More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1443 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1443  pyruvate kinase  100 
 
 
476 aa  947    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  57.45 
 
 
479 aa  519  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  56.65 
 
 
474 aa  503  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  54.04 
 
 
487 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  53.63 
 
 
478 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  55.96 
 
 
472 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  53.42 
 
 
478 aa  489  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  54.99 
 
 
477 aa  489  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6869  pyruvate kinase  54.58 
 
 
478 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  54.56 
 
 
477 aa  488  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  55.11 
 
 
472 aa  487  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  52.65 
 
 
488 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1294  pyruvate kinase  55.84 
 
 
472 aa  481  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  53.52 
 
 
477 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  53.73 
 
 
475 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2276  pyruvate kinase  52.14 
 
 
481 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756319  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  53.7 
 
 
479 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  53.73 
 
 
477 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  54.06 
 
 
492 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  54.27 
 
 
492 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  53.94 
 
 
477 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  53.63 
 
 
476 aa  481  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  52.67 
 
 
472 aa  476  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3256  pyruvate kinase  52.45 
 
 
478 aa  477  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496485  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3690  pyruvate kinase  52.34 
 
 
479 aa  474  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  52.34 
 
 
479 aa  472  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3121  pyruvate kinase  54.62 
 
 
485 aa  471  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  53.32 
 
 
497 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0447  pyruvate kinase  52.03 
 
 
482 aa  468  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  53.3 
 
 
478 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  52.27 
 
 
471 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  52.32 
 
 
484 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3590  pyruvate kinase  51.49 
 
 
479 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768977  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2516  pyruvate kinase  51.71 
 
 
481 aa  466  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  52.27 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  52.27 
 
 
471 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  51.62 
 
 
471 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  52.45 
 
 
478 aa  464  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  52.27 
 
 
471 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0341  pyruvate kinase  53.22 
 
 
484 aa  464  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0955496  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3289  pyruvate kinase  51.06 
 
 
479 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232195  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1165  pyruvate kinase  50.53 
 
 
478 aa  463  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1688  pyruvate kinase  50.96 
 
 
478 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1748  pyruvate kinase  50.96 
 
 
478 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1638  pyruvate kinase  51.69 
 
 
484 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4478  pyruvate kinase  51.8 
 
 
471 aa  460  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  52.88 
 
 
478 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  51.48 
 
 
484 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2370  pyruvate kinase  51.39 
 
 
518 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2971  pyruvate kinase  52.73 
 
 
478 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  51.69 
 
 
484 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0412  pyruvate kinase  51.71 
 
 
481 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1766  pyruvate kinase  51.71 
 
 
481 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0128  pyruvate kinase  52.94 
 
 
478 aa  457  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.324584 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2744  pyruvate kinase  52.74 
 
 
483 aa  457  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2308  pyruvate kinase  50.85 
 
 
473 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568572  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  53.21 
 
 
470 aa  451  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2486  pyruvate kinase  51.28 
 
 
481 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0228  pyruvate kinase  50.53 
 
 
482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2866  pyruvate kinase  52.1 
 
 
478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5564  pyruvate kinase  50.11 
 
 
472 aa  448  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  52.68 
 
 
475 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2773  pyruvate kinase  51.84 
 
 
471 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0467936  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  48.61 
 
 
477 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0432  pyruvate kinase  52.04 
 
 
484 aa  439  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  48.61 
 
 
477 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22404  pyruvate kinase 1  47.73 
 
 
591 aa  434  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.529919  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  48.5 
 
 
483 aa  434  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  50.32 
 
 
475 aa  430  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  49.68 
 
 
470 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5259  pyruvate kinase  51.18 
 
 
484 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  49.46 
 
 
470 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  49.68 
 
 
470 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9118  pyruvate kinase  50.11 
 
 
477 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0558  pyruvate kinase  48.91 
 
 
473 aa  416  9.999999999999999e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2104  pyruvate kinase  50.11 
 
 
470 aa  415  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1446  pyruvate kinase  50.11 
 
 
470 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0655  pyruvate kinase  49.26 
 
 
470 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  48.29 
 
 
476 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  45.84 
 
 
483 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  46.02 
 
 
477 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  47.64 
 
 
471 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  45.63 
 
 
494 aa  377  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  44.23 
 
 
594 aa  377  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  42.64 
 
 
580 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  44.85 
 
 
474 aa  373  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  43.04 
 
 
589 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  42.89 
 
 
590 aa  372  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  46.5 
 
 
474 aa  373  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  43.28 
 
 
596 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  43.07 
 
 
485 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  43.28 
 
 
597 aa  372  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  45.63 
 
 
482 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  44.16 
 
 
600 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  43.07 
 
 
596 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  42.86 
 
 
485 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  44.44 
 
 
605 aa  372  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  42.19 
 
 
476 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  44.61 
 
 
476 aa  366  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  43.07 
 
 
596 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>