More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3452 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  90.81 
 
 		 487 aa  884    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  100 
 
 		 488 aa  976    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  77.02 
 
 		 492 aa  739    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  76.6 
 
 		 492 aa  733    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  61.02 
 
 		 472 aa  580  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  61.7 
 
 		 477 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  61.7 
 
 		 477 aa  576  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4478  pyruvate kinase  59.79 
 
 		 471 aa  573  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  60.77 
 
 		 479 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  58.6 
 
 		 472 aa  568  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1294  pyruvate kinase  61.49 
 
 		 472 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  59.79 
 
 		 478 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  59.36 
 
 		 474 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2276  pyruvate kinase  58.12 
 
 		 481 aa  556  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756319  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  57.75 
 
 		 478 aa  550  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  59.24 
 
 		 472 aa  546  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  57.32 
 
 		 478 aa  546  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  56.26 
 
 		 477 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  56.96 
 
 		 471 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  56.32 
 
 		 471 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  56.26 
 
 		 477 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  56.75 
 
 		 471 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  56.05 
 
 		 477 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  56.26 
 
 		 475 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  59.45 
 
 		 479 aa  541  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  56.96 
 
 		 471 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  56.75 
 
 		 471 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1766  pyruvate kinase  57.26 
 
 		 481 aa  531  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6869  pyruvate kinase  57.32 
 
 		 478 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0412  pyruvate kinase  57.48 
 
 		 481 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  55.77 
 
 		 477 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  54.22 
 
 		 479 aa  531  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  55.2 
 
 		 476 aa  525  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3256  pyruvate kinase  53.77 
 
 		 478 aa  525  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  55.56 
 
 		 477 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2486  pyruvate kinase  56.62 
 
 		 481 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  56.48 
 
 		 470 aa  526  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1165  pyruvate kinase  54.56 
 
 		 478 aa  527  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2308  pyruvate kinase  54.47 
 
 		 473 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  54.95 
 
 		 478 aa  521  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1748  pyruvate kinase  53.49 
 
 		 478 aa  518  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1688  pyruvate kinase  53.49 
 
 		 478 aa  518  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0228  pyruvate kinase  56.72 
 
 		 482 aa  521  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3289  pyruvate kinase  53.59 
 
 		 479 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3590  pyruvate kinase  53.59 
 
 		 479 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768977  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0128  pyruvate kinase  55.16 
 
 		 478 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.324584 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  55.25 
 
 		 497 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2866  pyruvate kinase  55.16 
 
 		 478 aa  514  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  55.7 
 
 		 484 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1638  pyruvate kinase  55.7 
 
 		 484 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  55.7 
 
 		 484 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2744  pyruvate kinase  54.74 
 
 		 483 aa  512  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2971  pyruvate kinase  54.95 
 
 		 478 aa  514  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3690  pyruvate kinase  52.97 
 
 		 479 aa  512  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2773  pyruvate kinase  56.1 
 
 		 471 aa  514  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0467936  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  55.48 
 
 		 484 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0341  pyruvate kinase  54.74 
 
 		 484 aa  509  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0955496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  55.63 
 
 		 475 aa  510  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  54.03 
 
 		 470 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  54.11 
 
 		 478 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  55.3 
 
 		 470 aa  504  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  55.3 
 
 		 470 aa  504  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3121  pyruvate kinase  54.53 
 
 		 485 aa  502  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0447  pyruvate kinase  54.16 
 
 		 482 aa  504  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2516  pyruvate kinase  54.49 
 
 		 481 aa  502  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  53.2 
 
 		 483 aa  504  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5564  pyruvate kinase  53.6 
 
 		 472 aa  501  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0432  pyruvate kinase  52.9 
 
 		 484 aa  492  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  53.18 
 
 		 475 aa  488  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2370  pyruvate kinase  51.37 
 
 		 518 aa  489  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2104  pyruvate kinase  55.08 
 
 		 470 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1446  pyruvate kinase  55.08 
 
 		 470 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5259  pyruvate kinase  53.45 
 
 		 484 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0655  pyruvate kinase  54.03 
 
 		 470 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1443  pyruvate kinase  52.77 
 
 		 476 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9118  pyruvate kinase  51.69 
 
 		 477 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0558  pyruvate kinase  49.06 
 
 		 473 aa  442  1e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22404  pyruvate kinase 1  47 
 
 		 591 aa  437  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.529919  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  48.63 
 
 		 474 aa  437  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  48.83 
 
 		 474 aa  429  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  46.84 
 
 		 482 aa  415  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  47.47 
 
 		 476 aa  404  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  44.42 
 
 		 578 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  44.26 
 
 		 580 aa  403  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  43.06 
 
 		 585 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  43.22 
 
 		 585 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  42.44 
 
 		 585 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  46.74 
 
 		 476 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  45.23 
 
 		 600 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  42.5 
 
 		 583 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  47.05 
 
 		 477 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  398  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  398  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  43 
 
 		 585 aa  398  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  43.92 
 
 		 594 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>