More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4063 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3378  pyruvate kinase  70.86 
 
 		 479 aa  713    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4063  pyruvate kinase  100 
 
 		 488 aa  1008    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1400  pyruvate kinase  51.67 
 
 		 470 aa  508  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1209  hypothetical protein  51.05 
 
 		 481 aa  497  1e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000430892 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1420  hypothetical protein  52.26 
 
 		 461 aa  492  9.999999999999999e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4190  pyruvate kinase  51.66 
 
 		 476 aa  488  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.85429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2321  pyruvate kinase  48.63 
 
 		 496 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1063  pyruvate kinase  48.65 
 
 		 488 aa  434  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.175798  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  46.19 
 
 		 479 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  46.32 
 
 		 481 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03130  pyruvate kinase  46.6 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0435027  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  45.68 
 
 		 481 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1141  pyruvate kinase  47.19 
 
 		 477 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  45.09 
 
 		 474 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  45.47 
 
 		 578 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  44.23 
 
 		 471 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  45.32 
 
 		 479 aa  402  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  44.86 
 
 		 585 aa  402  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  45 
 
 		 478 aa  402  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  46.61 
 
 		 480 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  42.53 
 
 		 583 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  44.33 
 
 		 584 aa  395  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  44.26 
 
 		 585 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  44.05 
 
 		 585 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  44.05 
 
 		 585 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  44.05 
 
 		 585 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  44.05 
 
 		 585 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  44.05 
 
 		 585 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  44.05 
 
 		 585 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  43.84 
 
 		 585 aa  393  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  44.05 
 
 		 585 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  44.26 
 
 		 585 aa  395  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  42.14 
 
 		 581 aa  390  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  43.96 
 
 		 585 aa  392  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  43 
 
 		 478 aa  389  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  43.84 
 
 		 509 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  42.56 
 
 		 583 aa  385  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  45.17 
 
 		 480 aa  385  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  41.93 
 
 		 580 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  43.36 
 
 		 588 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  43.12 
 
 		 587 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  41.26 
 
 		 582 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  41.56 
 
 		 482 aa  379  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  43.19 
 
 		 477 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  45.42 
 
 		 491 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  41.84 
 
 		 577 aa  378  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  45.4 
 
 		 480 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  42.26 
 
 		 472 aa  378  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  43.61 
 
 		 480 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2535  pyruvate kinase  41.93 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0129939  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  44.82 
 
 		 476 aa  372  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  39.92 
 
 		 580 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4234  pyruvate kinase  44.44 
 
 		 489 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  41.26 
 
 		 583 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0913  pyruvate kinase  43.22 
 
 		 477 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00173367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2490  pyruvate kinase  42.38 
 
 		 476 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  43.33 
 
 		 596 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  41.34 
 
 		 474 aa  369  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  42.32 
 
 		 585 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  41.32 
 
 		 485 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  40.42 
 
 		 476 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4367  pyruvate kinase  43.82 
 
 		 489 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4390  pyruvate kinase  43.82 
 
 		 489 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  43.33 
 
 		 596 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  44.71 
 
 		 485 aa  372  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  42.12 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  42.71 
 
 		 474 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  41.3 
 
 		 482 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  42.12 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  41.39 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  40.84 
 
 		 582 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1040  pyruvate kinase  42.77 
 
 		 480 aa  366  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  41.58 
 
 		 605 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  42.53 
 
 		 472 aa  365  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  41.51 
 
 		 482 aa  365  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  40.42 
 
 		 487 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  45.65 
 
 		 601 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  43.12 
 
 		 597 aa  364  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  44.37 
 
 		 478 aa  363  3e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  40.79 
 
 		 585 aa  363  5.0000000000000005e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  42.29 
 
 		 492 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  43.27 
 
 		 596 aa  363  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  40.84 
 
 		 471 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  40.84 
 
 		 471 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  42.29 
 
 		 492 aa  362  8e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  40.84 
 
 		 471 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  41.72 
 
 		 483 aa  360  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  41.46 
 
 		 590 aa  360  2e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  41.47 
 
 		 474 aa  361  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  40.67 
 
 		 476 aa  361  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  40.63 
 
 		 471 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  42 
 
 		 580 aa  360  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  41.39 
 
 		 471 aa  360  4e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  40.91 
 
 		 476 aa  359  5e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  41.18 
 
 		 471 aa  359  6e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  45.71 
 
 		 587 aa  359  6e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  42.2 
 
 		 594 aa  358  8e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  41.41 
 
 		 477 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  42.53 
 
 		 470 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  41 
 
 		 585 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>