More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1218 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1748  pyruvate kinase  66.32 
 
 		 478 aa  662    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6869  pyruvate kinase  84.63 
 
 		 478 aa  809    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  84.78 
 
 		 477 aa  814    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  95.19 
 
 		 478 aa  918    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3289  pyruvate kinase  64.51 
 
 		 479 aa  634    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  84.57 
 
 		 477 aa  818    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  85.84 
 
 		 475 aa  827    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  85.2 
 
 		 477 aa  820    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  100 
 
 		 478 aa  957    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3590  pyruvate kinase  64.93 
 
 		 479 aa  637    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768977  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3256  pyruvate kinase  66.95 
 
 		 478 aa  657    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496485  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1165  pyruvate kinase  66.11 
 
 		 478 aa  665    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  68.51 
 
 		 497 aa  649    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1688  pyruvate kinase  66.32 
 
 		 478 aa  662    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3690  pyruvate kinase  64.51 
 
 		 479 aa  638    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  65.76 
 
 		 479 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  64.54 
 
 		 476 aa  624  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  67.02 
 
 		 470 aa  621  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2971  pyruvate kinase  67.23 
 
 		 478 aa  614  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2744  pyruvate kinase  67.02 
 
 		 483 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  64.89 
 
 		 478 aa  611  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2866  pyruvate kinase  66.38 
 
 		 478 aa  611  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  64.04 
 
 		 478 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0128  pyruvate kinase  64.04 
 
 		 478 aa  593  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.324584 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  60.04 
 
 		 492 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  60.04 
 
 		 492 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  57.74 
 
 		 487 aa  560  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  57.75 
 
 		 488 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  57.84 
 
 		 472 aa  541  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  56.08 
 
 		 472 aa  536  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2276  pyruvate kinase  55.98 
 
 		 481 aa  534  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756319  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2486  pyruvate kinase  55.56 
 
 		 481 aa  525  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0341  pyruvate kinase  56.01 
 
 		 484 aa  521  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0955496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  56.48 
 
 		 472 aa  518  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1766  pyruvate kinase  55.13 
 
 		 481 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0412  pyruvate kinase  55.34 
 
 		 481 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  57.02 
 
 		 474 aa  520  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  55.04 
 
 		 479 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0228  pyruvate kinase  55.65 
 
 		 482 aa  514  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  55.96 
 
 		 478 aa  514  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0447  pyruvate kinase  54.37 
 
 		 482 aa  509  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3121  pyruvate kinase  56.56 
 
 		 485 aa  505  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4478  pyruvate kinase  55.22 
 
 		 471 aa  504  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2516  pyruvate kinase  53.85 
 
 		 481 aa  503  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2370  pyruvate kinase  53.26 
 
 		 518 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  54.43 
 
 		 477 aa  501  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  54.01 
 
 		 477 aa  498  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  52.99 
 
 		 477 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1294  pyruvate kinase  56.41 
 
 		 472 aa  490  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0432  pyruvate kinase  54.91 
 
 		 484 aa  491  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  52.78 
 
 		 477 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  52.92 
 
 		 471 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  54.56 
 
 		 479 aa  482  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  52.92 
 
 		 471 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  52.7 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  52.92 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  52.92 
 
 		 471 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5564  pyruvate kinase  51.06 
 
 		 472 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2773  pyruvate kinase  52.27 
 
 		 471 aa  474  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0467936  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1443  pyruvate kinase  52.99 
 
 		 476 aa  473  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5259  pyruvate kinase  52.04 
 
 		 484 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2308  pyruvate kinase  51.84 
 
 		 473 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  51.18 
 
 		 484 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  51.18 
 
 		 484 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  50.96 
 
 		 484 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1638  pyruvate kinase  51.18 
 
 		 484 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  50.32 
 
 		 470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  50.42 
 
 		 475 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  50.75 
 
 		 470 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  50.96 
 
 		 470 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  47.9 
 
 		 483 aa  447  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1446  pyruvate kinase  51.82 
 
 		 470 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2104  pyruvate kinase  51.82 
 
 		 470 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0655  pyruvate kinase  51.39 
 
 		 470 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  49.89 
 
 		 475 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22404  pyruvate kinase 1  46.98 
 
 		 591 aa  432  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.529919  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  48.07 
 
 		 474 aa  423  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0558  pyruvate kinase  48.07 
 
 		 473 aa  414  1e-114  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  47.45 
 
 		 474 aa  414  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9118  pyruvate kinase  46.3 
 
 		 477 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  46.57 
 
 		 482 aa  405  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  46.17 
 
 		 476 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  43.88 
 
 		 594 aa  386  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  45.96 
 
 		 476 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  44.68 
 
 		 474 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  41.1 
 
 		 585 aa  385  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  45.32 
 
 		 477 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  42.16 
 
 		 584 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  44.04 
 
 		 476 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  41.67 
 
 		 485 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  42.74 
 
 		 580 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  40.8 
 
 		 583 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  43.72 
 
 		 600 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  41.67 
 
 		 485 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  42.92 
 
 		 586 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  43.8 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  44.89 
 
 		 471 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  43.07 
 
 		 601 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  42.46 
 
 		 597 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2215  pyruvate kinase  44.84 
 
 		 474 aa  368  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>