More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2516 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1766  pyruvate kinase  77.13 
 
 		 481 aa  746    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0447  pyruvate kinase  76.35 
 
 		 482 aa  733    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2516  pyruvate kinase  100 
 
 		 481 aa  975    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0228  pyruvate kinase  72.56 
 
 		 482 aa  685    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2276  pyruvate kinase  75.88 
 
 		 481 aa  736    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756319  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2486  pyruvate kinase  76.3 
 
 		 481 aa  738    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0412  pyruvate kinase  76.92 
 
 		 481 aa  744    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  58.35 
 
 		 476 aa  541  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  56.2 
 
 		 477 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  56.2 
 
 		 477 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  55.34 
 
 		 477 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  54.87 
 
 		 497 aa  518  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  54.06 
 
 		 487 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  55.13 
 
 		 475 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  54.49 
 
 		 488 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3256  pyruvate kinase  55.98 
 
 		 478 aa  512  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496485  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  55.13 
 
 		 474 aa  513  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1748  pyruvate kinase  55.77 
 
 		 478 aa  511  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  56.17 
 
 		 479 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1294  pyruvate kinase  57.69 
 
 		 472 aa  511  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  53.63 
 
 		 478 aa  509  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  54.49 
 
 		 492 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1688  pyruvate kinase  55.77 
 
 		 478 aa  511  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  54.58 
 
 		 472 aa  505  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  53.85 
 
 		 478 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1165  pyruvate kinase  55.56 
 
 		 478 aa  508  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  55.01 
 
 		 472 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3690  pyruvate kinase  55.44 
 
 		 479 aa  504  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  54.27 
 
 		 492 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3590  pyruvate kinase  54.58 
 
 		 479 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768977  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6869  pyruvate kinase  54.81 
 
 		 478 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3289  pyruvate kinase  54.16 
 
 		 479 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  55.34 
 
 		 478 aa  501  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  54.8 
 
 		 479 aa  501  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  55.74 
 
 		 472 aa  498  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  53.42 
 
 		 477 aa  492  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  53.21 
 
 		 477 aa  491  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  53.85 
 
 		 470 aa  490  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2866  pyruvate kinase  53.85 
 
 		 478 aa  489  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3121  pyruvate kinase  55.48 
 
 		 485 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  54.06 
 
 		 478 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0341  pyruvate kinase  54.29 
 
 		 484 aa  487  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0955496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  54.68 
 
 		 479 aa  488  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2971  pyruvate kinase  53.21 
 
 		 478 aa  484  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  53.21 
 
 		 478 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4478  pyruvate kinase  52.78 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2744  pyruvate kinase  52.99 
 
 		 483 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  52.03 
 
 		 471 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  52.03 
 
 		 471 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2370  pyruvate kinase  51.48 
 
 		 518 aa  477  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  51.82 
 
 		 471 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0128  pyruvate kinase  52.25 
 
 		 478 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.324584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  52.03 
 
 		 471 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  51.61 
 
 		 471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  52.25 
 
 		 477 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  51.93 
 
 		 484 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1638  pyruvate kinase  52.15 
 
 		 484 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5564  pyruvate kinase  52.03 
 
 		 472 aa  465  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  52.36 
 
 		 484 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  52.46 
 
 		 475 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  52.15 
 
 		 484 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0432  pyruvate kinase  52.26 
 
 		 484 aa  464  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  52.03 
 
 		 477 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  50.96 
 
 		 470 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  52.03 
 
 		 470 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  51.79 
 
 		 483 aa  460  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  51.61 
 
 		 470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2773  pyruvate kinase  52.03 
 
 		 471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0467936  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2308  pyruvate kinase  50.54 
 
 		 473 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2104  pyruvate kinase  52.03 
 
 		 470 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576742  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1443  pyruvate kinase  51.28 
 
 		 476 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  51.18 
 
 		 475 aa  445  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1446  pyruvate kinase  52.03 
 
 		 470 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5259  pyruvate kinase  51.19 
 
 		 484 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0655  pyruvate kinase  51.18 
 
 		 470 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22404  pyruvate kinase 1  48.1 
 
 		 591 aa  434  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.529919  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0558  pyruvate kinase  50.22 
 
 		 473 aa  429  1e-119  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9118  pyruvate kinase  47.59 
 
 		 477 aa  412  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  48.09 
 
 		 474 aa  404  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  48.41 
 
 		 474 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  47.42 
 
 		 482 aa  392  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  43.16 
 
 		 584 aa  385  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  43.8 
 
 		 581 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  42.41 
 
 		 580 aa  375  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  43.74 
 
 		 585 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  44.99 
 
 		 483 aa  375  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  44.78 
 
 		 494 aa  373  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  42.27 
 
 		 476 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  43.92 
 
 		 474 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  43.5 
 
 		 596 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  45.06 
 
 		 578 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  43.79 
 
 		 583 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  43.5 
 
 		 596 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14930  pyruvate kinase  44.99 
 
 		 489 aa  365  1e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  43.28 
 
 		 597 aa  365  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  41.89 
 
 		 585 aa  364  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  42.74 
 
 		 586 aa  364  2e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  43.07 
 
 		 587 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  41.01 
 
 		 474 aa  363  5.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  40.8 
 
 		 474 aa  363  5.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>