More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1877 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01645  pyruvate kinase  100 
 
 		 470 aa  956    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000322143  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1966  pyruvate kinase  100 
 
 		 470 aa  956    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000099684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1955  pyruvate kinase  100 
 
 		 470 aa  956    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000401811  unclonable  0.000000014136 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1793  pyruvate kinase  95.74 
 
 		 470 aa  920    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000263395  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2582  pyruvate kinase  86.6 
 
 		 470 aa  834    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00785837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1892  pyruvate kinase  100 
 
 		 470 aa  956    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024147  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2187  pyruvate kinase  87.02 
 
 		 470 aa  842    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545007  hitchhiker  0.000000575338 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1511  pyruvate kinase  95.74 
 
 		 470 aa  920    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00345195  hitchhiker  0.00000000277605 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2744  pyruvate kinase  84.62 
 
 		 491 aa  802    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000110572  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2390  pyruvate kinase  100 
 
 		 470 aa  956    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000743671  hitchhiker  0.0000173681 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1855  pyruvate kinase  86.6 
 
 		 470 aa  834    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000869854  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1757  pyruvate kinase  100 
 
 		 470 aa  956    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.18747e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2701  pyruvate kinase  77.66 
 
 		 470 aa  737    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1702  pyruvate kinase  86.38 
 
 		 470 aa  816    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000472586  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1768  pyruvate kinase  92.6 
 
 		 473 aa  898    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000514797  unclonable  0.00000209228 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00829  pyruvate kinase  78.51 
 
 		 470 aa  738    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1475  pyruvate kinase  95.74 
 
 		 470 aa  920    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.0298859 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0037  pyruvate kinase  78.09 
 
 		 470 aa  734    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1964  pyruvate kinase  95.74 
 
 		 470 aa  920    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000120282  hitchhiker  0.00000000245997 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1877  pyruvate kinase  100 
 
 		 470 aa  956    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180077  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1664  pyruvate kinase  85.96 
 
 		 469 aa  812    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000486614  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1491  pyruvate kinase  95.74 
 
 		 470 aa  920    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0197868  hitchhiker  0.00000000000000413859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2441  pyruvate kinase  85.11 
 
 		 470 aa  807    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1749  pyruvate kinase  86.6 
 
 		 470 aa  834    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.39981e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1520  pyruvate kinase  100 
 
 		 470 aa  956    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000224591  decreased coverage  0.00000000336273 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01635  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  956    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000427708  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2879  pyruvate kinase  71.06 
 
 		 469 aa  672    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.357906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001645  pyruvate kinase  78.3 
 
 		 470 aa  738    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000413201  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1716  pyruvate kinase  62.85 
 
 		 469 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0413  pyruvate kinase  60.17 
 
 		 479 aa  545  1e-154  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  52 
 
 		 588 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  52.11 
 
 		 587 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  53.7 
 
 		 584 aa  480  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  50.42 
 
 		 583 aa  472  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  50.74 
 
 		 585 aa  462  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0351  pyruvate kinase  51.27 
 
 		 467 aa  463  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0288145  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0342  pyruvate kinase  51.06 
 
 		 467 aa  463  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  50.95 
 
 		 585 aa  457  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  50.63 
 
 		 585 aa  455  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  50.42 
 
 		 585 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  50.42 
 
 		 585 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  50.21 
 
 		 585 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  50.21 
 
 		 585 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  50.21 
 
 		 585 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  50.21 
 
 		 585 aa  451  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  50.21 
 
 		 585 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  50.21 
 
 		 585 aa  451  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  50.21 
 
 		 585 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  49.79 
 
 		 582 aa  445  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  49.89 
 
 		 577 aa  442  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  47.79 
 
 		 580 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  49.37 
 
 		 590 aa  437  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  50.74 
 
 		 580 aa  434  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  48.86 
 
 		 472 aa  430  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  48.62 
 
 		 578 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  46.32 
 
 		 474 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  48.84 
 
 		 583 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  46.1 
 
 		 474 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  47.16 
 
 		 580 aa  427  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0882  pyruvate kinase  47.69 
 
 		 589 aa  425  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.441073  hitchhiker  0.000000000000201084 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  47.89 
 
 		 583 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  47.68 
 
 		 582 aa  423  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1040  pyruvate kinase  47.02 
 
 		 480 aa  418  1e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  48.54 
 
 		 585 aa  419  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  48.54 
 
 		 585 aa  419  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  47.7 
 
 		 585 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  47.35 
 
 		 474 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0751  pyruvate kinase  47.1 
 
 		 473 aa  409  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000115769  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1115  pyruvate kinase  47.02 
 
 		 490 aa  405  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000141137  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0775  pyruvate kinase  47.29 
 
 		 473 aa  403  1e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.153908  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  46.95 
 
 		 585 aa  403  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  44.61 
 
 		 581 aa  401  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03080  pyruvate kinase, putative  46.36 
 
 		 572 aa  398  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1002  pyruvate kinase  46.03 
 
 		 477 aa  398  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  44.92 
 
 		 478 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  45.47 
 
 		 479 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2535  pyruvate kinase  43.88 
 
 		 471 aa  384  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0129939  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  45.05 
 
 		 589 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  45.49 
 
 		 471 aa  382  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  45.91 
 
 		 482 aa  380  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_56445  kinase pyruvate kinase 3  44.33 
 
 		 543 aa  380  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1163  pyruvate kinase  42.17 
 
 		 500 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05210  Pyruvate kinase (PK)(EC 2.7.1.40) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22360]  45.77 
 
 		 526 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  43.1 
 
 		 582 aa  378  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  44.63 
 
 		 590 aa  378  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  44.19 
 
 		 594 aa  377  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  45.2 
 
 		 474 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0941  pyruvate kinase  41.52 
 
 		 500 aa  374  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1221  pyruvate kinase  43.92 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.724591  normal  0.678636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  41.91 
 
 		 509 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  43.83 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  44.94 
 
 		 586 aa  375  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45997  kinase pyruvate kinase 4a  44.44 
 
 		 535 aa  371  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.01235  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  43.82 
 
 		 474 aa  369  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27708  predicted protein  46.6 
 
 		 527 aa  369  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0235252 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1456  pyruvate kinase  39.48 
 
 		 502 aa  369  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.348226  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27502  kinase pyruvate kinase 4b  44.44 
 
 		 535 aa  370  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0142086  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0716  pyruvate kinase  42.22 
 
 		 466 aa  366  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40662  predicted protein  46.3 
 
 		 572 aa  367  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.612902  normal  0.0247222 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  43.43 
 
 		 474 aa  366  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>