More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2321 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2321  pyruvate kinase  100 
 
 
496 aa  1020    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238455  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4063  pyruvate kinase  48.63 
 
 
488 aa  463  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910781  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3378  pyruvate kinase  48.54 
 
 
479 aa  458  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1400  pyruvate kinase  49.25 
 
 
470 aa  458  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4190  pyruvate kinase  47.97 
 
 
476 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.85429 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1063  pyruvate kinase  47.35 
 
 
488 aa  441  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.175798  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1209  hypothetical protein  43.39 
 
 
481 aa  423  1e-117  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000430892 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1141  pyruvate kinase  45.01 
 
 
477 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03130  pyruvate kinase  43.95 
 
 
476 aa  417  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0435027  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  43.34 
 
 
580 aa  402  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1420  hypothetical protein  43.17 
 
 
461 aa  405  1e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  43.98 
 
 
479 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  42.19 
 
 
583 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  44.84 
 
 
578 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  45.89 
 
 
478 aa  389  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  42.35 
 
 
582 aa  383  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  43.63 
 
 
585 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  42.95 
 
 
481 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  43.63 
 
 
585 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  43.63 
 
 
585 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  43.63 
 
 
585 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  43.63 
 
 
585 aa  378  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  43.63 
 
 
585 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  41.23 
 
 
476 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  43.86 
 
 
483 aa  378  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  43.63 
 
 
585 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  43.63 
 
 
585 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  43.54 
 
 
585 aa  378  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  45.61 
 
 
480 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  44.82 
 
 
480 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  43.01 
 
 
481 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  43.22 
 
 
585 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  42.23 
 
 
584 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  43.22 
 
 
585 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  43.01 
 
 
471 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  44.87 
 
 
480 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  41.86 
 
 
585 aa  371  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  41.85 
 
 
482 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  42.26 
 
 
588 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0913  pyruvate kinase  42.32 
 
 
477 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00173367  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  40.13 
 
 
582 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  43.07 
 
 
585 aa  364  2e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  42.05 
 
 
583 aa  364  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  41.19 
 
 
597 aa  363  4e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  40.59 
 
 
586 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  41.2 
 
 
482 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2959  pyruvate kinase  41.67 
 
 
505 aa  362  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  42.53 
 
 
587 aa  362  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  42.07 
 
 
474 aa  361  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  42.41 
 
 
509 aa  360  5e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  41.19 
 
 
596 aa  359  6e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  41.45 
 
 
478 aa  359  7e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  41.81 
 
 
477 aa  358  9e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  39.92 
 
 
583 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  39.11 
 
 
580 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  40.67 
 
 
482 aa  357  2.9999999999999997e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  40.55 
 
 
596 aa  357  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  40.76 
 
 
596 aa  357  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  40.8 
 
 
581 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  39.96 
 
 
472 aa  356  5e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  40.38 
 
 
590 aa  356  5.999999999999999e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5699  pyruvate kinase  41.61 
 
 
493 aa  356  5.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14930  pyruvate kinase  39.79 
 
 
489 aa  355  1e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  42.35 
 
 
585 aa  354  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  40.59 
 
 
589 aa  354  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  41.4 
 
 
476 aa  354  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  42.35 
 
 
585 aa  354  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  40.42 
 
 
605 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2490  pyruvate kinase  42.28 
 
 
476 aa  353  2.9999999999999997e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  39.74 
 
 
472 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  42.83 
 
 
480 aa  353  4e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  40.97 
 
 
585 aa  353  5e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  41.77 
 
 
474 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  41.61 
 
 
471 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  41.31 
 
 
474 aa  352  8e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2535  pyruvate kinase  39.03 
 
 
471 aa  351  2e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0129939  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  42.86 
 
 
594 aa  351  2e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  42.05 
 
 
476 aa  350  4e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  41.01 
 
 
494 aa  349  5e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  40.13 
 
 
483 aa  349  6e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  40.5 
 
 
474 aa  349  6e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  40.42 
 
 
577 aa  348  9e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  40.34 
 
 
472 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  40.34 
 
 
472 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  41.4 
 
 
474 aa  348  1e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  40.93 
 
 
590 aa  347  2e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  41.1 
 
 
474 aa  347  2e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  39.16 
 
 
582 aa  348  2e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  39.62 
 
 
488 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  40.76 
 
 
477 aa  347  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  40.29 
 
 
474 aa  347  3e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1748  pyruvate kinase  40 
 
 
478 aa  347  4e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1688  pyruvate kinase  40 
 
 
478 aa  347  4e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  38.56 
 
 
485 aa  347  4e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  38.56 
 
 
485 aa  346  5e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1165  pyruvate kinase  40.04 
 
 
478 aa  345  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  40.89 
 
 
472 aa  345  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  39.33 
 
 
580 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  39.41 
 
 
471 aa  344  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  41.14 
 
 
600 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.252836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>