More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3690 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1748  pyruvate kinase  80.58 
 
 		 478 aa  777    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  86.22 
 
 		 479 aa  845    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3690  pyruvate kinase  100 
 
 		 479 aa  965    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  64.51 
 
 		 478 aa  638    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  66.81 
 
 		 477 aa  646    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3590  pyruvate kinase  86.64 
 
 		 479 aa  854    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768977  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  66.17 
 
 		 477 aa  640    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1688  pyruvate kinase  80.58 
 
 		 478 aa  777    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  66.38 
 
 		 477 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  64.51 
 
 		 478 aa  638    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3256  pyruvate kinase  76.41 
 
 		 478 aa  738    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496485  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3289  pyruvate kinase  86.85 
 
 		 479 aa  858    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1165  pyruvate kinase  80.38 
 
 		 478 aa  779    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  65.54 
 
 		 475 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  64.19 
 
 		 476 aa  618  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  63.48 
 
 		 497 aa  598  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6869  pyruvate kinase  63.85 
 
 		 478 aa  599  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  60.51 
 
 		 478 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  60.3 
 
 		 478 aa  568  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  60.51 
 
 		 470 aa  559  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2866  pyruvate kinase  60.08 
 
 		 478 aa  557  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2971  pyruvate kinase  59.24 
 
 		 478 aa  548  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2744  pyruvate kinase  59.02 
 
 		 483 aa  547  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0128  pyruvate kinase  58.17 
 
 		 478 aa  537  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.324584 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  53.03 
 
 		 487 aa  525  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  55.11 
 
 		 472 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  55.46 
 
 		 492 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  55.67 
 
 		 492 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  52.97 
 
 		 488 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2276  pyruvate kinase  54.16 
 
 		 481 aa  510  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756319  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  54.55 
 
 		 477 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1766  pyruvate kinase  55.65 
 
 		 481 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0341  pyruvate kinase  53.99 
 
 		 484 aa  508  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0955496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2486  pyruvate kinase  55.22 
 
 		 481 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0412  pyruvate kinase  55.86 
 
 		 481 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  55.74 
 
 		 479 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  54.33 
 
 		 477 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  54.45 
 
 		 472 aa  500  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2516  pyruvate kinase  55.44 
 
 		 481 aa  498  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  52.65 
 
 		 474 aa  497  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  55.06 
 
 		 478 aa  497  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0228  pyruvate kinase  54.68 
 
 		 482 aa  496  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0447  pyruvate kinase  53.83 
 
 		 482 aa  496  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  53.07 
 
 		 472 aa  496  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3121  pyruvate kinase  54.41 
 
 		 485 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  54.27 
 
 		 471 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0432  pyruvate kinase  52.63 
 
 		 484 aa  487  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1294  pyruvate kinase  55.41 
 
 		 472 aa  478  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  53.63 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  53.63 
 
 		 471 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  53.63 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  53.63 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2308  pyruvate kinase  53.08 
 
 		 473 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2773  pyruvate kinase  53.42 
 
 		 471 aa  472  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0467936  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2370  pyruvate kinase  50 
 
 		 518 aa  474  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  53.59 
 
 		 479 aa  466  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  51.59 
 
 		 477 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4478  pyruvate kinase  52.75 
 
 		 471 aa  467  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  51.16 
 
 		 477 aa  464  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  51.17 
 
 		 470 aa  457  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5564  pyruvate kinase  50.53 
 
 		 472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1443  pyruvate kinase  51.49 
 
 		 476 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  50.32 
 
 		 484 aa  451  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  51.16 
 
 		 475 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  49.06 
 
 		 483 aa  450  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  49.68 
 
 		 484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1638  pyruvate kinase  49.68 
 
 		 484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  49.47 
 
 		 484 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  51.38 
 
 		 470 aa  444  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  50.11 
 
 		 475 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  50.64 
 
 		 470 aa  438  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5259  pyruvate kinase  50.85 
 
 		 484 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22404  pyruvate kinase 1  46.69 
 
 		 591 aa  431  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.529919  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1446  pyruvate kinase  50.95 
 
 		 470 aa  425  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2104  pyruvate kinase  50.95 
 
 		 470 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0655  pyruvate kinase  50.21 
 
 		 470 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0558  pyruvate kinase  46.64 
 
 		 473 aa  405  1.0000000000000001e-112  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  47.03 
 
 		 474 aa  402  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9118  pyruvate kinase  45.57 
 
 		 477 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  46.54 
 
 		 482 aa  401  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  46.68 
 
 		 474 aa  397  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  43.01 
 
 		 585 aa  385  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  41.28 
 
 		 581 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  44.49 
 
 		 476 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  45.13 
 
 		 476 aa  378  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  44.7 
 
 		 476 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  44.28 
 
 		 474 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  42.28 
 
 		 594 aa  371  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  41.08 
 
 		 580 aa  372  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  41.31 
 
 		 584 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  44.4 
 
 		 477 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  42.32 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  42.71 
 
 		 601 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  42.53 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  40.92 
 
 		 583 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  43.88 
 
 		 483 aa  365  1e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  42.65 
 
 		 600 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  43.7 
 
 		 596 aa  362  8e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  41.74 
 
 		 592 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  41.74 
 
 		 592 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>