 474 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  48.62 
 
 		 474 aa  414  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  47.55 
 
 		 482 aa  406  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  44.09 
 
 		 594 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  44.73 
 
 		 601 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  43.58 
 
 		 587 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  43.49 
 
 		 589 aa  385  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  41.61 
 
 		 580 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  43.93 
 
 		 600 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  43.1 
 
 		 590 aa  384  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  43.13 
 
 		 592 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  43.13 
 
 		 592 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  42.37 
 
 		 582 aa  375  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  44.92 
 
 		 474 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  44.99 
 
 		 477 aa  378  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  44.99 
 
 		 476 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  41.65 
 
 		 583 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  44.14 
 
 		 476 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  45.57 
 
 		 476 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  39.11 
 
 		 585 aa  368  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  41.61 
 
 		 578 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  45.51 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0824427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>