42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9044 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  598  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2422  conserved hypothetical membrane spanning protein  47.69 
 
 		 304 aa  248  7e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2494  hypothetical protein  47.57 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2717  hypothetical protein  47.57 
 
 		 303 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.237176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5382  hypothetical protein  50.72 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5683  hypothetical protein  53.09 
 
 		 304 aa  225  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3815  hypothetical protein  50.37 
 
 		 324 aa  219  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  49.82 
 
 		 303 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0213  hypothetical protein  50 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1885  hypothetical protein  55.35 
 
 		 323 aa  205  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3768  PhnA protein-like protein  49.27 
 
 		 308 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5652  hypothetical protein  50.86 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.180197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4457  hypothetical protein  50.86 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0396  hypothetical protein  49.63 
 
 		 303 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0365  hypothetical protein  49.63 
 
 		 303 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  31.41 
 
 		 339 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  30.99 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  32.37 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0532  hypothetical protein  30.22 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.198659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4803  hypothetical protein  32.88 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.966948  normal  0.102625 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  36.04 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4817  hypothetical protein  28.85 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426688 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4301  hypothetical protein  28.62 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11820  hypothetical protein  33.12 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3346  hypothetical protein  31.17 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2215  hypothetical protein  25.97 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0116  hypothetical protein  29.69 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.933022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0421  hypothetical protein  33.87 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.504733  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2600  hypothetical protein  29.25 
 
 		 251 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072147  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1263  hypothetical protein  29.9 
 
 		 244 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2693  hypothetical protein  28.3 
 
 		 251 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2985  hypothetical protein  34.43 
 
 		 274 aa  49.3  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.519696 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0594  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1043 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1218  hypothetical protein  31.14 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3591  hypothetical protein  38.1 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3826  hypothetical protein  35 
 
 		 274 aa  47  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4588  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1010 aa  47  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200354  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4338  hypothetical protein  24.5 
 
 		 342 aa  46.2  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569871 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1898  hypothetical protein  35.82 
 
 		 306 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.879581  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1753  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1007 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.428284 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1663  hypothetical protein  26.62 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.997156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3517  hypothetical protein  28.86 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28634  normal  0.638371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>