37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5382 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5382  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  565  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2422  conserved hypothetical membrane spanning protein  70.65 
 
 
304 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2717  hypothetical protein  71.74 
 
 
303 aa  363  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.237176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2494  hypothetical protein  71.74 
 
 
303 aa  363  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  72.91 
 
 
303 aa  354  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5652  hypothetical protein  75.09 
 
 
307 aa  329  4e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.180197  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4457  hypothetical protein  75.09 
 
 
307 aa  329  4e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0365  hypothetical protein  74.23 
 
 
303 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0396  hypothetical protein  73.54 
 
 
303 aa  298  6e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0213  hypothetical protein  57.86 
 
 
324 aa  256  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3815  hypothetical protein  57.5 
 
 
324 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  50.72 
 
 
304 aa  242  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5683  hypothetical protein  51.43 
 
 
304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167667  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1885  hypothetical protein  52.8 
 
 
323 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3768  PhnA protein-like protein  46.31 
 
 
308 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  29.78 
 
 
339 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  29.94 
 
 
339 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  34.78 
 
 
324 aa  89  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  29.07 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0532  hypothetical protein  31.47 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.198659  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4803  hypothetical protein  40.38 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.966948  normal  0.102625 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11820  hypothetical protein  40.54 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1218  hypothetical protein  29.41 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1263  hypothetical protein  34.95 
 
 
244 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3346  hypothetical protein  30.5 
 
 
211 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4301  hypothetical protein  36.28 
 
 
295 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2600  hypothetical protein  35.24 
 
 
251 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072147  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1898  hypothetical protein  39.85 
 
 
306 aa  52.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.879581  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4817  hypothetical protein  34.95 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426688 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2693  hypothetical protein  34.29 
 
 
251 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2985  hypothetical protein  30.07 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.519696 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3826  hypothetical protein  28.68 
 
 
274 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3591  hypothetical protein  32.14 
 
 
284 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3517  hypothetical protein  36.27 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28634  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2394  hypothetical protein  26.22 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0594  hypothetical protein  25.66 
 
 
1043 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1069  hypothetical protein  27.27 
 
 
1052 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.425237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>