More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1114 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1114  pyruvate kinase  100 
 
 		 486 aa  952    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.679316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  45.24 
 
 		 578 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  48.31 
 
 		 474 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  45.99 
 
 		 586 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  44.3 
 
 		 584 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  46.93 
 
 		 482 aa  392  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  47.47 
 
 		 474 aa  392  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  43.55 
 
 		 583 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  42.98 
 
 		 583 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  44.14 
 
 		 476 aa  385  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  47.59 
 
 		 582 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  44.35 
 
 		 588 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  46.86 
 
 		 594 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  44 
 
 		 585 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  43.7 
 
 		 585 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  43.7 
 
 		 585 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  43.7 
 
 		 585 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  43.7 
 
 		 585 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  45.7 
 
 		 585 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  43.7 
 
 		 585 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  43.7 
 
 		 585 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  43.7 
 
 		 585 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  43.7 
 
 		 585 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  43.91 
 
 		 585 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  41.35 
 
 		 585 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  45.05 
 
 		 601 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  42.19 
 
 		 583 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  43.83 
 
 		 587 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  43.1 
 
 		 585 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  41.14 
 
 		 580 aa  371  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  43.01 
 
 		 474 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  45.62 
 
 		 474 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  42.23 
 
 		 577 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  40.8 
 
 		 580 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  42.02 
 
 		 476 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  42.51 
 
 		 585 aa  365  1e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  43.46 
 
 		 472 aa  365  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  39.24 
 
 		 474 aa  365  1e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  41.26 
 
 		 581 aa  365  1e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  44.58 
 
 		 600 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2959  pyruvate kinase  46.2 
 
 		 505 aa  364  2e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  39.03 
 
 		 474 aa  364  2e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  45.95 
 
 		 477 aa  363  3e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  44.86 
 
 		 589 aa  363  4e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  45.74 
 
 		 477 aa  363  4e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  44.33 
 
 		 590 aa  363  4e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  47.5 
 
 		 472 aa  362  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  43.98 
 
 		 477 aa  362  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  43.28 
 
 		 587 aa  361  1e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  44.94 
 
 		 492 aa  360  4e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  43.22 
 
 		 597 aa  360  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  43.22 
 
 		 596 aa  359  5e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  43.72 
 
 		 478 aa  359  5e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  43.04 
 
 		 596 aa  359  6e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  44.03 
 
 		 476 aa  359  7e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  43.49 
 
 		 582 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  44.94 
 
 		 492 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  46.96 
 
 		 475 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  43.22 
 
 		 596 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  42.23 
 
 		 585 aa  358  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  42.23 
 
 		 585 aa  358  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  45.95 
 
 		 478 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11633  pyruvate kinase  45.09 
 
 		 472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.104788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  46.72 
 
 		 474 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  44.28 
 
 		 479 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  45.28 
 
 		 470 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  44.21 
 
 		 592 aa  356  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  44.21 
 
 		 592 aa  356  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  44.07 
 
 		 480 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0922  pyruvate kinase  39.71 
 
 		 470 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000158299  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  44.56 
 
 		 479 aa  355  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  44.96 
 
 		 471 aa  355  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  44.14 
 
 		 479 aa  354  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  39.58 
 
 		 590 aa  354  2e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  42.44 
 
 		 477 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  42.38 
 
 		 477 aa  353  5e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  44.84 
 
 		 476 aa  353  5e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  43.37 
 
 		 472 aa  353  5e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0882  pyruvate kinase  40.25 
 
 		 589 aa  352  5.9999999999999994e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.441073  hitchhiker  0.000000000000201084 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  42.51 
 
 		 487 aa  352  8e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  42.23 
 
 		 477 aa  352  8e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  42.17 
 
 		 477 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  44.33 
 
 		 483 aa  352  8.999999999999999e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  43.12 
 
 		 483 aa  352  8.999999999999999e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  43.37 
 
 		 472 aa  352  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  42.56 
 
 		 478 aa  352  1e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2276  pyruvate kinase  42.65 
 
 		 481 aa  351  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756319  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1054  pyruvate kinase  43.37 
 
 		 471 aa  350  3e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157797  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  42.17 
 
 		 477 aa  349  6e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  44.3 
 
 		 474 aa  349  6e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5564  pyruvate kinase  43.4 
 
 		 472 aa  349  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  44.03 
 
 		 494 aa  349  8e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  44.3 
 
 		 471 aa  349  8e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  42.35 
 
 		 474 aa  348  9e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0751  pyruvate kinase  39.5 
 
 		 473 aa  348  1e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000115769  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  42.89 
 
 		 472 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  39.11 
 
 		 580 aa  348  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  42.89 
 
 		 472 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  42.89 
 
 		 472 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  45.57 
 
 		 475 aa  348  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>