More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0558 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0558  pyruvate kinase  100 
 
 
473 aa  966    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  51.07 
 
 
472 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  52.13 
 
 
477 aa  457  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  51.59 
 
 
478 aa  456  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  51.91 
 
 
477 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  48.22 
 
 
487 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  49.06 
 
 
488 aa  450  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  49.38 
 
 
492 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  49.9 
 
 
472 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  50.43 
 
 
472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  50.96 
 
 
479 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  49.79 
 
 
492 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  49.57 
 
 
471 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  49.57 
 
 
471 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  49.47 
 
 
471 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4478  pyruvate kinase  49.89 
 
 
471 aa  438  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  49.57 
 
 
471 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  49.57 
 
 
471 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3121  pyruvate kinase  48.94 
 
 
485 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  50.21 
 
 
477 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2276  pyruvate kinase  51.3 
 
 
481 aa  437  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756319  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  50.21 
 
 
477 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  49.47 
 
 
477 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1294  pyruvate kinase  49.68 
 
 
472 aa  433  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  49.04 
 
 
477 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  51.18 
 
 
484 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  49.04 
 
 
477 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  47.7 
 
 
474 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  48.82 
 
 
497 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0432  pyruvate kinase  48.64 
 
 
484 aa  427  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0447  pyruvate kinase  51.29 
 
 
482 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  48.84 
 
 
475 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2516  pyruvate kinase  50.22 
 
 
481 aa  428  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2308  pyruvate kinase  48.51 
 
 
473 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568572  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  50.32 
 
 
484 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1638  pyruvate kinase  50.32 
 
 
484 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  48.06 
 
 
476 aa  424  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  48.29 
 
 
479 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  50.11 
 
 
484 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3289  pyruvate kinase  48.32 
 
 
479 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232195  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5259  pyruvate kinase  49.78 
 
 
484 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  48.07 
 
 
478 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0341  pyruvate kinase  47.87 
 
 
484 aa  419  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0955496  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3256  pyruvate kinase  48.75 
 
 
478 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496485  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  47.66 
 
 
483 aa  415  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3590  pyruvate kinase  48.11 
 
 
479 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768977  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  47.23 
 
 
478 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2773  pyruvate kinase  49.04 
 
 
471 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0467936  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6869  pyruvate kinase  46.58 
 
 
478 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1766  pyruvate kinase  48.32 
 
 
481 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1165  pyruvate kinase  47.25 
 
 
478 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9118  pyruvate kinase  49.37 
 
 
477 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0412  pyruvate kinase  48.32 
 
 
481 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5564  pyruvate kinase  46.22 
 
 
472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2370  pyruvate kinase  47.29 
 
 
518 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  46.33 
 
 
475 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2486  pyruvate kinase  47.9 
 
 
481 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  47.23 
 
 
479 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3690  pyruvate kinase  46.64 
 
 
479 aa  408  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1688  pyruvate kinase  46.86 
 
 
478 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1748  pyruvate kinase  46.86 
 
 
478 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  47.33 
 
 
470 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  47.37 
 
 
470 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0228  pyruvate kinase  47.21 
 
 
482 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2866  pyruvate kinase  46.43 
 
 
478 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1443  pyruvate kinase  48.92 
 
 
476 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0128  pyruvate kinase  45.97 
 
 
478 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.324584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2971  pyruvate kinase  46.22 
 
 
478 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  46.65 
 
 
475 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2744  pyruvate kinase  46.23 
 
 
483 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1446  pyruvate kinase  48.4 
 
 
470 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2104  pyruvate kinase  48.4 
 
 
470 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576742  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  46.01 
 
 
470 aa  398  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  45.38 
 
 
478 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  46.25 
 
 
470 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  44.75 
 
 
478 aa  388  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0655  pyruvate kinase  47.76 
 
 
470 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22404  pyruvate kinase 1  45 
 
 
591 aa  383  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.529919  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  45.26 
 
 
482 aa  381  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  45.59 
 
 
474 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  44.4 
 
 
474 aa  373  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  45.04 
 
 
476 aa  366  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  43.41 
 
 
480 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  41.95 
 
 
583 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  42.49 
 
 
585 aa  363  4e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  41.45 
 
 
578 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  41.79 
 
 
580 aa  360  4e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  41.85 
 
 
582 aa  359  5e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  42.7 
 
 
585 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  43.55 
 
 
471 aa  357  3.9999999999999996e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  40.83 
 
 
479 aa  356  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  42.25 
 
 
471 aa  355  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  44.59 
 
 
594 aa  355  1e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  43.28 
 
 
476 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  42.34 
 
 
480 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  42.27 
 
 
582 aa  353  2.9999999999999997e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  39.79 
 
 
583 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  42.95 
 
 
596 aa  353  4e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  42.95 
 
 
581 aa  352  1e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  43.16 
 
 
596 aa  352  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>