More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_22404 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_22404  pyruvate kinase 1  100 
 
 		 591 aa  1209    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.529919  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  48.22 
 
 		 478 aa  451  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  47.8 
 
 		 474 aa  451  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  49.9 
 
 		 479 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4478  pyruvate kinase  48.2 
 
 		 471 aa  445  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5564  pyruvate kinase  48.3 
 
 		 472 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  48.2 
 
 		 497 aa  444  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0447  pyruvate kinase  48.3 
 
 		 482 aa  441  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  45.54 
 
 		 487 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  46.68 
 
 		 478 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  47.25 
 
 		 477 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  47.81 
 
 		 472 aa  438  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  47 
 
 		 488 aa  438  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  47.59 
 
 		 476 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  47.45 
 
 		 477 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  47.06 
 
 		 477 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  46.98 
 
 		 478 aa  432  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  47.28 
 
 		 478 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  48.49 
 
 		 472 aa  431  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  46.39 
 
 		 472 aa  432  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  47.32 
 
 		 477 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3690  pyruvate kinase  46.69 
 
 		 479 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  48.21 
 
 		 475 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  46.68 
 
 		 478 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  47.41 
 
 		 475 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2866  pyruvate kinase  48.09 
 
 		 478 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  47.32 
 
 		 477 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  47.59 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3590  pyruvate kinase  46.61 
 
 		 479 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768977  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  47.59 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2370  pyruvate kinase  47.5 
 
 		 518 aa  428  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3256  pyruvate kinase  46.31 
 
 		 478 aa  429  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496485  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2276  pyruvate kinase  46.41 
 
 		 481 aa  428  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756319  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  47.79 
 
 		 471 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  46.75 
 
 		 479 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3289  pyruvate kinase  46.41 
 
 		 479 aa  425  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1294  pyruvate kinase  50 
 
 		 472 aa  424  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  47.59 
 
 		 471 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2516  pyruvate kinase  48.1 
 
 		 481 aa  424  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2744  pyruvate kinase  47.28 
 
 		 483 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2971  pyruvate kinase  47.28 
 
 		 478 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1165  pyruvate kinase  45.42 
 
 		 478 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  47.21 
 
 		 470 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  46.71 
 
 		 492 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  45.51 
 
 		 479 aa  422  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  46.91 
 
 		 492 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  46.48 
 
 		 471 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1766  pyruvate kinase  46.63 
 
 		 481 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  45.91 
 
 		 470 aa  422  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0412  pyruvate kinase  46.63 
 
 		 481 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  46.71 
 
 		 470 aa  420  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1748  pyruvate kinase  45.91 
 
 		 478 aa  418  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1688  pyruvate kinase  45.91 
 
 		 478 aa  418  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6869  pyruvate kinase  47.05 
 
 		 478 aa  418  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0228  pyruvate kinase  47.51 
 
 		 482 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2308  pyruvate kinase  47.19 
 
 		 473 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3121  pyruvate kinase  48.13 
 
 		 485 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1446  pyruvate kinase  47.31 
 
 		 470 aa  415  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2486  pyruvate kinase  45.42 
 
 		 481 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0341  pyruvate kinase  46.14 
 
 		 484 aa  412  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0955496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2104  pyruvate kinase  47.31 
 
 		 470 aa  415  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576742  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1443  pyruvate kinase  47.05 
 
 		 476 aa  409  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0655  pyruvate kinase  47.11 
 
 		 470 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9118  pyruvate kinase  45.82 
 
 		 477 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  45.62 
 
 		 475 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2773  pyruvate kinase  46.68 
 
 		 471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0467936  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1638  pyruvate kinase  45.53 
 
 		 484 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  45.89 
 
 		 484 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0432  pyruvate kinase  46.38 
 
 		 484 aa  408  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  45.53 
 
 		 484 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  45.92 
 
 		 470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  43.68 
 
 		 477 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0128  pyruvate kinase  46.28 
 
 		 478 aa  405  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.324584 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  45.33 
 
 		 484 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  43.71 
 
 		 477 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  45.6 
 
 		 483 aa  396  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5259  pyruvate kinase  43.19 
 
 		 484 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0558  pyruvate kinase  45 
 
 		 473 aa  372  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  42.54 
 
 		 482 aa  358  1.9999999999999998e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  42.6 
 
 		 581 aa  348  1e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  39.64 
 
 		 585 aa  346  5e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  40.64 
 
 		 476 aa  345  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  41.24 
 
 		 474 aa  339  9e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  40.04 
 
 		 582 aa  339  9e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  40.63 
 
 		 600 aa  336  7e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  40.04 
 
 		 477 aa  334  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  40.16 
 
 		 589 aa  332  8e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  39.03 
 
 		 580 aa  332  1e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  40.85 
 
 		 482 aa  332  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  38.43 
 
 		 584 aa  330  6e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  40.56 
 
 		 476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  39.36 
 
 		 594 aa  329  1.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  40.63 
 
 		 592 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  40.63 
 
 		 592 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  40.68 
 
 		 474 aa  328  2.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  40.56 
 
 		 580 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  39.56 
 
 		 471 aa  327  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  40.24 
 
 		 482 aa  327  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  40.4 
 
 		 601 aa  326  6e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  40.28 
 
 		 483 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>