13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1069 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0594  hypothetical protein  42.12 
 
 
1043 aa  814    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0870  hypothetical protein  52.81 
 
 
1040 aa  1066    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.185589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1069  hypothetical protein  100 
 
 
1052 aa  2120    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.425237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1753  hypothetical protein  41.79 
 
 
1007 aa  833    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.428284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4184  hypothetical protein  47.14 
 
 
1067 aa  890    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.485228 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4588  hypothetical protein  50.87 
 
 
1010 aa  992    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200354  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  25.44 
 
 
339 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  25.78 
 
 
339 aa  65.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4817  hypothetical protein  23.39 
 
 
208 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4457  hypothetical protein  26.39 
 
 
307 aa  48.1  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5652  hypothetical protein  26.39 
 
 
307 aa  48.1  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.180197  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  26.39 
 
 
303 aa  46.6  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11820  hypothetical protein  29.59 
 
 
369 aa  45.1  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>