More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0228 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2486  pyruvate kinase  74.64 
 
 		 481 aa  712    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1766  pyruvate kinase  74.84 
 
 		 481 aa  716    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0228  pyruvate kinase  100 
 
 		 482 aa  972    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0447  pyruvate kinase  73.6 
 
 		 482 aa  717    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2516  pyruvate kinase  72.56 
 
 		 481 aa  685    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0412  pyruvate kinase  74.64 
 
 		 481 aa  713    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2276  pyruvate kinase  72.77 
 
 		 481 aa  710    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756319  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  55.86 
 
 		 487 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  57.14 
 
 		 477 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  56.72 
 
 		 488 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  56.08 
 
 		 477 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  56.72 
 
 		 477 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  55.62 
 
 		 492 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  55.42 
 
 		 492 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  54.68 
 
 		 472 aa  520  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  56.29 
 
 		 475 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  55.65 
 
 		 478 aa  518  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  55.65 
 
 		 474 aa  519  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1294  pyruvate kinase  58.64 
 
 		 472 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  56.81 
 
 		 472 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  55.01 
 
 		 478 aa  514  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  56.29 
 
 		 476 aa  513  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  56.29 
 
 		 479 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6869  pyruvate kinase  54.28 
 
 		 478 aa  508  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3590  pyruvate kinase  54.89 
 
 		 479 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768977  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3256  pyruvate kinase  54.8 
 
 		 478 aa  502  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496485  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3121  pyruvate kinase  55.34 
 
 		 485 aa  500  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3690  pyruvate kinase  54.68 
 
 		 479 aa  501  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0341  pyruvate kinase  55.67 
 
 		 484 aa  501  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0955496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3289  pyruvate kinase  54.26 
 
 		 479 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  54.7 
 
 		 497 aa  500  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  54.26 
 
 		 479 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1165  pyruvate kinase  53.94 
 
 		 478 aa  494  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  54.55 
 
 		 472 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_004310  BR1748  pyruvate kinase  54.16 
 
 		 478 aa  494  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1688  pyruvate kinase  54.16 
 
 		 478 aa  494  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  52.99 
 
 		 471 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  53.73 
 
 		 478 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  53.94 
 
 		 478 aa  488  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  53.21 
 
 		 471 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  52.45 
 
 		 477 aa  489  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  53.42 
 
 		 471 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  52.99 
 
 		 471 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  52.24 
 
 		 477 aa  488  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  54.8 
 
 		 470 aa  488  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4478  pyruvate kinase  53.09 
 
 		 471 aa  487  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  52.56 
 
 		 471 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2866  pyruvate kinase  53.3 
 
 		 478 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  54.89 
 
 		 479 aa  476  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2971  pyruvate kinase  52.88 
 
 		 478 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2744  pyruvate kinase  52.67 
 
 		 483 aa  471  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  52.78 
 
 		 475 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  51.48 
 
 		 478 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5564  pyruvate kinase  51.92 
 
 		 472 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  51.71 
 
 		 477 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2370  pyruvate kinase  50.74 
 
 		 518 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1638  pyruvate kinase  53.72 
 
 		 484 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0128  pyruvate kinase  52.35 
 
 		 478 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.324584 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  53.5 
 
 		 484 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0432  pyruvate kinase  53.4 
 
 		 484 aa  464  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  53.72 
 
 		 484 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  51.71 
 
 		 477 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2773  pyruvate kinase  51.92 
 
 		 471 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0467936  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  51.92 
 
 		 470 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  53.5 
 
 		 484 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2308  pyruvate kinase  50.85 
 
 		 473 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  51.07 
 
 		 470 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  50.53 
 
 		 483 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2104  pyruvate kinase  51.28 
 
 		 470 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1446  pyruvate kinase  51.28 
 
 		 470 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5259  pyruvate kinase  52.46 
 
 		 484 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1443  pyruvate kinase  50.11 
 
 		 476 aa  439  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  49.79 
 
 		 470 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  49.15 
 
 		 475 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0655  pyruvate kinase  50.85 
 
 		 470 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22404  pyruvate kinase 1  47.51 
 
 		 591 aa  424  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.529919  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9118  pyruvate kinase  48.52 
 
 		 477 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0558  pyruvate kinase  47.21 
 
 		 473 aa  402  1e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  45.18 
 
 		 474 aa  378  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  45.18 
 
 		 474 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  43.74 
 
 		 594 aa  374  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  45.09 
 
 		 476 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  44.23 
 
 		 482 aa  365  1e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14930  pyruvate kinase  45.42 
 
 		 489 aa  363  5.0000000000000005e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  43.9 
 
 		 477 aa  362  6e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  42.77 
 
 		 589 aa  358  8e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  42.55 
 
 		 590 aa  359  8e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11020  pyruvate kinase  45.53 
 
 		 495 aa  358  9e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.887694  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  42.49 
 
 		 474 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  42.61 
 
 		 476 aa  356  5e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2959  pyruvate kinase  44.75 
 
 		 505 aa  354  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  41.77 
 
 		 600 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1688  pyruvate kinase  42.83 
 
 		 496 aa  353  4e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000849836 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  41.19 
 
 		 583 aa  351  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  42.71 
 
 		 478 aa  350  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  43.04 
 
 		 478 aa  350  3e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  43.52 
 
 		 494 aa  349  6e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  42.71 
 
 		 472 aa  349  7e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  42.71 
 
 		 472 aa  349  7e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  42.71 
 
 		 472 aa  349  7e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>