More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5973 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6460  ABC transporter related  93.8 
 
 
516 aa  938    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121658  normal  0.108747 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5167  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  70.06 
 
 
517 aa  696    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5973  ABC transporter related  100 
 
 
516 aa  1022    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7217  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2995  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.52 
 
 
522 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2876  ABC transporter  56.86 
 
 
523 aa  558  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2759  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.14 
 
 
512 aa  548  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43610  ABC transporter  56.54 
 
 
516 aa  546  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00213135  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2994  ABC transporter related  56.14 
 
 
512 aa  548  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1027  ABC transporter related  55.28 
 
 
502 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.8293  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2366  ABC sugar (ribose) transporter, fused ATPase subunits  55.28 
 
 
502 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4172  ABC transporter related  50.31 
 
 
504 aa  503  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1425  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.73 
 
 
601 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148525  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0023  ABC transporter ATP-binding protein  46.75 
 
 
875 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0136  ribose transport ATP-binding protein RbsA  46.2 
 
 
605 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.155752  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0415  ribose transport ATP-binding protein rbsA  46.38 
 
 
605 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150209  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1512  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.38 
 
 
605 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1165  ribose transport ATP-binding protein RbsA  46.38 
 
 
605 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.20892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  43.2 
 
 
508 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  39.56 
 
 
501 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2723  ABC transporter related  44.74 
 
 
515 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  40.24 
 
 
496 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 
494 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 
494 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.71 
 
 
494 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.71 
 
 
494 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.51 
 
 
494 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 
494 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.71 
 
 
494 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  40.89 
 
 
497 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  41.8 
 
 
525 aa  380  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  42.22 
 
 
519 aa  381  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.51 
 
 
494 aa  378  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  42.2 
 
 
504 aa  378  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  36.44 
 
 
504 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  39.55 
 
 
496 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.12 
 
 
492 aa  374  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  39.1 
 
 
493 aa  373  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  39.55 
 
 
499 aa  375  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  40.12 
 
 
494 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  40.24 
 
 
505 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  40.24 
 
 
494 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  42.06 
 
 
498 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  38.99 
 
 
503 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  41.8 
 
 
499 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  43.09 
 
 
506 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.31 
 
 
501 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  38.31 
 
 
501 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  39.88 
 
 
522 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  40.33 
 
 
495 aa  371  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  38.29 
 
 
496 aa  372  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  39.33 
 
 
510 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  39.39 
 
 
500 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  39.96 
 
 
499 aa  372  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2884  ABC transporter-like protein  43.78 
 
 
502 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.913699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  40.64 
 
 
500 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  38.71 
 
 
497 aa  369  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  38.77 
 
 
510 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.57 
 
 
515 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  40 
 
 
506 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  39.71 
 
 
516 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  41.83 
 
 
525 aa  365  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  41.01 
 
 
514 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  40.4 
 
 
504 aa  365  1e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  41.26 
 
 
496 aa  365  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  40.04 
 
 
516 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  40.04 
 
 
516 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  37.45 
 
 
498 aa  365  1e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  39.64 
 
 
505 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  40.04 
 
 
516 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  44.38 
 
 
521 aa  364  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  40.04 
 
 
516 aa  365  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  40.24 
 
 
503 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  40.33 
 
 
492 aa  364  2e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  40.96 
 
 
516 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  38.19 
 
 
524 aa  365  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  40.37 
 
 
513 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  39.24 
 
 
507 aa  364  3e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  40 
 
 
501 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  41.68 
 
 
519 aa  363  4e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  37.98 
 
 
501 aa  363  4e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  40.49 
 
 
497 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  41.55 
 
 
497 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  40.16 
 
 
514 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  40.77 
 
 
500 aa  362  8e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  39.41 
 
 
508 aa  362  8e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.23 
 
 
517 aa  362  9e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  40 
 
 
513 aa  362  9e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.82 
 
 
522 aa  362  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0667  ribose ABC transporter ATP-binding protein  40.43 
 
 
461 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.85 
 
 
515 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  38.82 
 
 
861 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.7 
 
 
515 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.7 
 
 
515 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.82 
 
 
520 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0511877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0156  ABC transporter related  40.36 
 
 
517 aa  359  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000343593  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.44 
 
 
519 aa  359  6e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  39.8 
 
 
501 aa  359  6e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  39.76 
 
 
501 aa  359  7e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  40.12 
 
 
513 aa  359  7e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  39.76 
 
 
501 aa  359  7e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>