More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9125 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9125  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  100 
 
 		 495 aa  1003    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.239655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  30.54 
 
 		 496 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  35.03 
 
 		 518 aa  227  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  30.06 
 
 		 494 aa  224  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  31.12 
 
 		 512 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1188  ABC transporter related  31.44 
 
 		 511 aa  219  8.999999999999998e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.909394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2984  ABC transporter related  34.02 
 
 		 509 aa  219  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.095171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  30.22 
 
 		 501 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  30.22 
 
 		 501 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  31.79 
 
 		 501 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  30.33 
 
 		 494 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  29.42 
 
 		 499 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  30.99 
 
 		 501 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  30.69 
 
 		 503 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3764  L-arabinose transporter ATP-binding protein  32.99 
 
 		 501 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.639409  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  30.6 
 
 		 525 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  32.85 
 
 		 514 aa  213  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  30.51 
 
 		 501 aa  213  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  30.51 
 
 		 495 aa  213  7e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  31.65 
 
 		 525 aa  212  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  30.78 
 
 		 500 aa  212  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  30.25 
 
 		 504 aa  212  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  29.28 
 
 		 494 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  29.28 
 
 		 494 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  30.36 
 
 		 501 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  29.28 
 
 		 494 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  29.13 
 
 		 496 aa  211  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  28.23 
 
 		 501 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  29.94 
 
 		 501 aa  211  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  29.08 
 
 		 494 aa  210  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  29.08 
 
 		 494 aa  210  5e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  28.85 
 
 		 496 aa  209  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  29.82 
 
 		 501 aa  210  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6460  ABC transporter related  32.79 
 
 		 516 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121658  normal  0.108747 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  31.82 
 
 		 503 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5973  ABC transporter related  32.99 
 
 		 516 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3476  L-arabinose transporter ATP-binding protein  32.41 
 
 		 501 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  29.03 
 
 		 494 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3048  ABC transporter related protein  29.35 
 
 		 513 aa  208  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182553  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  31.99 
 
 		 499 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  32.14 
 
 		 861 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3329  ABC transporter related  32.52 
 
 		 527 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  28.88 
 
 		 494 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  30.22 
 
 		 495 aa  207  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  31.89 
 
 		 510 aa  207  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  30.54 
 
 		 497 aa  206  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  30.72 
 
 		 501 aa  206  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  29.81 
 
 		 501 aa  206  8e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  32.8 
 
 		 521 aa  206  8e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  30.48 
 
 		 501 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 		 517 aa  205  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  29.52 
 
 		 500 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  30.83 
 
 		 504 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  31.29 
 
 		 505 aa  206  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  30.41 
 
 		 525 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  29.73 
 
 		 523 aa  205  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  31.01 
 
 		 503 aa  205  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2447  ABC transporter related protein  30.95 
 
 		 495 aa  205  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000548266  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0593  ABC sugar transporter, ATPase subunit  32.21 
 
 		 514 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  30.71 
 
 		 513 aa  204  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2913  ABC transporter related  31.87 
 
 		 514 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.762867  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  31.55 
 
 		 497 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  30.18 
 
 		 508 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  29.03 
 
 		 510 aa  204  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0860  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  31.95 
 
 		 514 aa  203  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  31.2 
 
 		 496 aa  203  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2284  ABC transporter related  30.74 
 
 		 494 aa  203  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  31.56 
 
 		 506 aa  203  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  30.17 
 
 		 501 aa  203  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  29.38 
 
 		 492 aa  203  7e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1060  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  30.47 
 
 		 506 aa  203  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0807  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  31.74 
 
 		 514 aa  203  7e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.41753  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  29.07 
 
 		 495 aa  202  9e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1676  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 849 aa  202  9e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.586191 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4600  ABC transporter related  31.82 
 
 		 513 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.911905 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  28.63 
 
 		 494 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  31.41 
 
 		 504 aa  202  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  30.6 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  30.25 
 
 		 505 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  30.86 
 
 		 501 aa  202  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  29.98 
 
 		 517 aa  201  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  31.59 
 
 		 517 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0667  ribose ABC transporter ATP-binding protein  30.13 
 
 		 461 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  31.36 
 
 		 516 aa  201  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  31.59 
 
 		 517 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  31.59 
 
 		 517 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  31.19 
 
 		 507 aa  201  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  30.46 
 
 		 499 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0156  ABC transporter related  31.42 
 
 		 517 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000343593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  29.72 
 
 		 501 aa  201  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  30.46 
 
 		 499 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3450  ABC transporter related protein  28.43 
 
 		 496 aa  200  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3093  ABC transporter related  30.37 
 
 		 501 aa  200  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.193565  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  31.51 
 
 		 517 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1194  ABC transporter-like protein  32.38 
 
 		 512 aa  200  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  29.59 
 
 		 513 aa  200  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  30.96 
 
 		 507 aa  200  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  31.2 
 
 		 519 aa  199  7e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  31.32 
 
 		 517 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  32.78 
 
 		 508 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>