More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2370 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2370  pyruvate kinase  100 
 
 
518 aa  1052    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  52.75 
 
 
472 aa  504  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4478  pyruvate kinase  53.81 
 
 
471 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  53.26 
 
 
478 aa  499  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  52.02 
 
 
476 aa  498  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  52.42 
 
 
478 aa  496  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5564  pyruvate kinase  52.33 
 
 
472 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3256  pyruvate kinase  52.63 
 
 
478 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496485  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  52.75 
 
 
474 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  55.22 
 
 
497 aa  490  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  53.39 
 
 
472 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  51.05 
 
 
487 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  53.16 
 
 
472 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  51.37 
 
 
488 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0341  pyruvate kinase  52.85 
 
 
484 aa  489  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0955496  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2276  pyruvate kinase  52.24 
 
 
481 aa  488  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756319  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  53.93 
 
 
479 aa  491  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  53.6 
 
 
477 aa  485  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  52.14 
 
 
471 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1748  pyruvate kinase  51.79 
 
 
478 aa  485  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  51.28 
 
 
471 aa  485  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  52.14 
 
 
471 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1294  pyruvate kinase  53.18 
 
 
472 aa  485  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1688  pyruvate kinase  51.79 
 
 
478 aa  485  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  53.18 
 
 
477 aa  483  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  51.92 
 
 
471 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  51.58 
 
 
478 aa  482  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  51.59 
 
 
477 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  51.92 
 
 
471 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1165  pyruvate kinase  51.37 
 
 
478 aa  484  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  51.37 
 
 
477 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0447  pyruvate kinase  51.59 
 
 
482 aa  481  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  52.22 
 
 
475 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  50.95 
 
 
477 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  50.84 
 
 
477 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  52.85 
 
 
479 aa  475  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0432  pyruvate kinase  52.19 
 
 
484 aa  475  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  50.84 
 
 
477 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  50 
 
 
479 aa  478  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3121  pyruvate kinase  52.34 
 
 
485 aa  478  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  51.91 
 
 
492 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3690  pyruvate kinase  50 
 
 
479 aa  474  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  51.69 
 
 
492 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2516  pyruvate kinase  51.48 
 
 
481 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2308  pyruvate kinase  50.85 
 
 
473 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568572  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3590  pyruvate kinase  50.21 
 
 
479 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768977  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  52.33 
 
 
470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  53.05 
 
 
470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  51.69 
 
 
478 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  52.21 
 
 
475 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3289  pyruvate kinase  49.79 
 
 
479 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232195  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2486  pyruvate kinase  50.85 
 
 
481 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  50.32 
 
 
470 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  51.16 
 
 
475 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0228  pyruvate kinase  50.74 
 
 
482 aa  459  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0412  pyruvate kinase  50.64 
 
 
481 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1446  pyruvate kinase  52.97 
 
 
470 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2104  pyruvate kinase  53.18 
 
 
470 aa  458  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576742  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1766  pyruvate kinase  50.42 
 
 
481 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0128  pyruvate kinase  51.48 
 
 
478 aa  455  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.324584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6869  pyruvate kinase  50 
 
 
478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  51.48 
 
 
470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2744  pyruvate kinase  51.79 
 
 
483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2866  pyruvate kinase  52.12 
 
 
478 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2773  pyruvate kinase  50.21 
 
 
471 aa  451  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0467936  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  49.79 
 
 
478 aa  451  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2971  pyruvate kinase  51.69 
 
 
478 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  47.91 
 
 
483 aa  442  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0655  pyruvate kinase  52.12 
 
 
470 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1443  pyruvate kinase  50.75 
 
 
476 aa  440  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5259  pyruvate kinase  48.84 
 
 
484 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9118  pyruvate kinase  48.73 
 
 
477 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22404  pyruvate kinase 1  47.5 
 
 
591 aa  427  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.529919  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1638  pyruvate kinase  47.65 
 
 
484 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  47.65 
 
 
484 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  47.01 
 
 
484 aa  415  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  47.44 
 
 
484 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0558  pyruvate kinase  47.29 
 
 
473 aa  404  1e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  46.4 
 
 
474 aa  383  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  46.35 
 
 
474 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  45.67 
 
 
482 aa  378  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  43.15 
 
 
594 aa  371  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  42.8 
 
 
581 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  41.26 
 
 
585 aa  362  8e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  41.26 
 
 
585 aa  362  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0922  pyruvate kinase  39.66 
 
 
470 aa  360  3e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000158299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  41.05 
 
 
585 aa  360  3e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  41.05 
 
 
585 aa  360  4e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  41.05 
 
 
585 aa  360  4e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  41.05 
 
 
585 aa  360  4e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  41.05 
 
 
585 aa  360  4e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  41.05 
 
 
585 aa  360  4e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  41.05 
 
 
585 aa  360  4e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  41.05 
 
 
585 aa  360  4e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  41.23 
 
 
585 aa  360  5e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  43.1 
 
 
596 aa  359  5e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  40.38 
 
 
584 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  43.49 
 
 
474 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  42.71 
 
 
483 aa  356  5e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  41.84 
 
 
590 aa  356  6.999999999999999e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>