46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3815 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3815  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  632  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0213  hypothetical protein  98.76 
 
 
324 aa  624  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2717  hypothetical protein  57.61 
 
 
303 aa  293  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.237176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2494  hypothetical protein  57.61 
 
 
303 aa  293  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2422  conserved hypothetical membrane spanning protein  55.76 
 
 
304 aa  291  8e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1885  hypothetical protein  60.26 
 
 
323 aa  272  7e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5382  hypothetical protein  57.5 
 
 
300 aa  264  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  56.49 
 
 
303 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  50.37 
 
 
304 aa  243  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5652  hypothetical protein  58.63 
 
 
307 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.180197  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4457  hypothetical protein  58.63 
 
 
307 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5683  hypothetical protein  46.75 
 
 
304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167667  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0365  hypothetical protein  56.25 
 
 
303 aa  215  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0396  hypothetical protein  55.56 
 
 
303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3768  PhnA protein-like protein  43.88 
 
 
308 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  31.7 
 
 
339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  31.31 
 
 
339 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  31.53 
 
 
324 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  31.7 
 
 
328 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0532  hypothetical protein  33.33 
 
 
294 aa  95.9  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.198659  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4803  hypothetical protein  36.97 
 
 
233 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.966948  normal  0.102625 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11820  hypothetical protein  27.02 
 
 
369 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4301  hypothetical protein  31.13 
 
 
295 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1663  hypothetical protein  33.33 
 
 
298 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.997156 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3346  hypothetical protein  32.03 
 
 
211 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4817  hypothetical protein  33.08 
 
 
208 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426688 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1218  hypothetical protein  34.42 
 
 
360 aa  60.5  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1898  hypothetical protein  42.98 
 
 
306 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.879581  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1263  hypothetical protein  32.04 
 
 
244 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2985  hypothetical protein  35.04 
 
 
274 aa  56.6  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.519696 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2600  hypothetical protein  32.29 
 
 
251 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072147  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3517  hypothetical protein  35.03 
 
 
312 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28634  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2693  hypothetical protein  31.25 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3591  hypothetical protein  28.52 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1466  hypothetical protein  37.39 
 
 
303 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.390896  normal  0.161565 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0116  hypothetical protein  27.65 
 
 
321 aa  53.1  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.933022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0421  hypothetical protein  29.41 
 
 
211 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.504733  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3826  hypothetical protein  30.66 
 
 
274 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4338  hypothetical protein  33.11 
 
 
342 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0569871 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2215  hypothetical protein  29.69 
 
 
217 aa  48.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0588  hypothetical protein  26.76 
 
 
356 aa  46.2  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0594  hypothetical protein  25.97 
 
 
1043 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0870  hypothetical protein  27.01 
 
 
1040 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.185589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0135  membrane spanning protein, required for outer membrane integrity  26.09 
 
 
1038 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.96692  normal  0.0451268 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1753  hypothetical protein  23.56 
 
 
1007 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.428284 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4588  hypothetical protein  25.9 
 
 
1010 aa  42.7  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>