More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0716 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0740  pyruvate kinase  97.64 
 
 		 466 aa  913    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0716  pyruvate kinase  100 
 
 		 466 aa  930    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0922  pyruvate kinase  52.98 
 
 		 470 aa  480  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000158299  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  46.58 
 
 		 582 aa  419  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  45.94 
 
 		 583 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  47.01 
 
 		 585 aa  411  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  44.33 
 
 		 583 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1917  pyruvate kinase  44.44 
 
 		 478 aa  404  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  44.78 
 
 		 584 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  44.54 
 
 		 582 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  44.11 
 
 		 578 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  45.82 
 
 		 580 aa  395  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  42 
 
 		 583 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  44.04 
 
 		 474 aa  380  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  42.43 
 
 		 474 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  42.43 
 
 		 580 aa  378  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  42.23 
 
 		 478 aa  375  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  43.83 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  42.58 
 
 		 581 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  42.09 
 
 		 482 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  43.1 
 
 		 588 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  43.23 
 
 		 577 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  43.5 
 
 		 585 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  43.16 
 
 		 580 aa  371  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  42.22 
 
 		 586 aa  371  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  43.07 
 
 		 585 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  43.07 
 
 		 585 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  41.33 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  41.63 
 
 		 582 aa  371  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01645  pyruvate kinase  42.22 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000322143  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1966  pyruvate kinase  42.22 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000099684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  42.64 
 
 		 585 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1757  pyruvate kinase  42.22 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.18747e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01635  hypothetical protein  42.22 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000427708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  41.59 
 
 		 594 aa  368  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  42.02 
 
 		 479 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2390  pyruvate kinase  42.22 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000743671  hitchhiker  0.0000173681 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1877  pyruvate kinase  42.22 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1892  pyruvate kinase  42.22 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024147  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1520  pyruvate kinase  42.22 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000224591  decreased coverage  0.00000000336273 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1955  pyruvate kinase  42.22 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000401811  unclonable  0.000000014136 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  42.64 
 
 		 585 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  42.43 
 
 		 585 aa  365  1e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  41.24 
 
 		 590 aa  364  2e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  42.13 
 
 		 590 aa  363  4e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  41.59 
 
 		 597 aa  363  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  41.63 
 
 		 600 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  42.22 
 
 		 472 aa  362  9e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2215  pyruvate kinase  41.81 
 
 		 474 aa  361  1e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  41.54 
 
 		 476 aa  360  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  40.6 
 
 		 589 aa  361  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  41.98 
 
 		 474 aa  360  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1688  pyruvate kinase  40.26 
 
 		 496 aa  360  3e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000849836 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  43.49 
 
 		 474 aa  360  3e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  42.58 
 
 		 596 aa  360  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  39.7 
 
 		 477 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0037  pyruvate kinase  42.4 
 
 		 470 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  40.93 
 
 		 474 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  40.93 
 
 		 474 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  38.28 
 
 		 471 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  41.38 
 
 		 596 aa  357  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  41.38 
 
 		 596 aa  357  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1768  pyruvate kinase  41.98 
 
 		 473 aa  356  3.9999999999999996e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000514797  unclonable  0.00000209228 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  41.49 
 
 		 587 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2959  pyruvate kinase  39.36 
 
 		 505 aa  356  5e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1793  pyruvate kinase  41.58 
 
 		 470 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000263395  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1511  pyruvate kinase  41.58 
 
 		 470 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00345195  hitchhiker  0.00000000277605 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  42.34 
 
 		 585 aa  354  1e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  42.34 
 
 		 585 aa  354  1e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1475  pyruvate kinase  41.58 
 
 		 470 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.0298859 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1964  pyruvate kinase  41.58 
 
 		 470 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000120282  hitchhiker  0.00000000245997 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1491  pyruvate kinase  41.58 
 
 		 470 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0197868  hitchhiker  0.00000000000000413859 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1716  pyruvate kinase  41.85 
 
 		 469 aa  354  2e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  42.89 
 
 		 471 aa  354  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2187  pyruvate kinase  40.9 
 
 		 470 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545007  hitchhiker  0.000000575338 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001645  pyruvate kinase  41.76 
 
 		 470 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000413201  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1855  pyruvate kinase  41.15 
 
 		 470 aa  352  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000869854  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1749  pyruvate kinase  41.15 
 
 		 470 aa  352  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.39981e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2582  pyruvate kinase  41.15 
 
 		 470 aa  352  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00785837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0413  pyruvate kinase  41.88 
 
 		 479 aa  351  2e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1221  pyruvate kinase  41.06 
 
 		 472 aa  351  2e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.724591  normal  0.678636 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  42.51 
 
 		 476 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  39.27 
 
 		 476 aa  350  3e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  40.56 
 
 		 483 aa  350  3e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00829  pyruvate kinase  41.33 
 
 		 470 aa  350  3e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  40.69 
 
 		 478 aa  350  4e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0351  pyruvate kinase  40.38 
 
 		 467 aa  350  4e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0288145  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0342  pyruvate kinase  40.38 
 
 		 467 aa  350  4e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  41.06 
 
 		 585 aa  349  7e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  41.19 
 
 		 483 aa  349  7e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  39.66 
 
 		 485 aa  348  9e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2879  pyruvate kinase  42.18 
 
 		 469 aa  348  9e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.357906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  39.02 
 
 		 478 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  39.87 
 
 		 485 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>