More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0922 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0922  pyruvate kinase  100 
 
 
470 aa  939    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000158299  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0716  pyruvate kinase  52.98 
 
 
466 aa  480  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0740  pyruvate kinase  52.43 
 
 
466 aa  478  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1917  pyruvate kinase  48.84 
 
 
478 aa  456  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  49.36 
 
 
583 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  48.62 
 
 
584 aa  422  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  46.09 
 
 
583 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  46.93 
 
 
583 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  47.26 
 
 
586 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  44.96 
 
 
580 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  46.61 
 
 
585 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  45.45 
 
 
578 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  45.34 
 
 
582 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  45.36 
 
 
577 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  43.76 
 
 
581 aa  392  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  45.22 
 
 
597 aa  395  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  47.13 
 
 
582 aa  394  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  44.82 
 
 
476 aa  392  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  45.05 
 
 
472 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  44.8 
 
 
596 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  45.01 
 
 
596 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  44.92 
 
 
474 aa  387  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  44.37 
 
 
596 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  43.01 
 
 
476 aa  383  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  42.25 
 
 
483 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  42.07 
 
 
590 aa  384  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2535  pyruvate kinase  43.86 
 
 
471 aa  381  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0129939  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  44.19 
 
 
585 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  42.95 
 
 
592 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  42.49 
 
 
589 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  42.71 
 
 
594 aa  380  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  43.97 
 
 
474 aa  380  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  43.79 
 
 
590 aa  381  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  42.95 
 
 
592 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  43.64 
 
 
580 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  44.49 
 
 
474 aa  381  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  42.71 
 
 
474 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  42.71 
 
 
587 aa  381  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  43.22 
 
 
477 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  42.32 
 
 
476 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  44.19 
 
 
585 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  41.61 
 
 
494 aa  377  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  44.59 
 
 
474 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  44.94 
 
 
471 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  44.33 
 
 
588 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  45.05 
 
 
585 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  43.16 
 
 
580 aa  378  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  42.04 
 
 
485 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  44.82 
 
 
585 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  43.04 
 
 
496 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  41.74 
 
 
600 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  42.25 
 
 
485 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  42.11 
 
 
478 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  42.71 
 
 
585 aa  371  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  43.07 
 
 
601 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  43.64 
 
 
480 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  43.52 
 
 
580 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2959  pyruvate kinase  41.98 
 
 
505 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  43.76 
 
 
585 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  41.86 
 
 
476 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  43.97 
 
 
585 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  43.76 
 
 
585 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  43.76 
 
 
585 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  43.76 
 
 
585 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  43.76 
 
 
585 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  43.76 
 
 
585 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  43.31 
 
 
479 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  43.97 
 
 
585 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  43.76 
 
 
585 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  43.76 
 
 
585 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2215  pyruvate kinase  42.07 
 
 
474 aa  368  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  43.93 
 
 
481 aa  365  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  40.89 
 
 
482 aa  365  1e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  43.37 
 
 
480 aa  364  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  43.83 
 
 
478 aa  364  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  42.04 
 
 
605 aa  364  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_004310  BR1748  pyruvate kinase  41.58 
 
 
478 aa  363  5.0000000000000005e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1688  pyruvate kinase  41.58 
 
 
478 aa  363  5.0000000000000005e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  44.42 
 
 
481 aa  362  8e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  42.02 
 
 
474 aa  362  8e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1165  pyruvate kinase  41.36 
 
 
478 aa  362  9e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  40.93 
 
 
582 aa  362  9e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2370  pyruvate kinase  39.66 
 
 
518 aa  360  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  41.81 
 
 
474 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  41.98 
 
 
471 aa  360  4e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03130  pyruvate kinase  41.47 
 
 
476 aa  359  8e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0435027  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1850  pyruvate kinase  41.77 
 
 
474 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.117078  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  43.19 
 
 
587 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0913  pyruvate kinase  42.05 
 
 
477 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00173367  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1080  pyruvate kinase  40.89 
 
 
481 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3804  pyruvate kinase  40.68 
 
 
476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347272 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  41.35 
 
 
478 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0351  pyruvate kinase  41.35 
 
 
467 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0288145  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1221  pyruvate kinase  41.68 
 
 
472 aa  356  5e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.724591  normal  0.678636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  39.87 
 
 
478 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1114  pyruvate kinase  39.71 
 
 
486 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.679316  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  40.3 
 
 
478 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0342  pyruvate kinase  41.14 
 
 
467 aa  355  6.999999999999999e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  41.33 
 
 
477 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1688  pyruvate kinase  41.56 
 
 
496 aa  355  1e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000849836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>