More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1221 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2215  pyruvate kinase  71.97 
 
 		 474 aa  640    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  76.86 
 
 		 478 aa  732    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1505  pyruvate kinase  74.2 
 
 		 478 aa  727    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.33251  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20690  pyruvate kinase  80.72 
 
 		 472 aa  750    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0604306  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1221  pyruvate kinase  100 
 
 		 472 aa  946    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.724591  normal  0.678636 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2959  pyruvate kinase  66.6 
 
 		 505 aa  624  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1688  pyruvate kinase  65.11 
 
 		 496 aa  598  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000849836 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14930  pyruvate kinase  66.6 
 
 		 489 aa  595  1e-169  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  64.04 
 
 		 496 aa  597  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11020  pyruvate kinase  60.72 
 
 		 495 aa  567  1e-160  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.887694  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  59.66 
 
 		 476 aa  555  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  59.21 
 
 		 487 aa  555  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  60.47 
 
 		 474 aa  555  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  61.15 
 
 		 476 aa  552  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  60.08 
 
 		 477 aa  551  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  58.81 
 
 		 476 aa  546  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5699  pyruvate kinase  57.82 
 
 		 493 aa  545  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1080  pyruvate kinase  60.51 
 
 		 481 aa  547  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2490  pyruvate kinase  58.94 
 
 		 476 aa  540  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  58.9 
 
 		 471 aa  535  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  59.62 
 
 		 482 aa  526  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  58.72 
 
 		 472 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  58.72 
 
 		 472 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  57.87 
 
 		 472 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  58.72 
 
 		 472 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  57.96 
 
 		 474 aa  523  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  58.09 
 
 		 472 aa  521  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  58.35 
 
 		 477 aa  520  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  57.96 
 
 		 474 aa  521  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  58.76 
 
 		 482 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  58.09 
 
 		 472 aa  509  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  58.51 
 
 		 471 aa  507  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  57.54 
 
 		 472 aa  504  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11633  pyruvate kinase  56.17 
 
 		 472 aa  503  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.104788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3804  pyruvate kinase  55.44 
 
 		 476 aa  498  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347272 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0607  pyruvate kinase  55.02 
 
 		 479 aa  488  1e-136  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1678  pyruvate kinase  57.42 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0855403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0741  pyruvate kinase  53.04 
 
 		 480 aa  479  1e-134  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.580936  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12930  pyruvate kinase  55.56 
 
 		 470 aa  468  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.18078  normal  0.227064 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  47.58 
 
 		 584 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  46.3 
 
 		 583 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  45.67 
 
 		 583 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  47.89 
 
 		 479 aa  402  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  47.98 
 
 		 471 aa  402  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  48.1 
 
 		 478 aa  402  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  47.25 
 
 		 482 aa  401  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  44.4 
 
 		 578 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  48.84 
 
 		 474 aa  396  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  45.26 
 
 		 590 aa  393  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  44.77 
 
 		 583 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  47.35 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  45.24 
 
 		 480 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  45.88 
 
 		 590 aa  390  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  44.4 
 
 		 585 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  44.49 
 
 		 480 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1917  pyruvate kinase  43.22 
 
 		 478 aa  387  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  46.92 
 
 		 474 aa  388  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  45.63 
 
 		 589 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1664  pyruvate kinase  43.4 
 
 		 469 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000486614  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  46.27 
 
 		 491 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  45.8 
 
 		 480 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  46.06 
 
 		 594 aa  381  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1702  pyruvate kinase  44.37 
 
 		 470 aa  382  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000472586  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  46.41 
 
 		 474 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  45.78 
 
 		 480 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1964  pyruvate kinase  44.89 
 
 		 470 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000120282  hitchhiker  0.00000000245997 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1491  pyruvate kinase  44.89 
 
 		 470 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0197868  hitchhiker  0.00000000000000413859 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1793  pyruvate kinase  44.89 
 
 		 470 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000263395  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1511  pyruvate kinase  44.89 
 
 		 470 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00345195  hitchhiker  0.00000000277605 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  45.4 
 
 		 586 aa  378  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001645  pyruvate kinase  44.78 
 
 		 470 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000413201  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1475  pyruvate kinase  44.89 
 
 		 470 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.0298859 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  45.32 
 
 		 585 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01645  pyruvate kinase  43.92 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000322143  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1966  pyruvate kinase  43.92 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000099684  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0037  pyruvate kinase  43.71 
 
 		 470 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2582  pyruvate kinase  44.14 
 
 		 470 aa  373  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00785837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00829  pyruvate kinase  44.14 
 
 		 470 aa  375  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01635  hypothetical protein  43.92 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000427708  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1877  pyruvate kinase  43.92 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180077  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1955  pyruvate kinase  43.92 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000401811  unclonable  0.000000014136 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1757  pyruvate kinase  43.92 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.18747e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4390  pyruvate kinase  45.88 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1520  pyruvate kinase  43.92 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000224591  decreased coverage  0.00000000336273 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1749  pyruvate kinase  44.14 
 
 		 470 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.39981e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  42.07 
 
 		 580 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4367  pyruvate kinase  45.88 
 
 		 489 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  45.15 
 
 		 580 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1892  pyruvate kinase  43.92 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024147  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2390  pyruvate kinase  43.92 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000743671  hitchhiker  0.0000173681 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1855  pyruvate kinase  44.14 
 
 		 470 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000869854  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  42.14 
 
 		 585 aa  369  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  43.72 
 
 		 582 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4234  pyruvate kinase  46.09 
 
 		 489 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  43.28 
 
 		 479 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  44.14 
 
 		 588 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  44.02 
 
 		 587 aa  370  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2441  pyruvate kinase  42.68 
 
 		 470 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  44.44 
 
 		 600 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  44.4 
 
 		 596 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>